RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473084.1

TOR1A-202, Transcript of torsin family 1 member A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TOR1A, Length 1,668 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1A-202ENST00000473084 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
TOR1A-202ENST00000473084 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
TOR1A-202ENST00000473084 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.36■■■□□ 2.45
TOR1A-202ENST00000473084 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
TOR1A-202ENST00000473084 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
TOR1A-202ENST00000473084 MIA2Q96PC5 1412 aa30.33■■■□□ 2.45
TOR1A-202ENST00000473084 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.31■■■□□ 2.44
TOR1A-202ENST00000473084 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
TOR1A-202ENST00000473084 FANCAO15360 1455 aa30.28■■■□□ 2.44
TOR1A-202ENST00000473084 TSPOAP1O95153 1857 aa30.28■■■□□ 2.44
TOR1A-202ENST00000473084 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.27■■■□□ 2.44
TOR1A-202ENST00000473084 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.27■■■□□ 2.44
TOR1A-202ENST00000473084 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.26■■■□□ 2.43
TOR1A-202ENST00000473084 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.26■■■□□ 2.43
TOR1A-202ENST00000473084 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TOR1A-202ENST00000473084 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TOR1A-202ENST00000473084 ITGAEP38570 1179 aa30.2■■■□□ 2.43
TOR1A-202ENST00000473084 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
TOR1A-202ENST00000473084 AKNAQ7Z591 1439 aa30.17■■■□□ 2.42
TOR1A-202ENST00000473084 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.17■■■□□ 2.42
TOR1A-202ENST00000473084 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.16■■■□□ 2.42
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TOR1A-202ENST00000473084 ADGRL1O94910 1474 aa30.14■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.12■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 NEO1Q92859 1461 aa30.12■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.12■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.1■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 MBD5Q9P267 1494 aa30.1■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.1■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.1■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.09■■■□□ 2.41
TOR1A-202ENST00000473084 ABCC5O15440 1437 aa30.07■■■□□ 2.4
TOR1A-202ENST00000473084 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.07■■■□□ 2.4
TOR1A-202ENST00000473084 DAPK1P53355 1430 aa30.06■■■□□ 2.4
TOR1A-202ENST00000473084 PTPRKQ15262 1439 aa30.06■■■□□ 2.4
TOR1A-202ENST00000473084 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
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TOR1A-202ENST00000473084 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.03■■■□□ 2.4
TOR1A-202ENST00000473084 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.02■■■□□ 2.4
TOR1A-202ENST00000473084 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.02■■■□□ 2.4
TOR1A-202ENST00000473084 RAPGEF3O95398 923 aa30.01■■■□□ 2.39
TOR1A-202ENST00000473084 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
TOR1A-202ENST00000473084 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.97■■■□□ 2.39
TOR1A-202ENST00000473084 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
TOR1A-202ENST00000473084 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.96■■■□□ 2.39
TOR1A-202ENST00000473084 TSPY4P0CV99 314 aa29.94■■■□□ 2.38
TOR1A-202ENST00000473084 TSPY10P0CW01 314 aa29.94■■■□□ 2.38
TOR1A-202ENST00000473084 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.94■■■□□ 2.38
TOR1A-202ENST00000473084 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.93■■■□□ 2.38
TOR1A-202ENST00000473084 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.93■■■□□ 2.38
TOR1A-202ENST00000473084 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.9■■■□□ 2.38
TOR1A-202ENST00000473084 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
TOR1A-202ENST00000473084 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.89■■■□□ 2.38
TOR1A-202ENST00000473084 RICTORQ6R327 1708 aa29.89■■■□□ 2.37
TOR1A-202ENST00000473084 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.88■■■□□ 2.37
TOR1A-202ENST00000473084 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.87■■■□□ 2.37
TOR1A-202ENST00000473084 KDM5CP41229 1560 aa29.86■■■□□ 2.37
TOR1A-202ENST00000473084 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.83■■■□□ 2.37
TOR1A-202ENST00000473084 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.83■■■□□ 2.37
TOR1A-202ENST00000473084 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 NCOA1Q15788 1441 aa29.81■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 ATP7AQ04656 1500 aa29.81■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 KDM6BO15054 1643 aa29.81■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 ADGRL2O95490 1459 aa29.81■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.81■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.8■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 ROCK1Q13464 1354 aa29.79■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.79■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.77■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.77■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.77■■■□□ 2.36
TOR1A-202ENST00000473084 KIF15Q9NS87 1388 aa29.76■■■□□ 2.35
TOR1A-202ENST00000473084 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.75■■■□□ 2.35
TOR1A-202ENST00000473084 NAIPQ13075 1403 aa29.75■■■□□ 2.35
TOR1A-202ENST00000473084 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.75■■■□□ 2.35
TOR1A-202ENST00000473084 HFM1A2PYH4 1435 aa29.74■■■□□ 2.35
TOR1A-202ENST00000473084 PLXNC1O60486 1568 aa29.73■■■□□ 2.35
TOR1A-202ENST00000473084 ABCA6Q8N139 1617 aa29.71■■■□□ 2.35
TOR1A-202ENST00000473084 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.69■■■□□ 2.34
TOR1A-202ENST00000473084 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.67■■■□□ 2.34
TOR1A-202ENST00000473084 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.66■■■□□ 2.34
TOR1A-202ENST00000473084 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.66■■■□□ 2.34
TOR1A-202ENST00000473084 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.65■■■□□ 2.34
TOR1A-202ENST00000473084 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.63■■■□□ 2.33
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TOR1A-202ENST00000473084 A2MP01023 1474 aa29.6■■■□□ 2.33
TOR1A-202ENST00000473084 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.6■■■□□ 2.33
TOR1A-202ENST00000473084 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
TOR1A-202ENST00000473084 ATP10AO60312 1499 aa29.56■■■□□ 2.32
TOR1A-202ENST00000473084 ERBINQ96RT1 1412 aa29.55■■■□□ 2.32
TOR1A-202ENST00000473084 KIF3BO15066 747 aa29.5■■■□□ 2.31
TOR1A-202ENST00000473084 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.49■■■□□ 2.31
TOR1A-202ENST00000473084 TRIM52Q96A61 297 aa29.47■■■□□ 2.31
TOR1A-202ENST00000473084 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.313e-7■■□□□ 13.1
TOR1A-202ENST00000473084 REREQ9P2R6 1566 aa29.44■■■□□ 2.3
TOR1A-202ENST00000473084 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TOR1A-202ENST00000473084 HRCP23327 699 aa29.42■■■□□ 2.3
TOR1A-202ENST00000473084 GGT6Q6P531 493 aa29.4■■■□□ 2.3
TOR1A-202ENST00000473084 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
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