RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479452.5

EXD3-208, Transcript of exonuclease 3'-5' domain containing 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene EXD3, Length 962 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXD3-208	ENST00000479452	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		33.7	■■■□□ 2.99
EXD3-208	ENST00000479452	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.69	■■■□□ 2.98
EXD3-208	ENST00000479452	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.66	■■■□□ 2.98
EXD3-208	ENST00000479452	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
EXD3-208	ENST00000479452	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.63	■■■□□ 2.97
EXD3-208	ENST00000479452	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.62	■■■□□ 2.97
EXD3-208	ENST00000479452	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.61	■■■□□ 2.97
EXD3-208	ENST00000479452	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.6	■■■□□ 2.97
EXD3-208	ENST00000479452	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
EXD3-208	ENST00000479452	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.58	■■■□□ 2.97
EXD3-208	ENST00000479452	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.57	■■■□□ 2.96
EXD3-208	ENST00000479452	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.56	■■■□□ 2.96
EXD3-208	ENST00000479452	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.55	■■■□□ 2.96
EXD3-208	ENST00000479452	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.54	■■■□□ 2.96
EXD3-208	ENST00000479452	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.52	■■■□□ 2.96
EXD3-208	ENST00000479452	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.51	■■■□□ 2.96
EXD3-208	ENST00000479452	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
EXD3-208	ENST00000479452	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.49	■■■□□ 2.95
EXD3-208	ENST00000479452	ATP10A	O60312	1499 aa		33.47	■■■□□ 2.95
EXD3-208	ENST00000479452	MLEC	Q14165	292 aa		33.46	■■■□□ 2.95
EXD3-208	ENST00000479452	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.45	■■■□□ 2.95
EXD3-208	ENST00000479452	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.44	■■■□□ 2.94
EXD3-208	ENST00000479452	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.43	■■■□□ 2.94
EXD3-208	ENST00000479452	APLP2	Q06481	763 aa		33.41	■■■□□ 2.94
EXD3-208	ENST00000479452	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.41	■■■□□ 2.94
EXD3-208	ENST00000479452	ABCC1	P33527	1531 aa		33.41	■■■□□ 2.94
EXD3-208	ENST00000479452	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.41	■■■□□ 2.94
EXD3-208	ENST00000479452	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.4	■■■□□ 2.94
EXD3-208	ENST00000479452	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.38	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	KDM5C	P41229	1560 aa		33.38	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.37	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.36	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	PTPRM	P28827	1452 aa		33.36	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.36	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.35	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.33	■■■□□ 2.93
EXD3-208	ENST00000479452	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.32	■■■□□ 2.92
EXD3-208	ENST00000479452	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.32	■■■□□ 2.92
EXD3-208	ENST00000479452	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.31	■■■□□ 2.92
EXD3-208	ENST00000479452	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
EXD3-208	ENST00000479452	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.3	■■■□□ 2.92
EXD3-208	ENST00000479452	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.29	■■■□□ 2.92
EXD3-208	ENST00000479452	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.29	■■■□□ 2.92
EXD3-208	ENST00000479452	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.27	■■■□□ 2.92
EXD3-208	ENST00000479452	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.26	■■■□□ 2.92
EXD3-208	ENST00000479452	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
EXD3-208	ENST00000479452	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
EXD3-208	ENST00000479452	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
EXD3-208	ENST00000479452	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.23	■■■□□ 2.91
EXD3-208	ENST00000479452	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EXD3-208	ENST00000479452	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.19	■■■□□ 2.9
EXD3-208	ENST00000479452	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.17	■■■□□ 2.9
EXD3-208	ENST00000479452	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
EXD3-208	ENST00000479452	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.16	■■■□□ 2.9
EXD3-208	ENST00000479452	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.14	■■■□□ 2.9
EXD3-208	ENST00000479452	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.11	■■■□□ 2.89
EXD3-208	ENST00000479452	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.11	■■■□□ 2.89
EXD3-208	ENST00000479452	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.11	■■■□□ 2.89
EXD3-208	ENST00000479452	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.11	■■■□□ 2.89
EXD3-208	ENST00000479452	AGL	P35573	1532 aa		33.1	■■■□□ 2.89
EXD3-208	ENST00000479452	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.1	■■■□□ 2.89
EXD3-208	ENST00000479452	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.08	■■■□□ 2.89
EXD3-208	ENST00000479452	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
EXD3-208	ENST00000479452	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.04	■■■□□ 2.88
EXD3-208	ENST00000479452	A2M	P01023	1474 aa		33.04	■■■□□ 2.88
EXD3-208	ENST00000479452	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.04	■■■□□ 2.88
EXD3-208	ENST00000479452	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.03	■■■□□ 2.88
EXD3-208	ENST00000479452	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.02	■■■□□ 2.88
EXD3-208	ENST00000479452	GGT6	Q6P531	493 aa		33.01	■■■□□ 2.87
EXD3-208	ENST00000479452	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33	■■■□□ 2.87
EXD3-208	ENST00000479452	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
EXD3-208	ENST00000479452	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.95	■■■□□ 2.87
EXD3-208	ENST00000479452	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
EXD3-208	ENST00000479452	HSPA2	P54652	639 aa		32.91	■■■□□ 2.86
EXD3-208	ENST00000479452	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.91	■■■□□ 2.86
EXD3-208	ENST00000479452	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.91	■■■□□ 2.86
EXD3-208	ENST00000479452	KIF3B	O15066	747 aa		32.89	■■■□□ 2.86
EXD3-208	ENST00000479452	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.88	■■■□□ 2.85
EXD3-208	ENST00000479452	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.85	■■■□□ 2.85
EXD3-208	ENST00000479452	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.85	■■■□□ 2.85
EXD3-208	ENST00000479452	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.84	■■■□□ 2.85
EXD3-208	ENST00000479452	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.8	■■■□□ 2.84
EXD3-208	ENST00000479452	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.77	■■■□□ 2.84
EXD3-208	ENST00000479452	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.75	■■■□□ 2.83
EXD3-208	ENST00000479452	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
EXD3-208	ENST00000479452	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.72	■■■□□ 2.83
EXD3-208	ENST00000479452	C3	P01024	1663 aa		32.72	■■■□□ 2.83
EXD3-208	ENST00000479452	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.7	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	NPAT	Q14207	1427 aa		32.69	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.69	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.69	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	ABCC5	O15440	1437 aa		32.68	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.67	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.66	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.66	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
EXD3-208	ENST00000479452	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.65	■■■□□ 2.82

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