RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469403.1

AGRN-205, Transcript of agrin, human

TSL 3

Gene AGRN, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AGRN-205	ENST00000469403	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	40.97	■■■■■ 4.15
AGRN-205	ENST00000469403	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.97	■■■■■ 4.15
AGRN-205	ENST00000469403	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.97	■■■■■ 4.15
AGRN-205	ENST00000469403	NEO1	Q92859	1461 aa		40.96	■■■■■ 4.15
AGRN-205	ENST00000469403	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.96	■■■■■ 4.15
AGRN-205	ENST00000469403	FANCA	O15360	1455 aa		40.96	■■■■■ 4.15
AGRN-205	ENST00000469403	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.93	■■■■■ 4.14
AGRN-205	ENST00000469403	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.91	■■■■■ 4.14
AGRN-205	ENST00000469403	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
AGRN-205	ENST00000469403	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.84	■■■■■ 4.13
AGRN-205	ENST00000469403	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.82	■■■■■ 4.12
AGRN-205	ENST00000469403	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.81	■■■■■ 4.12
AGRN-205	ENST00000469403	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.77	■■■■■ 4.12
AGRN-205	ENST00000469403	ABCC1	P33527	1531 aa		40.76	■■■■■ 4.12
AGRN-205	ENST00000469403	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.74	■■■■■ 4.11
AGRN-205	ENST00000469403	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.74	■■■■■ 4.11
AGRN-205	ENST00000469403	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
AGRN-205	ENST00000469403	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.72	■■■■■ 4.11
AGRN-205	ENST00000469403	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.72	■■■■■ 4.11
AGRN-205	ENST00000469403	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.71	■■■■■ 4.11
AGRN-205	ENST00000469403	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.69	■■■■■ 4.11
AGRN-205	ENST00000469403	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.67	■■■■■ 4.1
AGRN-205	ENST00000469403	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.66	■■■■■ 4.1
AGRN-205	ENST00000469403	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.65	■■■■■ 4.1
AGRN-205	ENST00000469403	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
AGRN-205	ENST00000469403	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
AGRN-205	ENST00000469403	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.63	■■■■■ 4.1
AGRN-205	ENST00000469403	KDM6B	O15054	1643 aa		40.62	■■■■■ 4.09
AGRN-205	ENST00000469403	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.62	■■■■■ 4.09
AGRN-205	ENST00000469403	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.6	■■■■■ 4.09	6e-7	■■■■□ 24.4
AGRN-205	ENST00000469403	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.59	■■■■■ 4.09
AGRN-205	ENST00000469403	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.59	■■■■■ 4.09
AGRN-205	ENST00000469403	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		40.59	■■■■■ 4.09
AGRN-205	ENST00000469403	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.55	■■■■■ 4.08
AGRN-205	ENST00000469403	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		40.55	■■■■■ 4.08
AGRN-205	ENST00000469403	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.55	■■■■■ 4.08
AGRN-205	ENST00000469403	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.54	■■■■■ 4.08
AGRN-205	ENST00000469403	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.54	■■■■■ 4.08
AGRN-205	ENST00000469403	KDM5C	P41229	1560 aa		40.51	■■■■■ 4.08
AGRN-205	ENST00000469403	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.49	■■■■■ 4.07
AGRN-205	ENST00000469403	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.48	■■■■■ 4.07
AGRN-205	ENST00000469403	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.47	■■■■■ 4.07
AGRN-205	ENST00000469403	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
AGRN-205	ENST00000469403	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
AGRN-205	ENST00000469403	AFAP1	Q8N556	730 aa		40.44	■■■■■ 4.06
AGRN-205	ENST00000469403	ABCC5	O15440	1437 aa		40.41	■■■■■ 4.06
AGRN-205	ENST00000469403	DAPK1	P53355	1430 aa		40.4	■■■■■ 4.06
AGRN-205	ENST00000469403	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.39	■■■■■ 4.06
AGRN-205	ENST00000469403	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.39	■■■■■ 4.06
AGRN-205	ENST00000469403	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		40.38	■■■■■ 4.05
AGRN-205	ENST00000469403	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		40.37	■■■■■ 4.05
AGRN-205	ENST00000469403	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.36	■■■■■ 4.05
AGRN-205	ENST00000469403	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.35	■■■■■ 4.05
AGRN-205	ENST00000469403	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
AGRN-205	ENST00000469403	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.33	■■■■■ 4.05
AGRN-205	ENST00000469403	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.04
AGRN-205	ENST00000469403	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.31	■■■■■ 4.04
AGRN-205	ENST00000469403	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.31	■■■■■ 4.04
AGRN-205	ENST00000469403	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		40.3	■■■■■ 4.04
AGRN-205	ENST00000469403	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.3	■■■■■ 4.04
AGRN-205	ENST00000469403	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.29	■■■■■ 4.04
AGRN-205	ENST00000469403	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.27	■■■■■ 4.04
AGRN-205	ENST00000469403	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.24	■■■■■ 4.03
AGRN-205	ENST00000469403	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.21	■■■■■ 4.03
AGRN-205	ENST00000469403	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.19	■■■■■ 4.03
AGRN-205	ENST00000469403	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.19	■■■■■ 4.02
AGRN-205	ENST00000469403	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		40.19	■■■■■ 4.02
AGRN-205	ENST00000469403	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.18	■■■■■ 4.02
AGRN-205	ENST00000469403	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.17	■■■■■ 4.02
AGRN-205	ENST00000469403	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.17	■■■■■ 4.02
AGRN-205	ENST00000469403	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.13	■■■■■ 4.02
AGRN-205	ENST00000469403	ITGAE	P38570	1179 aa		40.12	■■■■■ 4.01
AGRN-205	ENST00000469403	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.12	■■■■■ 4.01
AGRN-205	ENST00000469403	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.12	■■■■■ 4.01
AGRN-205	ENST00000469403	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.11	■■■■■ 4.01
AGRN-205	ENST00000469403	ATP10A	O60312	1499 aa		40.11	■■■■■ 4.01
AGRN-205	ENST00000469403	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.1	■■■■■ 4.01
AGRN-205	ENST00000469403	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.08	■■■■■ 4.01
AGRN-205	ENST00000469403	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	40.04	■■■■■ 4
AGRN-205	ENST00000469403	A2M	P01023	1474 aa		40.01	■■■■■ 4
AGRN-205	ENST00000469403	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.01	■■■■■ 4
AGRN-205	ENST00000469403	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.01	■■■■□ 3.99
AGRN-205	ENST00000469403	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	39.98	■■■■□ 3.99
AGRN-205	ENST00000469403	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		39.96	■■■■□ 3.99
AGRN-205	ENST00000469403	AGL	P35573	1532 aa		39.95	■■■■□ 3.99
AGRN-205	ENST00000469403	HFM1	A2PYH4	1435 aa		39.91	■■■■□ 3.98
AGRN-205	ENST00000469403	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		39.91	■■■■□ 3.98
AGRN-205	ENST00000469403	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		39.9	■■■■□ 3.98
AGRN-205	ENST00000469403	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		39.89	■■■■□ 3.98
AGRN-205	ENST00000469403	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		39.89	■■■■□ 3.98
AGRN-205	ENST00000469403	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	39.88	■■■■□ 3.97
AGRN-205	ENST00000469403	NAIP	Q13075	1403 aa		39.88	■■■■□ 3.97
AGRN-205	ENST00000469403	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		39.84	■■■■□ 3.97
AGRN-205	ENST00000469403	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	39.74	■■■■□ 3.95
AGRN-205	ENST00000469403	KIF3B	O15066	747 aa		39.71	■■■■□ 3.95
AGRN-205	ENST00000469403	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		39.71	■■■■□ 3.95
AGRN-205	ENST00000469403	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	39.7	■■■■□ 3.95
AGRN-205	ENST00000469403	DEPDC5	O75140	1603 aa		39.7	■■■■□ 3.95
AGRN-205	ENST00000469403	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		39.65	■■■■□ 3.94
AGRN-205	ENST00000469403	UNC13B	O14795	1591 aa		39.63	■■■■□ 3.94

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 222.2 ms