RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.45■■■□□ 2.62
SHQ1-206ENST00000471526 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.44■■■□□ 2.62
SHQ1-206ENST00000471526 MLECQ14165 292 aa31.44■■■□□ 2.62
SHQ1-206ENST00000471526 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.44■■■□□ 2.62
SHQ1-206ENST00000471526 CLIP1P30622 1438 aa31.43■■■□□ 2.62
SHQ1-206ENST00000471526 KIF14Q15058 1648 aa31.41■■■□□ 2.62
SHQ1-206ENST00000471526 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.36■■■□□ 2.61
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.35■■■□□ 2.61
SHQ1-206ENST00000471526 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.35■■■□□ 2.61
SHQ1-206ENST00000471526 AFAP1Q8N556 730 aa31.35■■■□□ 2.61
SHQ1-206ENST00000471526 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.35■■■□□ 2.61
SHQ1-206ENST00000471526 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
SHQ1-206ENST00000471526 ATP10AO60312 1499 aa31.32■■■□□ 2.6
SHQ1-206ENST00000471526 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.31■■■□□ 2.6
SHQ1-206ENST00000471526 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.3■■■□□ 2.6
SHQ1-206ENST00000471526 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.28■■■□□ 2.6
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.27■■■□□ 2.6
SHQ1-206ENST00000471526 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.27■■■□□ 2.6
SHQ1-206ENST00000471526 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.27■■■□□ 2.6
SHQ1-206ENST00000471526 HSPA2P54652 639 aa31.24■■■□□ 2.59
SHQ1-206ENST00000471526 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.18■■■□□ 2.58
SHQ1-206ENST00000471526 KDM5CP41229 1560 aa31.17■■■□□ 2.58
SHQ1-206ENST00000471526 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.16■■■□□ 2.58
SHQ1-206ENST00000471526 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.15■■■□□ 2.58
SHQ1-206ENST00000471526 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.14■■■□□ 2.58
SHQ1-206ENST00000471526 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.12■■■□□ 2.57
SHQ1-206ENST00000471526 PREX2Q70Z35 1606 aa31.12■■■□□ 2.57
SHQ1-206ENST00000471526 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.1■■■□□ 2.57
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO41Q8TF61 875 aa31.09■■■□□ 2.57
SHQ1-206ENST00000471526 ABCC1P33527 1531 aa31.08■■■□□ 2.57
SHQ1-206ENST00000471526 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.08■■■□□ 2.57
SHQ1-206ENST00000471526 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.56
SHQ1-206ENST00000471526 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
SHQ1-206ENST00000471526 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
SHQ1-206ENST00000471526 ABCA6Q8N139 1617 aa31.02■■■□□ 2.56
SHQ1-206ENST00000471526 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.01■■■□□ 2.56
SHQ1-206ENST00000471526 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
SHQ1-206ENST00000471526 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31■■■□□ 2.55
SHQ1-206ENST00000471526 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.99■■■□□ 2.55
SHQ1-206ENST00000471526 REREQ9P2R6 1566 aa30.99■■■□□ 2.55
SHQ1-206ENST00000471526 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.98■■■□□ 2.55
SHQ1-206ENST00000471526 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
SHQ1-206ENST00000471526 AGLP35573 1532 aa30.94■■■□□ 2.54
SHQ1-206ENST00000471526 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.94■■■□□ 2.54
SHQ1-206ENST00000471526 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.93■■■□□ 2.54
SHQ1-206ENST00000471526 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.92■■■□□ 2.54
SHQ1-206ENST00000471526 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.9■■■□□ 2.54
SHQ1-206ENST00000471526 CEP162Q5TB80 1403 aa30.88■■■□□ 2.53
SHQ1-206ENST00000471526 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.88■■■□□ 2.53
SHQ1-206ENST00000471526 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.87■■■□□ 2.53
SHQ1-206ENST00000471526 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.86■■■□□ 2.53
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
SHQ1-206ENST00000471526 CERKQ8TCT0 537 aa30.82■■■□□ 2.52
SHQ1-206ENST00000471526 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.81■■■□□ 2.52
SHQ1-206ENST00000471526 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.8■■■□□ 2.52
SHQ1-206ENST00000471526 ATP7AQ04656 1500 aa30.78■■■□□ 2.52
SHQ1-206ENST00000471526 C3P01024 1663 aa30.78■■■□□ 2.52
SHQ1-206ENST00000471526 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.77■■■□□ 2.52
SHQ1-206ENST00000471526 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
SHQ1-206ENST00000471526 GGT6Q6P531 493 aa30.75■■■□□ 2.51
SHQ1-206ENST00000471526 ZMYM3Q14202 1370 aa30.75■■■□□ 2.51
SHQ1-206ENST00000471526 A2MP01023 1474 aa30.75■■■□□ 2.51
SHQ1-206ENST00000471526 TIAM1Q13009 1591 aa30.74■■■□□ 2.51
SHQ1-206ENST00000471526 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.73■■■□□ 2.51
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SHQ1-206ENST00000471526 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
SHQ1-206ENST00000471526 MBD5Q9P267 1494 aa30.69■■■□□ 2.5
SHQ1-206ENST00000471526 STRCQ7RTU9 1775 aa30.67■■■□□ 2.5
SHQ1-206ENST00000471526 PLXNC1O60486 1568 aa30.65■■■□□ 2.5
SHQ1-206ENST00000471526 NPATQ14207 1427 aa30.64■■■□□ 2.49
SHQ1-206ENST00000471526 NCOA2Q15596 1464 aa30.63■■■□□ 2.49
SHQ1-206ENST00000471526 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.61■■■□□ 2.49
SHQ1-206ENST00000471526 PTPRTO14522 1441 aa30.61■■■□□ 2.49
SHQ1-206ENST00000471526 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.6■■■□□ 2.49
SHQ1-206ENST00000471526 MROH2AA6NES4 1674 aa30.59■■■□□ 2.49
SHQ1-206ENST00000471526 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
SHQ1-206ENST00000471526 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.57■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 NCOA1Q15788 1441 aa30.56■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 KIF3BO15066 747 aa30.55■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.55■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.55■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.55■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.54■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 PTPRKQ15262 1439 aa30.54■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.52■■■□□ 2.48
SHQ1-206ENST00000471526 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.51■■■□□ 2.47
SHQ1-206ENST00000471526 TSPY4P0CV99 314 aa30.5■■■□□ 2.47
SHQ1-206ENST00000471526 TSPY10P0CW01 314 aa30.5■■■□□ 2.47
SHQ1-206ENST00000471526 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.48■■■□□ 2.47
SHQ1-206ENST00000471526 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
SHQ1-206ENST00000471526 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
SHQ1-206ENST00000471526 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.43■■■□□ 2.46
SHQ1-206ENST00000471526 PKD2Q13563 968 aa30.42■■■□□ 2.46
SHQ1-206ENST00000471526 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.4■■■□□ 2.46
SHQ1-206ENST00000471526 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
SHQ1-206ENST00000471526 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.38■■■□□ 2.45
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