RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468532.5

CHKB-205, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 5

Gene CHKB, Length 1,052 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-205ENST00000468532 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa49.75■■■■■ 5.55
CHKB-205ENST00000468532 PREX2Q70Z35 1606 aa49.74■■■■■ 5.55
CHKB-205ENST00000468532 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa49.7■■■■■ 5.55
CHKB-205ENST00000468532 POGZQ7Z3K3 1410 aa49.7■■■■■ 5.55
CHKB-205ENST00000468532 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa49.69■■■■■ 5.54
CHKB-205ENST00000468532 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa49.66■■■■■ 5.54
CHKB-205ENST00000468532 MTUS2Q5JR59 1369 aa49.65■■■■■ 5.54
CHKB-205ENST00000468532 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa49.59■■■■■ 5.53
CHKB-205ENST00000468532 VPS8Q8N3P4 1428 aa49.58■■■■■ 5.53
CHKB-205ENST00000468532 MAGI2Q86UL8 1455 aa49.57■■■■■ 5.53
CHKB-205ENST00000468532 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa49.55■■■■■ 5.52
CHKB-205ENST00000468532 YEATS2Q9ULM3 1422 aa49.53■■■■■ 5.52
CHKB-205ENST00000468532 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa49.51■■■■■ 5.52
CHKB-205ENST00000468532 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP49.5■■■■■ 5.52
CHKB-205ENST00000468532 ABCC1P33527 1531 aa49.5■■■■■ 5.51
CHKB-205ENST00000468532 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP49.47■■■■■ 5.51
CHKB-205ENST00000468532 CCNB3Q8WWL7 1395 aa49.44■■■■■ 5.51
CHKB-205ENST00000468532 ITSN2Q9NZM3 1697 aa49.44■■■■■ 5.5
CHKB-205ENST00000468532 KDM5CP41229 1560 aa49.44■■■■■ 5.5
CHKB-205ENST00000468532 TIAM1Q13009 1591 aa49.42■■■■■ 5.5
CHKB-205ENST00000468532 AFAP1Q8N556 730 aa49.42■■■■■ 5.5
CHKB-205ENST00000468532 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa49.42■■■■■ 5.5
CHKB-205ENST00000468532 BCORL1Q5H9F3 1711 aa49.4■■■■■ 5.5
CHKB-205ENST00000468532 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP49.4■■■■■ 5.5
CHKB-205ENST00000468532 ADAMTSL3P82987 1691 aa49.39■■■■■ 5.5
CHKB-205ENST00000468532 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa49.38■■■■■ 5.5
CHKB-205ENST00000468532 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa49.35■■■■■ 5.49
CHKB-205ENST00000468532 HECW2Q9P2P5 1572 aa49.34■■■■■ 5.49
CHKB-205ENST00000468532 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP49.34■■■■■ 5.49
CHKB-205ENST00000468532 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa49.34■■■■■ 5.49
CHKB-205ENST00000468532 ATP10AO60312 1499 aa49.3■■■■■ 5.48
CHKB-205ENST00000468532 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP49.29■■■■■ 5.48
CHKB-205ENST00000468532 MYT1LQ9UL68 1186 aa49.29■■■■■ 5.48
CHKB-205ENST00000468532 SYCP2Q9BX26 1530 aa49.28■■■■■ 5.48
CHKB-205ENST00000468532 C9orf84Q5VXU9 1444 aa49.26■■■■■ 5.48
CHKB-205ENST00000468532 MLH3Q9UHC1 1453 aa49.25■■■■■ 5.47
CHKB-205ENST00000468532 MADDQ8WXG6 1647 aa49.24■■■■■ 5.47
CHKB-205ENST00000468532 NCOA2Q15596 1464 aa49.23■■■■■ 5.47
CHKB-205ENST00000468532 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa49.21■■■■■ 5.47
CHKB-205ENST00000468532 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa49.2■■■■■ 5.47
CHKB-205ENST00000468532 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa49.19■■■■■ 5.47
CHKB-205ENST00000468532 ABCA6Q8N139 1617 aa49.18■■■■■ 5.46
CHKB-205ENST00000468532 MAP3K1Q13233 1512 aa49.18■■■■■ 5.46
CHKB-205ENST00000468532 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP49.17■■■■■ 5.46
CHKB-205ENST00000468532 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa49.17■■■■■ 5.46
CHKB-205ENST00000468532 PTPRMP28827 1452 aa49.16■■■■■ 5.46
CHKB-205ENST00000468532 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa49.13■■■■■ 5.46
CHKB-205ENST00000468532 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
CHKB-205ENST00000468532 MLECQ14165 292 aa49.1■■■■■ 5.45
CHKB-205ENST00000468532 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP49.08■■■■■ 5.45
CHKB-205ENST00000468532 REREQ9P2R6 1566 aa49.07■■■■■ 5.45
CHKB-205ENST00000468532 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP49.05■■■■■ 5.44
CHKB-205ENST00000468532 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
CHKB-205ENST00000468532 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa49■■■■■ 5.44
CHKB-205ENST00000468532 APLP2Q06481 763 aa48.97■■■■■ 5.43
CHKB-205ENST00000468532 ATP7AQ04656 1500 aa48.96■■■■■ 5.43
CHKB-205ENST00000468532 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP48.95■■■■■ 5.43
CHKB-205ENST00000468532 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa48.94■■■■■ 5.43
CHKB-205ENST00000468532 MBD5Q9P267 1494 aa48.94■■■■■ 5.43
CHKB-205ENST00000468532 AGLP35573 1532 aa48.9■■■■■ 5.42
CHKB-205ENST00000468532 PLPPR3Q6T4P5 718 aa48.81■■■■■ 5.4
CHKB-205ENST00000468532 CCDC141Q6ZP82 1450 aa48.8■■■■■ 5.4
CHKB-205ENST00000468532 MYOM3Q5VTT5 1437 aa48.77■■■■■ 5.4
CHKB-205ENST00000468532 A2MP01023 1474 aa48.74■■■■■ 5.39
CHKB-205ENST00000468532 ADGBQ8N7X0 1667 aa48.72■■■■■ 5.39
CHKB-205ENST00000468532 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa48.72■■■■■ 5.39
CHKB-205ENST00000468532 PLXNC1O60486 1568 aa48.72■■■■■ 5.39
CHKB-205ENST00000468532 ARHGEF5Q12774 1597 aa48.72■■■■■ 5.39
CHKB-205ENST00000468532 RSPH4AQ5TD94 716 aa48.71■■■■■ 5.39
CHKB-205ENST00000468532 MIA2Q96PC5 1412 aa48.7■■■■■ 5.39
CHKB-205ENST00000468532 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
CHKB-205ENST00000468532 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP48.58■■■■■ 5.37
CHKB-205ENST00000468532 LMTK3Q96Q04 1460 aa48.57■■■■■ 5.37
CHKB-205ENST00000468532 TSPY4P0CV99 314 aa48.55■■■■■ 5.36
CHKB-205ENST00000468532 TSPY10P0CW01 314 aa48.55■■■■■ 5.36
CHKB-205ENST00000468532 C3P01024 1663 aa48.51■■■■■ 5.36
CHKB-205ENST00000468532 CNTLNQ9NXG0 1405 aa48.5■■■■■ 5.36
CHKB-205ENST00000468532 PTPN23Q9H3S7 1636 aa48.5■■■■■ 5.35
CHKB-205ENST00000468532 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.35
CHKB-205ENST00000468532 MAST1Q9Y2H9 1570 aa48.47■■■■■ 5.35
CHKB-205ENST00000468532 FGD6Q6ZV73 1430 aa48.44■■■■■ 5.35
CHKB-205ENST00000468532 GGT6Q6P531 493 aa48.44■■■■■ 5.34
CHKB-205ENST00000468532 MROH2AA6NES4 1674 aa48.41■■■■■ 5.34
CHKB-205ENST00000468532 PREX1Q8TCU6 1659 aa48.41■■■■■ 5.34
CHKB-205ENST00000468532 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
CHKB-205ENST00000468532 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
CHKB-205ENST00000468532 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
CHKB-205ENST00000468532 HSPA2P54652 639 aa48.33■■■■■ 5.33
CHKB-205ENST00000468532 CROCC2H7BZ55 1655 aa48.32■■■■■ 5.33
CHKB-205ENST00000468532 KIF3BO15066 747 aa48.32■■■■■ 5.33
CHKB-205ENST00000468532 ZMYM3Q14202 1370 aa48.29■■■■■ 5.32
CHKB-205ENST00000468532 ABCC5O15440 1437 aa48.29■■■■■ 5.32
CHKB-205ENST00000468532 PPP6R1Q9UPN7 881 aa48.28■■■■■ 5.32
CHKB-205ENST00000468532 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
CHKB-205ENST00000468532 SHANK2Q9UPX8 1470 aa48.26■■■■■ 5.32
CHKB-205ENST00000468532 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa48.25■■■■■ 5.32
CHKB-205ENST00000468532 DAPK1P53355 1430 aa48.24■■■■■ 5.31
CHKB-205ENST00000468532 NPATQ14207 1427 aa48.17■■■■■ 5.3
CHKB-205ENST00000468532 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP48.14■■■■■ 5.3
CHKB-205ENST00000468532 KDM5DQ9BY66 1539 aa48.13■■■■■ 5.3
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