RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482405.7

CD99-208, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), human

TSL 2

Gene CD99, Length 842 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD99-208	ENST00000482405	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CD99-208	ENST00000482405	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CD99-208	ENST00000482405	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CD99-208	ENST00000482405	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CD99-208	ENST00000482405	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
CD99-208	ENST00000482405	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CD99-208	ENST00000482405	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CD99-208	ENST00000482405	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CD99-208	ENST00000482405	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CD99-208	ENST00000482405	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CD99-208	ENST00000482405	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CD99-208	ENST00000482405	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CD99-208	ENST00000482405	ABCC1	P33527	1531 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CD99-208	ENST00000482405	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CD99-208	ENST00000482405	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.01	■■■□□ 2.88
CD99-208	ENST00000482405	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	KDM5C	P41229	1560 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
CD99-208	ENST00000482405	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CD99-208	ENST00000482405	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CD99-208	ENST00000482405	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CD99-208	ENST00000482405	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
CD99-208	ENST00000482405	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CD99-208	ENST00000482405	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CD99-208	ENST00000482405	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CD99-208	ENST00000482405	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CD99-208	ENST00000482405	APLP2	Q06481	763 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CD99-208	ENST00000482405	ATP10A	O60312	1499 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CD99-208	ENST00000482405	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.83	■■■□□ 2.85
CD99-208	ENST00000482405	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
CD99-208	ENST00000482405	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CD99-208	ENST00000482405	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CD99-208	ENST00000482405	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CD99-208	ENST00000482405	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
CD99-208	ENST00000482405	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CD99-208	ENST00000482405	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CD99-208	ENST00000482405	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
CD99-208	ENST00000482405	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.65	■■■□□ 2.82
CD99-208	ENST00000482405	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CD99-208	ENST00000482405	AGL	P35573	1532 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CD99-208	ENST00000482405	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CD99-208	ENST00000482405	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CD99-208	ENST00000482405	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CD99-208	ENST00000482405	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CD99-208	ENST00000482405	PTPRM	P28827	1452 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CD99-208	ENST00000482405	MLEC	Q14165	292 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CD99-208	ENST00000482405	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CD99-208	ENST00000482405	A2M	P01023	1474 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CD99-208	ENST00000482405	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CD99-208	ENST00000482405	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
CD99-208	ENST00000482405	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
CD99-208	ENST00000482405	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CD99-208	ENST00000482405	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CD99-208	ENST00000482405	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CD99-208	ENST00000482405	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CD99-208	ENST00000482405	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CD99-208	ENST00000482405	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CD99-208	ENST00000482405	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
CD99-208	ENST00000482405	ABCC5	O15440	1437 aa		32.38	■■■□□ 2.77
CD99-208	ENST00000482405	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.35	■■■□□ 2.77
CD99-208	ENST00000482405	DAPK1	P53355	1430 aa		32.33	■■■□□ 2.77
CD99-208	ENST00000482405	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
CD99-208	ENST00000482405	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.3	■■■□□ 2.76
CD99-208	ENST00000482405	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CD99-208	ENST00000482405	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.28	■■■□□ 2.76
CD99-208	ENST00000482405	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
CD99-208	ENST00000482405	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
CD99-208	ENST00000482405	GGT6	Q6P531	493 aa		32.25	■■■□□ 2.75
CD99-208	ENST00000482405	KIF3B	O15066	747 aa		32.23	■■■□□ 2.75
CD99-208	ENST00000482405	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
CD99-208	ENST00000482405	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CD99-208	ENST00000482405	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
CD99-208	ENST00000482405	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CD99-208	ENST00000482405	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CD99-208	ENST00000482405	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CD99-208	ENST00000482405	C3	P01024	1663 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CD99-208	ENST00000482405	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CD99-208	ENST00000482405	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CD99-208	ENST00000482405	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CD99-208	ENST00000482405	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
CD99-208	ENST00000482405	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.14	■■■□□ 2.74
CD99-208	ENST00000482405	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.14	■■■□□ 2.74

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