RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482519.1

VAMP4-204, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene VAMP4, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-204ENST00000482519 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.36■■□□□ 1.81
VAMP4-204ENST00000482519 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.36■■□□□ 1.81
VAMP4-204ENST00000482519 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
VAMP4-204ENST00000482519 PREX2Q70Z35 1606 aa26.32■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.32■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.31■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.28■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.28■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.28■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 AFAP1Q8N556 730 aa26.27■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.27■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.27■■□□□ 1.8
VAMP4-204ENST00000482519 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.26■■□□□ 1.79
VAMP4-204ENST00000482519 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.26■■□□□ 1.79
VAMP4-204ENST00000482519 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
VAMP4-204ENST00000482519 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.24■■□□□ 1.79
VAMP4-204ENST00000482519 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.23■■□□□ 1.79
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.23■■□□□ 1.79
VAMP4-204ENST00000482519 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
VAMP4-204ENST00000482519 ABCC1P33527 1531 aa26.2■■□□□ 1.79
VAMP4-204ENST00000482519 TIAM1Q13009 1591 aa26.19■■□□□ 1.78
VAMP4-204ENST00000482519 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.19■■□□□ 1.78
VAMP4-204ENST00000482519 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.17■■□□□ 1.78
VAMP4-204ENST00000482519 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.17■■□□□ 1.78
VAMP4-204ENST00000482519 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.16■■□□□ 1.78
VAMP4-204ENST00000482519 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.15■■□□□ 1.78
VAMP4-204ENST00000482519 KDM5CP41229 1560 aa26.15■■□□□ 1.78
VAMP4-204ENST00000482519 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
VAMP4-204ENST00000482519 ATP10AO60312 1499 aa26.14■■□□□ 1.78
VAMP4-204ENST00000482519 MLECQ14165 292 aa26.13■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.12■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.12■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.12■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.12■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 NCOA2Q15596 1464 aa26.11■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.1■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.09■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 MADDQ8WXG6 1647 aa26.08■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 APLP2Q06481 763 aa26.08■■□□□ 1.77
VAMP4-204ENST00000482519 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.07■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.07■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.05■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 PTPRMP28827 1452 aa26.04■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.04■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 MAP3K1Q13233 1512 aa26.04■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 ABCA6Q8N139 1617 aa26.03■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.03■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
VAMP4-204ENST00000482519 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.01■■□□□ 1.75
VAMP4-204ENST00000482519 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.95■■□□□ 1.75
VAMP4-204ENST00000482519 ATP7AQ04656 1500 aa25.94■■□□□ 1.74
VAMP4-204ENST00000482519 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.94■■□□□ 1.74
VAMP4-204ENST00000482519 REREQ9P2R6 1566 aa25.93■■□□□ 1.74
VAMP4-204ENST00000482519 MBD5Q9P267 1494 aa25.92■■□□□ 1.74
VAMP4-204ENST00000482519 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
VAMP4-204ENST00000482519 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
VAMP4-204ENST00000482519 AGLP35573 1532 aa25.87■■□□□ 1.73
VAMP4-204ENST00000482519 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.87■■□□□ 1.73
VAMP4-204ENST00000482519 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.85■■□□□ 1.73
VAMP4-204ENST00000482519 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.84■■□□□ 1.73
VAMP4-204ENST00000482519 A2MP01023 1474 aa25.84■■□□□ 1.73
VAMP4-204ENST00000482519 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
VAMP4-204ENST00000482519 TSPY4P0CV99 314 aa25.81■■□□□ 1.72
VAMP4-204ENST00000482519 TSPY10P0CW01 314 aa25.81■■□□□ 1.72
VAMP4-204ENST00000482519 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.8■■□□□ 1.72
VAMP4-204ENST00000482519 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.8■■□□□ 1.72
VAMP4-204ENST00000482519 MIA2Q96PC5 1412 aa25.8■■□□□ 1.72
VAMP4-204ENST00000482519 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.79■■□□□ 1.72
VAMP4-204ENST00000482519 GGT6Q6P531 493 aa25.76■■□□□ 1.71
VAMP4-204ENST00000482519 PLXNC1O60486 1568 aa25.76■■□□□ 1.71
VAMP4-204ENST00000482519 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.72■■□□□ 1.71
VAMP4-204ENST00000482519 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
VAMP4-204ENST00000482519 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.71■■□□□ 1.71
VAMP4-204ENST00000482519 C3P01024 1663 aa25.69■■□□□ 1.7
VAMP4-204ENST00000482519 HSPA2P54652 639 aa25.69■■□□□ 1.7
VAMP4-204ENST00000482519 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.69■■□□□ 1.7
VAMP4-204ENST00000482519 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.69■■□□□ 1.7
VAMP4-204ENST00000482519 KIF3BO15066 747 aa25.68■■□□□ 1.7
VAMP4-204ENST00000482519 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
VAMP4-204ENST00000482519 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
VAMP4-204ENST00000482519 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.64■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 ZMYM3Q14202 1370 aa25.63■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.63■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 ABCC5O15440 1437 aa25.61■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 MROH2AA6NES4 1674 aa25.61■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.6■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 DAPK1P53355 1430 aa25.58■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.58■■□□□ 1.69
VAMP4-204ENST00000482519 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.58■■□□□ 1.68
VAMP4-204ENST00000482519 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.57■■□□□ 1.68
VAMP4-204ENST00000482519 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.57■■□□□ 1.68
VAMP4-204ENST00000482519 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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