RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471978.5

C9orf3-213, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-213ENST00000471978 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.65■■■■□ 3.46
C9orf3-213ENST00000471978 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.64■■■■□ 3.46
C9orf3-213ENST00000471978 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.64■■■■□ 3.46
C9orf3-213ENST00000471978 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.63■■■■□ 3.45
C9orf3-213ENST00000471978 PTPRMP28827 1452 aa36.62■■■■□ 3.45
C9orf3-213ENST00000471978 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.62■■■■□ 3.45
C9orf3-213ENST00000471978 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.6■■■■□ 3.45
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.58■■■■□ 3.45
C9orf3-213ENST00000471978 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.56■■■■□ 3.44
C9orf3-213ENST00000471978 MADDQ8WXG6 1647 aa36.56■■■■□ 3.44
C9orf3-213ENST00000471978 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.47■■■■□ 3.43
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.46■■■■□ 3.43
C9orf3-213ENST00000471978 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.45■■■■□ 3.43
C9orf3-213ENST00000471978 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
C9orf3-213ENST00000471978 AFAP1Q8N556 730 aa36.43■■■■□ 3.42
C9orf3-213ENST00000471978 ATP10AO60312 1499 aa36.43■■■■□ 3.42
C9orf3-213ENST00000471978 PREX2Q70Z35 1606 aa36.42■■■■□ 3.42
C9orf3-213ENST00000471978 MLECQ14165 292 aa36.4■■■■□ 3.42
C9orf3-213ENST00000471978 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.39■■■■□ 3.42
C9orf3-213ENST00000471978 KDM5CP41229 1560 aa36.38■■■■□ 3.41
C9orf3-213ENST00000471978 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.36■■■■□ 3.41
C9orf3-213ENST00000471978 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.33■■■■□ 3.41
C9orf3-213ENST00000471978 ABCC1P33527 1531 aa36.32■■■■□ 3.4
C9orf3-213ENST00000471978 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.31■■■■□ 3.4
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.3■■■■□ 3.4
C9orf3-213ENST00000471978 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.29■■■■□ 3.4
C9orf3-213ENST00000471978 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.26■■■■□ 3.4
C9orf3-213ENST00000471978 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.26■■■■□ 3.4
C9orf3-213ENST00000471978 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.26■■■■□ 3.4
C9orf3-213ENST00000471978 CEP162Q5TB80 1403 aa36.25■■■■□ 3.39
C9orf3-213ENST00000471978 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.24■■■■□ 3.39
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
C9orf3-213ENST00000471978 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.24■■■■□ 3.39
C9orf3-213ENST00000471978 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
C9orf3-213ENST00000471978 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.21■■■■□ 3.39
C9orf3-213ENST00000471978 ABCA6Q8N139 1617 aa36.19■■■■□ 3.38
C9orf3-213ENST00000471978 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
C9orf3-213ENST00000471978 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.17■■■■□ 3.38
C9orf3-213ENST00000471978 REREQ9P2R6 1566 aa36.17■■■■□ 3.38
C9orf3-213ENST00000471978 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.15■■■■□ 3.38
C9orf3-213ENST00000471978 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
C9orf3-213ENST00000471978 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.12■■■■□ 3.37
C9orf3-213ENST00000471978 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.11■■■■□ 3.376e-7■■■□□ 18.3
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C9orf3-213ENST00000471978 HSPA2P54652 639 aa36.07■■■■□ 3.36
C9orf3-213ENST00000471978 AGLP35573 1532 aa36.07■■■■□ 3.36
C9orf3-213ENST00000471978 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.07■■■■□ 3.36
C9orf3-213ENST00000471978 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
C9orf3-213ENST00000471978 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.06■■■■□ 3.36
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C9orf3-213ENST00000471978 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
C9orf3-213ENST00000471978 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.04■■■■□ 3.36
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C9orf3-213ENST00000471978 ATP7AQ04656 1500 aa35.94■■■■□ 3.34
C9orf3-213ENST00000471978 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
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C9orf3-213ENST00000471978 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
C9orf3-213ENST00000471978 C3P01024 1663 aa35.87■■■■□ 3.33
C9orf3-213ENST00000471978 NCOA2Q15596 1464 aa35.86■■■■□ 3.33
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C9orf3-213ENST00000471978 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
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C9orf3-213ENST00000471978 MBD5Q9P267 1494 aa35.85■■■■□ 3.33
C9orf3-213ENST00000471978 A2MP01023 1474 aa35.84■■■■□ 3.33
C9orf3-213ENST00000471978 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.83■■■■□ 3.33
C9orf3-213ENST00000471978 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
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C9orf3-213ENST00000471978 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.74■■■■□ 3.31
C9orf3-213ENST00000471978 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.74■■■■□ 3.31
C9orf3-213ENST00000471978 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.74■■■■□ 3.31
C9orf3-213ENST00000471978 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.73■■■■□ 3.31
C9orf3-213ENST00000471978 MROH2AA6NES4 1674 aa35.72■■■■□ 3.31
C9orf3-213ENST00000471978 GGT6Q6P531 493 aa35.71■■■■□ 3.31
C9orf3-213ENST00000471978 ZMYM3Q14202 1370 aa35.71■■■■□ 3.31
C9orf3-213ENST00000471978 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.7■■■■□ 3.31
C9orf3-213ENST00000471978 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.68■■■■□ 3.3
C9orf3-213ENST00000471978 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
C9orf3-213ENST00000471978 MAP3K1Q13233 1512 aa35.65■■■■□ 3.3
C9orf3-213ENST00000471978 NPATQ14207 1427 aa35.65■■■■□ 3.3
C9orf3-213ENST00000471978 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
C9orf3-213ENST00000471978 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.64■■■■□ 3.3
C9orf3-213ENST00000471978 STRCQ7RTU9 1775 aa35.64■■■■□ 3.3
C9orf3-213ENST00000471978 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
C9orf3-213ENST00000471978 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.62■■■■□ 3.29
C9orf3-213ENST00000471978 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.58■■■■□ 3.29
C9orf3-213ENST00000471978 TSPY4P0CV99 314 aa35.56■■■■□ 3.28
C9orf3-213ENST00000471978 TSPY10P0CW01 314 aa35.56■■■■□ 3.28
C9orf3-213ENST00000471978 CERKQ8TCT0 537 aa35.55■■■■□ 3.28
C9orf3-213ENST00000471978 KIF3BO15066 747 aa35.53■■■■□ 3.28
C9orf3-213ENST00000471978 PTPRKQ15262 1439 aa35.52■■■■□ 3.28
C9orf3-213ENST00000471978 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.49■■■■□ 3.27
C9orf3-213ENST00000471978 PTPRTO14522 1441 aa35.48■■■■□ 3.27
C9orf3-213ENST00000471978 NCOA1Q15788 1441 aa35.48■■■■□ 3.27
C9orf3-213ENST00000471978 APLP2Q06481 763 aa35.47■■■■□ 3.27
C9orf3-213ENST00000471978 MIA2Q96PC5 1412 aa35.47■■■■□ 3.27
C9orf3-213ENST00000471978 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.44■■■■□ 3.26
C9orf3-213ENST00000471978 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.44■■■■□ 3.26
C9orf3-213ENST00000471978 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.4■■■■□ 3.26
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