RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRG-202ENST00000468576 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRG-202ENST00000468576 FAM205CA6NFA0 338 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRG-202ENST00000468576 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRG-202ENST00000468576 PPP1R37O75864 691 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRG-202ENST00000468576 KIF3CO14782 793 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRG-202ENST00000468576 RIMBP2O15034 1052 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRG-202ENST00000468576 C2orf72A6NCS6 295 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRG-202ENST00000468576 GPR153Q6NV75 609 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRG-202ENST00000468576 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRG-202ENST00000468576 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRG-202ENST00000468576 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRG-202ENST00000468576 ERBB3P21860 1342 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRG-202ENST00000468576 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRG-202ENST00000468576 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRG-202ENST00000468576 ARSIQ5FYB1 569 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRG-202ENST00000468576 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRG-202ENST00000468576 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
PTPRG-202ENST00000468576 MMRN1Q13201 1228 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRG-202ENST00000468576 TMC2Q8TDI7 906 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRG-202ENST00000468576 SLC34A2O95436 690 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRG-202ENST00000468576 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRG-202ENST00000468576 NUDT7P0C024 238 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRG-202ENST00000468576 FOXK1P85037 733 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-202ENST00000468576 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-202ENST00000468576 DSG2Q14126 1118 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-202ENST00000468576 PLPP6Q8IY26 295 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-202ENST00000468576 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-202ENST00000468576 LHX6Q9UPM6 363 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRG-202ENST00000468576 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTPRG-202ENST00000468576 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRG-202ENST00000468576 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRG-202ENST00000468576 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRG-202ENST00000468576 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRG-202ENST00000468576 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.06■□□□□ 0
PTPRG-202ENST00000468576 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.04■□□□□ -0
PTPRG-202ENST00000468576 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
PTPRG-202ENST00000468576 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRG-202ENST00000468576 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRG-202ENST00000468576 PBX2P40425 430 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRG-202ENST00000468576 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRG-202ENST00000468576 OXER1Q8TDS5 423 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRG-202ENST00000468576 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRG-202ENST00000468576 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRG-202ENST00000468576 PDE4AP27815 886 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRG-202ENST00000468576 TBC1D12O60347 775 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRG-202ENST00000468576 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
PTPRG-202ENST00000468576 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRG-202ENST00000468576 PTGER2P43116 358 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRG-202ENST00000468576 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRG-202ENST00000468576 ARHGAP33O14559 1287 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRG-202ENST00000468576 MFSD10Q14728 455 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRG-202ENST00000468576 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRG-202ENST00000468576 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRG-202ENST00000468576 PSEN2P49810 448 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRG-202ENST00000468576 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRG-202ENST00000468576 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRG-202ENST00000468576 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRG-202ENST00000468576 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRG-202ENST00000468576 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRG-202ENST00000468576 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRG-202ENST00000468576 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRG-202ENST00000468576 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRG-202ENST00000468576 EVI5O60447 810 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRG-202ENST00000468576 FOSBP53539 338 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRG-202ENST00000468576 TK2O00142 265 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRG-202ENST00000468576 HRO43593 1189 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-202ENST00000468576 KCNK17Q96T54 332 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRG-202ENST00000468576 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRG-202ENST00000468576 MAP3K9P80192 1104 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-202ENST00000468576 JPH4Q96JJ6 628 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-202ENST00000468576 CAMK2BQ13554 666 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRG-202ENST00000468576 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRG-202ENST00000468576 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRG-202ENST00000468576 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-202ENST00000468576 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-202ENST00000468576 KCNH8Q96L42 1107 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-202ENST00000468576 PTPREP23469 700 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRG-202ENST00000468576 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRG-202ENST00000468576 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRG-202ENST00000468576 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRG-202ENST00000468576 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRG-202ENST00000468576 DPYSL4O14531 572 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRG-202ENST00000468576 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRG-202ENST00000468576 HCSTQ9UBK5 93 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRG-202ENST00000468576 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRG-202ENST00000468576 PHF14O94880 888 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRG-202ENST00000468576 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRG-202ENST00000468576 CFAP44Q96MT7 982 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRG-202ENST00000468576 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRG-202ENST00000468576 STAC3Q96MF2 364 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRG-202ENST00000468576 COL9A1P20849 921 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRG-202ENST00000468576 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRG-202ENST00000468576 FBXW7Q969H0 707 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRG-202ENST00000468576 PROX2Q3B8N5 592 aa14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms