RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480099.1

PKDCC-206, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 787 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-206ENST00000480099 FANCAO15360 1455 aa25.21■■□□□ 1.63
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PKDCC-206ENST00000480099 NEO1Q92859 1461 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-206ENST00000480099 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
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PKDCC-206ENST00000480099 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-206ENST00000480099 AKNAQ7Z591 1439 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-206ENST00000480099 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-206ENST00000480099 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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PKDCC-206ENST00000480099 ADGRL1O94910 1474 aa25.09■■□□□ 1.61
PKDCC-206ENST00000480099 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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PKDCC-206ENST00000480099 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.03■■□□□ 1.6
PKDCC-206ENST00000480099 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-206ENST00000480099 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.02■■□□□ 1.6
PKDCC-206ENST00000480099 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.02■■□□□ 1.6
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PKDCC-206ENST00000480099 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.98■■□□□ 1.59
PKDCC-206ENST00000480099 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.95■■□□□ 1.58
PKDCC-206ENST00000480099 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.95■■□□□ 1.58
PKDCC-206ENST00000480099 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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PKDCC-206ENST00000480099 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.93■■□□□ 1.58
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PKDCC-206ENST00000480099 KDM5CP41229 1560 aa24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-206ENST00000480099 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.89■■□□□ 1.58
PKDCC-206ENST00000480099 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PKDCC-206ENST00000480099 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.88■■□□□ 1.57
PKDCC-206ENST00000480099 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.87■■□□□ 1.57
PKDCC-206ENST00000480099 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.87■■□□□ 1.57
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PKDCC-206ENST00000480099 MBD5Q9P267 1494 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-206ENST00000480099 AFAP1Q8N556 730 aa24.84■■□□□ 1.57
PKDCC-206ENST00000480099 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-206ENST00000480099 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.83■■□□□ 1.57
PKDCC-206ENST00000480099 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.82■■□□□ 1.56
PKDCC-206ENST00000480099 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PKDCC-206ENST00000480099 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.81■■□□□ 1.56
PKDCC-206ENST00000480099 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.81■■□□□ 1.56
PKDCC-206ENST00000480099 ATP7AQ04656 1500 aa24.8■■□□□ 1.56
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PKDCC-206ENST00000480099 DAPK1P53355 1430 aa24.76■■□□□ 1.55
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PKDCC-206ENST00000480099 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.73■■□□□ 1.55
PKDCC-206ENST00000480099 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.72■■□□□ 1.55
PKDCC-206ENST00000480099 ABCC5O15440 1437 aa24.72■■□□□ 1.55
PKDCC-206ENST00000480099 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.72■■□□□ 1.55
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PKDCC-206ENST00000480099 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.7■■□□□ 1.55
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PKDCC-206ENST00000480099 ATP10AO60312 1499 aa24.67■■□□□ 1.54
PKDCC-206ENST00000480099 REREQ9P2R6 1566 aa24.64■■□□□ 1.54
PKDCC-206ENST00000480099 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.63■■□□□ 1.53
PKDCC-206ENST00000480099 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.63■■□□□ 1.53
PKDCC-206ENST00000480099 A2MP01023 1474 aa24.6■■□□□ 1.53
PKDCC-206ENST00000480099 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.59■■□□□ 1.53
PKDCC-206ENST00000480099 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
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PKDCC-206ENST00000480099 AGLP35573 1532 aa24.52■■□□□ 1.52
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PKDCC-206ENST00000480099 ROCK1Q13464 1354 aa24.51■■□□□ 1.51
PKDCC-206ENST00000480099 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PKDCC-206ENST00000480099 ERBINQ96RT1 1412 aa24.47■■□□□ 1.51
PKDCC-206ENST00000480099 MLECQ14165 292 aa24.46■■□□□ 1.51
PKDCC-206ENST00000480099 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.44■■□□□ 1.5
PKDCC-206ENST00000480099 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PKDCC-206ENST00000480099 KIF3BO15066 747 aa24.43■■□□□ 1.5
PKDCC-206ENST00000480099 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PKDCC-206ENST00000480099 MADDQ8WXG6 1647 aa24.43■■□□□ 1.5
PKDCC-206ENST00000480099 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.42■■□□□ 1.5
PKDCC-206ENST00000480099 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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