RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477612.5

COL9A3-211, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 635 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-211ENST00000477612 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.96■■■■□ 3.19
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COL9A3-211ENST00000477612 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.93■■■■□ 3.18
COL9A3-211ENST00000477612 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.93■■■■□ 3.18
COL9A3-211ENST00000477612 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.92■■■■□ 3.18
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COL9A3-211ENST00000477612 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.85■■■■□ 3.17
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COL9A3-211ENST00000477612 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.81■■■■□ 3.16
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COL9A3-211ENST00000477612 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.75■■■■□ 3.15
COL9A3-211ENST00000477612 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.75■■■■□ 3.15
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COL9A3-211ENST00000477612 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.74■■■■□ 3.15
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COL9A3-211ENST00000477612 AFAP1Q8N556 730 aa34.72■■■■□ 3.15
COL9A3-211ENST00000477612 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
COL9A3-211ENST00000477612 ATP10AO60312 1499 aa34.7■■■■□ 3.15
COL9A3-211ENST00000477612 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.69■■■■□ 3.14
COL9A3-211ENST00000477612 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.68■■■■□ 3.14
COL9A3-211ENST00000477612 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.68■■■■□ 3.14
COL9A3-211ENST00000477612 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.67■■■■□ 3.14
COL9A3-211ENST00000477612 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.66■■■■□ 3.14
COL9A3-211ENST00000477612 MADDQ8WXG6 1647 aa34.66■■■■□ 3.14
COL9A3-211ENST00000477612 TIAM1Q13009 1591 aa34.65■■■■□ 3.14
COL9A3-211ENST00000477612 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.64■■■■□ 3.14
COL9A3-211ENST00000477612 PTPRMP28827 1452 aa34.64■■■■□ 3.14
COL9A3-211ENST00000477612 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
COL9A3-211ENST00000477612 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.61■■■■□ 3.13
COL9A3-211ENST00000477612 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.6■■■■□ 3.13
COL9A3-211ENST00000477612 REREQ9P2R6 1566 aa34.59■■■■□ 3.13
COL9A3-211ENST00000477612 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.58■■■■□ 3.13
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COL9A3-211ENST00000477612 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
COL9A3-211ENST00000477612 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.58■■■■□ 3.13
COL9A3-211ENST00000477612 MAP3K1Q13233 1512 aa34.57■■■■□ 3.12
COL9A3-211ENST00000477612 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.56■■■■□ 3.12
COL9A3-211ENST00000477612 ABCA6Q8N139 1617 aa34.56■■■■□ 3.12
COL9A3-211ENST00000477612 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
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COL9A3-211ENST00000477612 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.5■■■■□ 3.11
COL9A3-211ENST00000477612 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.49■■■■□ 3.11
COL9A3-211ENST00000477612 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.49■■■■□ 3.11
COL9A3-211ENST00000477612 AGLP35573 1532 aa34.45■■■■□ 3.11
COL9A3-211ENST00000477612 MLECQ14165 292 aa34.43■■■■□ 3.1
COL9A3-211ENST00000477612 MBD5Q9P267 1494 aa34.42■■■■□ 3.1
COL9A3-211ENST00000477612 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
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COL9A3-211ENST00000477612 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
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COL9A3-211ENST00000477612 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.3■■■■□ 3.08
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COL9A3-211ENST00000477612 PLXNC1O60486 1568 aa34.28■■■■□ 3.08
COL9A3-211ENST00000477612 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.27■■■■□ 3.08
COL9A3-211ENST00000477612 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.25■■■■□ 3.07
COL9A3-211ENST00000477612 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.24■■■■□ 3.07
COL9A3-211ENST00000477612 A2MP01023 1474 aa34.24■■■■□ 3.07
COL9A3-211ENST00000477612 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.24■■■■□ 3.07
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COL9A3-211ENST00000477612 APLP2Q06481 763 aa34.22■■■■□ 3.07
COL9A3-211ENST00000477612 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
COL9A3-211ENST00000477612 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.21■■■■□ 3.07
COL9A3-211ENST00000477612 C3P01024 1663 aa34.16■■■■□ 3.06
COL9A3-211ENST00000477612 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.15■■■■□ 3.06
COL9A3-211ENST00000477612 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.14■■■■□ 3.06
COL9A3-211ENST00000477612 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
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COL9A3-211ENST00000477612 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.12■■■■□ 3.05
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COL9A3-211ENST00000477612 TSPY10P0CW01 314 aa34.08■■■■□ 3.05
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COL9A3-211ENST00000477612 HSPA2P54652 639 aa33.97■■■■□ 3.03
COL9A3-211ENST00000477612 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
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COL9A3-211ENST00000477612 NPATQ14207 1427 aa33.94■■■■□ 3.02
COL9A3-211ENST00000477612 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.93■■■■□ 3.02
COL9A3-211ENST00000477612 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.91■■■■□ 3.02
COL9A3-211ENST00000477612 KIF3BO15066 747 aa33.91■■■■□ 3.02
COL9A3-211ENST00000477612 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.89■■■■□ 3.02
COL9A3-211ENST00000477612 ABCC5O15440 1437 aa33.88■■■■□ 3.01
COL9A3-211ENST00000477612 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
COL9A3-211ENST00000477612 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
COL9A3-211ENST00000477612 PTPRKQ15262 1439 aa33.84■■■■□ 3.01
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