RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.64■□□□□ 0.9
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PREX2Q70Z35 1606 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NCOA2Q15596 1464 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLCH2O75038 1416 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MIA2Q96PC5 1412 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NEO1Q92859 1461 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ITGAEP38570 1179 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RAPGEF3O95398 923 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FANCAO15360 1455 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABCC1P33527 1531 aa20.43■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.41■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.4■□□□□ 0.86
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.39■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RICTORQ6R327 1708 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AKNAQ7Z591 1439 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MBD5Q9P267 1494 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KDM5CP41229 1560 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HFM1A2PYH4 1435 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PTPRMP28827 1452 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MADDQ8WXG6 1647 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ROCK1Q13464 1354 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DAPK1P53355 1430 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABCC5O15440 1437 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLXNC1O60486 1568 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TSPY4P0CV99 314 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TSPY10P0CW01 314 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PTPRKQ15262 1439 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NAIPQ13075 1403 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADGRL2O95490 1459 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ATP7AQ04656 1500 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABCA6Q8N139 1617 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MLECQ14165 292 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 REREQ9P2R6 1566 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms