RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.17□□□□□ -0.78
MITF-215ENST00000478490 CD109Q6YHK3 1445 aa10.17□□□□□ -0.78
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MITF-215ENST00000478490 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.13□□□□□ -0.79
MITF-215ENST00000478490 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.12□□□□□ -0.79
MITF-215ENST00000478490 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
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MITF-215ENST00000478490 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
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MITF-215ENST00000478490 SLC24A1O60721 1099 aa10.04□□□□□ -0.8
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MITF-215ENST00000478490 AKNAQ7Z591 1439 aa10□□□□□ -0.81
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MITF-215ENST00000478490 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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MITF-215ENST00000478490 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.94□□□□□ -0.82
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MITF-215ENST00000478490 SPDYE6P0CI01 402 aa9.9□□□□□ -0.82
MITF-215ENST00000478490 MLECQ14165 292 aa9.9□□□□□ -0.82
MITF-215ENST00000478490 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.9□□□□□ -0.82
MITF-215ENST00000478490 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MITF-215ENST00000478490 PTPRMP28827 1452 aa9.9□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.89□□□□□ -0.83
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MITF-215ENST00000478490 AFAP1Q8N556 730 aa9.88□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 CEP162Q5TB80 1403 aa9.88□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 ABCA6Q8N139 1617 aa9.87□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.87□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.86□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 ABCC1P33527 1531 aa9.86□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa9.86□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.85□□□□□ -0.83
MITF-215ENST00000478490 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.85□□□□□ -0.83
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MITF-215ENST00000478490 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.85□□□□□ -0.83
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MITF-215ENST00000478490 C9orf84Q5VXU9 1444 aa9.83□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.82□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.82□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 TIAM1Q13009 1591 aa9.81□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 PITPNM1O00562 1244 aa9.81□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 CCNB3Q8WWL7 1395 aa9.81□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa9.8□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 C3P01024 1663 aa9.79□□□□□ -0.84
MITF-215ENST00000478490 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
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MITF-215ENST00000478490 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.79□□□□□ -0.84
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