RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf3-215ENST00000478473 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.57■■■■□ 3.45
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C9orf3-215ENST00000478473 PTPRKQ15262 1439 aa36.54■■■■□ 3.44
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C9orf3-215ENST00000478473 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
C9orf3-215ENST00000478473 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
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