RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.58■■■□□ 2.65
CTPS1-206ENST00000470271 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.58■■■□□ 2.65
CTPS1-206ENST00000470271 PREX2Q70Z35 1606 aa31.58■■■□□ 2.65
CTPS1-206ENST00000470271 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.55■■■□□ 2.64
CTPS1-206ENST00000470271 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.55■■■□□ 2.64
CTPS1-206ENST00000470271 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.55■■■□□ 2.64
CTPS1-206ENST00000470271 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.52■■■□□ 2.64
CTPS1-206ENST00000470271 TIAM1Q13009 1591 aa31.51■■■□□ 2.63
CTPS1-206ENST00000470271 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
CTPS1-206ENST00000470271 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.49■■■□□ 2.63
CTPS1-206ENST00000470271 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.48■■■□□ 2.63
CTPS1-206ENST00000470271 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.44■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.44■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.43■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 ABCC1P33527 1531 aa31.42■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 MAP3K1Q13233 1512 aa31.42■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.4■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 AFAP1Q8N556 730 aa31.39■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.39■■■□□ 2.62
CTPS1-206ENST00000470271 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
CTPS1-206ENST00000470271 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.38■■■□□ 2.61
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.38■■■□□ 2.61
CTPS1-206ENST00000470271 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.37■■■□□ 2.61
CTPS1-206ENST00000470271 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.36■■■□□ 2.61
CTPS1-206ENST00000470271 KDM5CP41229 1560 aa31.36■■■□□ 2.61
CTPS1-206ENST00000470271 NCOA2Q15596 1464 aa31.36■■■□□ 2.61
CTPS1-206ENST00000470271 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.34■■■□□ 2.61
CTPS1-206ENST00000470271 APLP2Q06481 763 aa31.32■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.31■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.29■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.29■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.29■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.28■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.27■■■□□ 2.6
CTPS1-206ENST00000470271 ATP10AO60312 1499 aa31.26■■■□□ 2.59
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
CTPS1-206ENST00000470271 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.23■■■□□ 2.59
CTPS1-206ENST00000470271 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.22■■■□□ 2.59
CTPS1-206ENST00000470271 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.19■■■□□ 2.58
CTPS1-206ENST00000470271 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.19■■■□□ 2.58
CTPS1-206ENST00000470271 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.18■■■□□ 2.58
CTPS1-206ENST00000470271 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CTPS1-206ENST00000470271 ABCA6Q8N139 1617 aa31.16■■■□□ 2.58
CTPS1-206ENST00000470271 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.16■■■□□ 2.58
CTPS1-206ENST00000470271 MBD5Q9P267 1494 aa31.14■■■□□ 2.57
CTPS1-206ENST00000470271 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.13■■■□□ 2.57
CTPS1-206ENST00000470271 REREQ9P2R6 1566 aa31.11■■■□□ 2.57
CTPS1-206ENST00000470271 MADDQ8WXG6 1647 aa31.1■■■□□ 2.57
CTPS1-206ENST00000470271 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.1■■■□□ 2.57
CTPS1-206ENST00000470271 MLECQ14165 292 aa31.09■■■□□ 2.57
CTPS1-206ENST00000470271 ATP7AQ04656 1500 aa31.08■■■□□ 2.57
CTPS1-206ENST00000470271 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CTPS1-206ENST00000470271 MIA2Q96PC5 1412 aa31.07■■■□□ 2.56
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRMP28827 1452 aa31.06■■■□□ 2.56
CTPS1-206ENST00000470271 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.05■■■□□ 2.56
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.04■■■□□ 2.56
CTPS1-206ENST00000470271 AGLP35573 1532 aa31.02■■■□□ 2.56
CTPS1-206ENST00000470271 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF5Q12774 1597 aa31■■■□□ 2.55
CTPS1-206ENST00000470271 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.99■■■□□ 2.55
CTPS1-206ENST00000470271 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.97■■■□□ 2.55
CTPS1-206ENST00000470271 A2MP01023 1474 aa30.95■■■□□ 2.54
CTPS1-206ENST00000470271 TSPY4P0CV99 314 aa30.93■■■□□ 2.54
CTPS1-206ENST00000470271 TSPY10P0CW01 314 aa30.93■■■□□ 2.54
CTPS1-206ENST00000470271 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.92■■■□□ 2.54
CTPS1-206ENST00000470271 PLXNC1O60486 1568 aa30.91■■■□□ 2.54
CTPS1-206ENST00000470271 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.9■■■□□ 2.54
CTPS1-206ENST00000470271 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.9■■■□□ 2.54
CTPS1-206ENST00000470271 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.85■■■□□ 2.53
CTPS1-206ENST00000470271 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.83■■■□□ 2.53
CTPS1-206ENST00000470271 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CTPS1-206ENST00000470271 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CTPS1-206ENST00000470271 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CTPS1-206ENST00000470271 ABCC5O15440 1437 aa30.77■■■□□ 2.52
CTPS1-206ENST00000470271 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.76■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 GGT6Q6P531 493 aa30.76■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.74■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 DAPK1P53355 1430 aa30.73■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.73■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 KIF3BO15066 747 aa30.72■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.7■■■□□ 2.51
CTPS1-206ENST00000470271 C3P01024 1663 aa30.68■■■□□ 2.5
CTPS1-206ENST00000470271 MROH2AA6NES4 1674 aa30.66■■■□□ 2.5
CTPS1-206ENST00000470271 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.66■■■□□ 2.5
CTPS1-206ENST00000470271 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
CTPS1-206ENST00000470271 ZMYM3Q14202 1370 aa30.64■■■□□ 2.5
CTPS1-206ENST00000470271 KIF15Q9NS87 1388 aa30.63■■■□□ 2.49
CTPS1-206ENST00000470271 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.63■■■□□ 2.49
CTPS1-206ENST00000470271 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CTPS1-206ENST00000470271 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.61■■■□□ 2.49
CTPS1-206ENST00000470271 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.61■■■□□ 2.49
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