RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483868.5

TPRA1-208, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene TPRA1, Length 1,720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1-208ENST00000483868 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.59■■■■■ 4.41
TPRA1-208ENST00000483868 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.58■■■■■ 4.41
TPRA1-208ENST00000483868 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
TPRA1-208ENST00000483868 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.54■■■■■ 4.4
TPRA1-208ENST00000483868 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
TPRA1-208ENST00000483868 FANCAO15360 1455 aa42.53■■■■■ 4.4
TPRA1-208ENST00000483868 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.53■■■■■ 4.4
TPRA1-208ENST00000483868 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.51■■■■■ 4.4
TPRA1-208ENST00000483868 MIA2Q96PC5 1412 aa42.48■■■■■ 4.39
TPRA1-208ENST00000483868 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.44■■■■■ 4.38
TPRA1-208ENST00000483868 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.42■■■■■ 4.38
TPRA1-208ENST00000483868 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.42■■■■■ 4.38
TPRA1-208ENST00000483868 AKNAQ7Z591 1439 aa42.41■■■■■ 4.38
TPRA1-208ENST00000483868 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.39■■■■■ 4.38
TPRA1-208ENST00000483868 NEO1Q92859 1461 aa42.39■■■■■ 4.38
TPRA1-208ENST00000483868 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
TPRA1-208ENST00000483868 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
TPRA1-208ENST00000483868 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.34■■■■■ 4.37
TPRA1-208ENST00000483868 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.34■■■■■ 4.37
TPRA1-208ENST00000483868 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
TPRA1-208ENST00000483868 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.32■■■■■ 4.37
TPRA1-208ENST00000483868 ADGRL1O94910 1474 aa42.32■■■■■ 4.37
TPRA1-208ENST00000483868 ABCC1P33527 1531 aa42.31■■■■■ 4.36
TPRA1-208ENST00000483868 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.29■■■■■ 4.36
TPRA1-208ENST00000483868 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.29■■■■■ 4.36
TPRA1-208ENST00000483868 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.25■■■■■ 4.35
TPRA1-208ENST00000483868 MBD5Q9P267 1494 aa42.24■■■■■ 4.35
TPRA1-208ENST00000483868 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
TPRA1-208ENST00000483868 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.23■■■■■ 4.35
TPRA1-208ENST00000483868 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.21■■■■■ 4.35
TPRA1-208ENST00000483868 RAPGEF3O95398 923 aa42.19■■■■■ 4.34
TPRA1-208ENST00000483868 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.17■■■■■ 4.342e-6■■■□□ 17.8
TPRA1-208ENST00000483868 AFAP1Q8N556 730 aa42.17■■■■■ 4.34
TPRA1-208ENST00000483868 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
TPRA1-208ENST00000483868 ITGAEP38570 1179 aa42.12■■■■■ 4.33
TPRA1-208ENST00000483868 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.11■■■■■ 4.33
TPRA1-208ENST00000483868 ABCC5O15440 1437 aa42.11■■■■■ 4.33
TPRA1-208ENST00000483868 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.1■■■■■ 4.33
TPRA1-208ENST00000483868 DAPK1P53355 1430 aa42.08■■■■■ 4.33
TPRA1-208ENST00000483868 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
TPRA1-208ENST00000483868 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.08■■■■■ 4.33
TPRA1-208ENST00000483868 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.07■■■■■ 4.33
TPRA1-208ENST00000483868 RICTORQ6R327 1708 aa42.07■■■■■ 4.33
TPRA1-208ENST00000483868 PTPRKQ15262 1439 aa42.06■■■■■ 4.32
TPRA1-208ENST00000483868 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.05■■■■■ 4.32
TPRA1-208ENST00000483868 KDM6BO15054 1643 aa42.03■■■■■ 4.32
TPRA1-208ENST00000483868 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.03■■■■■ 4.32
TPRA1-208ENST00000483868 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
TPRA1-208ENST00000483868 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.98■■■■■ 4.31
TPRA1-208ENST00000483868 KDM5CP41229 1560 aa41.98■■■■■ 4.31
TPRA1-208ENST00000483868 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.97■■■■■ 4.31
TPRA1-208ENST00000483868 TSPY4P0CV99 314 aa41.95■■■■■ 4.31
TPRA1-208ENST00000483868 TSPY10P0CW01 314 aa41.95■■■■■ 4.31
TPRA1-208ENST00000483868 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
TPRA1-208ENST00000483868 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.93■■■■■ 4.3
TPRA1-208ENST00000483868 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.89■■■■■ 4.3
TPRA1-208ENST00000483868 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.87■■■■■ 4.29
TPRA1-208ENST00000483868 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.86■■■■■ 4.29
TPRA1-208ENST00000483868 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.86■■■■■ 4.29
TPRA1-208ENST00000483868 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.86■■■■■ 4.29
TPRA1-208ENST00000483868 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
TPRA1-208ENST00000483868 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.85■■■■■ 4.29
TPRA1-208ENST00000483868 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.85■■■■■ 4.29
TPRA1-208ENST00000483868 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.84■■■■■ 4.29
TPRA1-208ENST00000483868 ATP7AQ04656 1500 aa41.84■■■■■ 4.29
TPRA1-208ENST00000483868 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.82■■■■■ 4.28
TPRA1-208ENST00000483868 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.81■■■■■ 4.28
TPRA1-208ENST00000483868 NCOA1Q15788 1441 aa41.77■■■■■ 4.28
TPRA1-208ENST00000483868 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.77■■■■■ 4.28
TPRA1-208ENST00000483868 ADGRL2O95490 1459 aa41.76■■■■■ 4.28
TPRA1-208ENST00000483868 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.74■■■■■ 4.27
TPRA1-208ENST00000483868 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.73■■■■■ 4.27
TPRA1-208ENST00000483868 ABCA6Q8N139 1617 aa41.73■■■■■ 4.27
TPRA1-208ENST00000483868 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.73■■■■■ 4.27
TPRA1-208ENST00000483868 ROCK1Q13464 1354 aa41.71■■■■■ 4.27
TPRA1-208ENST00000483868 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.71■■■■■ 4.27
TPRA1-208ENST00000483868 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.69■■■■■ 4.26
TPRA1-208ENST00000483868 PLXNC1O60486 1568 aa41.68■■■■■ 4.26
TPRA1-208ENST00000483868 KIF15Q9NS87 1388 aa41.68■■■■■ 4.26
TPRA1-208ENST00000483868 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.64■■■■■ 4.26
TPRA1-208ENST00000483868 NAIPQ13075 1403 aa41.6■■■■■ 4.25
TPRA1-208ENST00000483868 ATP10AO60312 1499 aa41.58■■■■■ 4.25
TPRA1-208ENST00000483868 HFM1A2PYH4 1435 aa41.58■■■■■ 4.25
TPRA1-208ENST00000483868 A2MP01023 1474 aa41.56■■■■■ 4.24
TPRA1-208ENST00000483868 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
TPRA1-208ENST00000483868 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.53■■■■■ 4.24
TPRA1-208ENST00000483868 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.52■■■■■ 4.24
TPRA1-208ENST00000483868 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.49■■■■■ 4.23
TPRA1-208ENST00000483868 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.49■■■■■ 4.23
TPRA1-208ENST00000483868 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.44■■■■■ 4.22
TPRA1-208ENST00000483868 REREQ9P2R6 1566 aa41.43■■■■■ 4.22
TPRA1-208ENST00000483868 ERBINQ96RT1 1412 aa41.43■■■■■ 4.22
TPRA1-208ENST00000483868 KIF3BO15066 747 aa41.38■■■■■ 4.22
TPRA1-208ENST00000483868 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.38■■■■■ 4.21
TPRA1-208ENST00000483868 AGLP35573 1532 aa41.32■■■■■ 4.21
TPRA1-208ENST00000483868 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
TPRA1-208ENST00000483868 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
TPRA1-208ENST00000483868 GGT6Q6P531 493 aa41.27■■■■■ 4.2
TPRA1-208ENST00000483868 MLECQ14165 292 aa41.26■■■■■ 4.2
TPRA1-208ENST00000483868 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.26■■■■■ 4.2
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