RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483670.5

PDCD4-208, Transcript of programmed cell death 4, human

TSL 5

Gene PDCD4, Length 774 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD4-208	ENST00000483670	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		40.81	■■■■■ 4.12
PDCD4-208	ENST00000483670	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		40.79	■■■■■ 4.12
PDCD4-208	ENST00000483670	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.77	■■■■■ 4.12
PDCD4-208	ENST00000483670	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.76	■■■■■ 4.11
PDCD4-208	ENST00000483670	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.75	■■■■■ 4.11
PDCD4-208	ENST00000483670	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PDCD4-208	ENST00000483670	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.71	■■■■■ 4.11
PDCD4-208	ENST00000483670	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.71	■■■■■ 4.11
PDCD4-208	ENST00000483670	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
PDCD4-208	ENST00000483670	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PDCD4-208	ENST00000483670	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PDCD4-208	ENST00000483670	APLP2	Q06481	763 aa		40.66	■■■■■ 4.1
PDCD4-208	ENST00000483670	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.66	■■■■■ 4.1
PDCD4-208	ENST00000483670	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.63	■■■■■ 4.1
PDCD4-208	ENST00000483670	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		40.6	■■■■■ 4.09
PDCD4-208	ENST00000483670	ABCC1	P33527	1531 aa		40.59	■■■■■ 4.09
PDCD4-208	ENST00000483670	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
PDCD4-208	ENST00000483670	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.58	■■■■■ 4.09
PDCD4-208	ENST00000483670	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PDCD4-208	ENST00000483670	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.53	■■■■■ 4.08
PDCD4-208	ENST00000483670	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.52	■■■■■ 4.08
PDCD4-208	ENST00000483670	KDM5C	P41229	1560 aa		40.5	■■■■■ 4.07
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
PDCD4-208	ENST00000483670	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		40.5	■■■■■ 4.07
PDCD4-208	ENST00000483670	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.48	■■■■■ 4.07
PDCD4-208	ENST00000483670	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
PDCD4-208	ENST00000483670	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.45	■■■■■ 4.07
PDCD4-208	ENST00000483670	AFAP1	Q8N556	730 aa		40.43	■■■■■ 4.06
PDCD4-208	ENST00000483670	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.42	■■■■■ 4.06
PDCD4-208	ENST00000483670	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	40.41	■■■■■ 4.06
PDCD4-208	ENST00000483670	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.4	■■■■■ 4.06
PDCD4-208	ENST00000483670	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.4	■■■■■ 4.06
PDCD4-208	ENST00000483670	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.39	■■■■■ 4.06
PDCD4-208	ENST00000483670	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		40.38	■■■■■ 4.05
PDCD4-208	ENST00000483670	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		40.37	■■■■■ 4.05
PDCD4-208	ENST00000483670	ATP10A	O60312	1499 aa		40.32	■■■■■ 4.04
PDCD4-208	ENST00000483670	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.31	■■■■■ 4.04
PDCD4-208	ENST00000483670	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PDCD4-208	ENST00000483670	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.28	■■■■■ 4.04
PDCD4-208	ENST00000483670	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PDCD4-208	ENST00000483670	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PDCD4-208	ENST00000483670	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
PDCD4-208	ENST00000483670	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.26	■■■■■ 4.04
PDCD4-208	ENST00000483670	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
PDCD4-208	ENST00000483670	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PDCD4-208	ENST00000483670	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PDCD4-208	ENST00000483670	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.23	■■■■■ 4.03
PDCD4-208	ENST00000483670	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.23	■■■■■ 4.03
PDCD4-208	ENST00000483670	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
PDCD4-208	ENST00000483670	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PDCD4-208	ENST00000483670	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PDCD4-208	ENST00000483670	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PDCD4-208	ENST00000483670	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
PDCD4-208	ENST00000483670	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PDCD4-208	ENST00000483670	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PDCD4-208	ENST00000483670	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PDCD4-208	ENST00000483670	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.14	■■■■■ 4.02
PDCD4-208	ENST00000483670	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PDCD4-208	ENST00000483670	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PDCD4-208	ENST00000483670	AGL	P35573	1532 aa		40.06	■■■■■ 4
PDCD4-208	ENST00000483670	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.03	■■■■■ 4
PDCD4-208	ENST00000483670	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.02	■■■■■ 4
PDCD4-208	ENST00000483670	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.01	■■■■■ 4
PDCD4-208	ENST00000483670	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.01	■■■■■ 4
PDCD4-208	ENST00000483670	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.01	■■■■■ 4
PDCD4-208	ENST00000483670	MADD	Q8WXG6	1647 aa		40	■■■■□ 3.99
PDCD4-208	ENST00000483670	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	39.96	■■■■□ 3.99
PDCD4-208	ENST00000483670	A2M	P01023	1474 aa		39.95	■■■■□ 3.99
PDCD4-208	ENST00000483670	PLXNC1	O60486	1568 aa		39.93	■■■■□ 3.98
PDCD4-208	ENST00000483670	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		39.93	■■■■□ 3.98
PDCD4-208	ENST00000483670	MLEC	Q14165	292 aa		39.93	■■■■□ 3.98
PDCD4-208	ENST00000483670	PTPRM	P28827	1452 aa		39.92	■■■■□ 3.98
PDCD4-208	ENST00000483670	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		39.92	■■■■□ 3.98
PDCD4-208	ENST00000483670	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	39.89	■■■■□ 3.98
PDCD4-208	ENST00000483670	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		39.84	■■■■□ 3.97
PDCD4-208	ENST00000483670	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	39.83	■■■■□ 3.97
PDCD4-208	ENST00000483670	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	39.83	■■■■□ 3.97
PDCD4-208	ENST00000483670	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		39.82	■■■■□ 3.96
PDCD4-208	ENST00000483670	ABCC5	O15440	1437 aa		39.78	■■■■□ 3.96
PDCD4-208	ENST00000483670	DAPK1	P53355	1430 aa		39.78	■■■■□ 3.96
PDCD4-208	ENST00000483670	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	39.76	■■■■□ 3.96
PDCD4-208	ENST00000483670	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		39.73	■■■■□ 3.95
PDCD4-208	ENST00000483670	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	39.71	■■■■□ 3.95
PDCD4-208	ENST00000483670	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		39.7	■■■■□ 3.95
PDCD4-208	ENST00000483670	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	39.68	■■■■□ 3.94
PDCD4-208	ENST00000483670	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		39.65	■■■■□ 3.94
PDCD4-208	ENST00000483670	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	39.62	■■■■□ 3.93
PDCD4-208	ENST00000483670	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	39.62	■■■■□ 3.93	1e-6	■□□□□ 9.9
PDCD4-208	ENST00000483670	MROH2A	A6NES4	1674 aa		39.62	■■■■□ 3.93
PDCD4-208	ENST00000483670	GGT6	Q6P531	493 aa		39.62	■■■■□ 3.93
PDCD4-208	ENST00000483670	KIF3B	O15066	747 aa		39.61	■■■■□ 3.93
PDCD4-208	ENST00000483670	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		39.6	■■■■□ 3.93
PDCD4-208	ENST00000483670	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		39.6	■■■■□ 3.93
PDCD4-208	ENST00000483670	KIF15	Q9NS87	1388 aa		39.59	■■■■□ 3.93
PDCD4-208	ENST00000483670	ADGRL2	O95490	1459 aa		39.56	■■■■□ 3.92
PDCD4-208	ENST00000483670	C3	P01024	1663 aa		39.54	■■■■□ 3.92
PDCD4-208	ENST00000483670	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		39.54	■■■■□ 3.92
PDCD4-208	ENST00000483670	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	39.53	■■■■□ 3.92
PDCD4-208	ENST00000483670	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	39.52	■■■■□ 3.92

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