RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, humanhuman

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZ-208ENST00000468310 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.98■■■■□ 3.19
PRKCZ-208ENST00000468310 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.98■■■■□ 3.19
PRKCZ-208ENST00000468310 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.98■■■■□ 3.19
PRKCZ-208ENST00000468310 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.96■■■■□ 3.19
PRKCZ-208ENST00000468310 PTPRMP28827 1452 aa34.94■■■■□ 3.18
PRKCZ-208ENST00000468310 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.94■■■■□ 3.18
PRKCZ-208ENST00000468310 MADDQ8WXG6 1647 aa34.93■■■■□ 3.18
PRKCZ-208ENST00000468310 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.93■■■■□ 3.18
PRKCZ-208ENST00000468310 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.91■■■■□ 3.18
PRKCZ-208ENST00000468310 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.9■■■■□ 3.18
PRKCZ-208ENST00000468310 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.84■■■■□ 3.17
PRKCZ-208ENST00000468310 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
PRKCZ-208ENST00000468310 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.84■■■■□ 3.17
PRKCZ-208ENST00000468310 PREX2Q70Z35 1606 aa34.81■■■■□ 3.16
PRKCZ-208ENST00000468310 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.8■■■■□ 3.16
PRKCZ-208ENST00000468310 ATP10AO60312 1499 aa34.76■■■■□ 3.15
PRKCZ-208ENST00000468310 MLECQ14165 292 aa34.73■■■■□ 3.15
PRKCZ-208ENST00000468310 AFAP1Q8N556 730 aa34.73■■■■□ 3.15
PRKCZ-208ENST00000468310 KDM5CP41229 1560 aa34.73■■■■□ 3.15
PRKCZ-208ENST00000468310 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.72■■■■□ 3.15
PRKCZ-208ENST00000468310 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.72■■■■□ 3.15
PRKCZ-208ENST00000468310 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.72■■■■□ 3.15
PRKCZ-208ENST00000468310 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.69■■■■□ 3.14
PRKCZ-208ENST00000468310 ABCC1P33527 1531 aa34.68■■■■□ 3.14
PRKCZ-208ENST00000468310 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.67■■■■□ 3.14
PRKCZ-208ENST00000468310 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.66■■■■□ 3.14
PRKCZ-208ENST00000468310 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.62■■■■□ 3.13
PRKCZ-208ENST00000468310 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.61■■■■□ 3.13
PRKCZ-208ENST00000468310 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.61■■■■□ 3.13
PRKCZ-208ENST00000468310 CEP162Q5TB80 1403 aa34.6■■■■□ 3.13
PRKCZ-208ENST00000468310 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
PRKCZ-208ENST00000468310 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.58■■■■□ 3.13
PRKCZ-208ENST00000468310 ABCA6Q8N139 1617 aa34.58■■■■□ 3.13
PRKCZ-208ENST00000468310 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.58■■■■□ 3.13
PRKCZ-208ENST00000468310 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.56■■■■□ 3.12
PRKCZ-208ENST00000468310 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
PRKCZ-208ENST00000468310 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.54■■■■□ 3.12
PRKCZ-208ENST00000468310 REREQ9P2R6 1566 aa34.52■■■■□ 3.12
PRKCZ-208ENST00000468310 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.51■■■■□ 3.12
PRKCZ-208ENST00000468310 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
PRKCZ-208ENST00000468310 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.5■■■■□ 3.11
PRKCZ-208ENST00000468310 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.49■■■■□ 3.11
PRKCZ-208ENST00000468310 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PRKCZ-208ENST00000468310 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.45■■■■□ 3.1
PRKCZ-208ENST00000468310 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.43■■■■□ 3.14e-7■■■■□ 26.3
PRKCZ-208ENST00000468310 AGLP35573 1532 aa34.41■■■■□ 3.1
PRKCZ-208ENST00000468310 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.41■■■■□ 3.1
PRKCZ-208ENST00000468310 HSPA2P54652 639 aa34.4■■■■□ 3.1
PRKCZ-208ENST00000468310 TIAM1Q13009 1591 aa34.39■■■■□ 3.1
PRKCZ-208ENST00000468310 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
PRKCZ-208ENST00000468310 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
PRKCZ-208ENST00000468310 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.38■■■■□ 3.09
PRKCZ-208ENST00000468310 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.36■■■■□ 3.09
PRKCZ-208ENST00000468310 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.34■■■■□ 3.09
PRKCZ-208ENST00000468310 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
PRKCZ-208ENST00000468310 ATP7AQ04656 1500 aa34.33■■■■□ 3.09
PRKCZ-208ENST00000468310 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
PRKCZ-208ENST00000468310 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
PRKCZ-208ENST00000468310 C3P01024 1663 aa34.28■■■■□ 3.08
PRKCZ-208ENST00000468310 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
PRKCZ-208ENST00000468310 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.22■■■■□ 3.07
PRKCZ-208ENST00000468310 NCOA2Q15596 1464 aa34.22■■■■□ 3.07
PRKCZ-208ENST00000468310 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.21■■■■□ 3.07
PRKCZ-208ENST00000468310 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.21■■■■□ 3.07
PRKCZ-208ENST00000468310 A2MP01023 1474 aa34.2■■■■□ 3.07
PRKCZ-208ENST00000468310 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
PRKCZ-208ENST00000468310 PLXNC1O60486 1568 aa34.18■■■■□ 3.06
PRKCZ-208ENST00000468310 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.18■■■■□ 3.06
PRKCZ-208ENST00000468310 MBD5Q9P267 1494 aa34.17■■■■□ 3.06
PRKCZ-208ENST00000468310 MROH2AA6NES4 1674 aa34.14■■■■□ 3.06
PRKCZ-208ENST00000468310 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.12■■■■□ 3.05
PRKCZ-208ENST00000468310 FBXO41Q8TF61 875 aa34.11■■■■□ 3.05
PRKCZ-208ENST00000468310 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
PRKCZ-208ENST00000468310 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.09■■■■□ 3.05
PRKCZ-208ENST00000468310 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.08■■■■□ 3.05
PRKCZ-208ENST00000468310 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.07■■■■□ 3.05
PRKCZ-208ENST00000468310 GGT6Q6P531 493 aa34.06■■■■□ 3.04
PRKCZ-208ENST00000468310 ZMYM3Q14202 1370 aa34.05■■■■□ 3.04
PRKCZ-208ENST00000468310 STRCQ7RTU9 1775 aa34.05■■■■□ 3.04
PRKCZ-208ENST00000468310 MAP3K1Q13233 1512 aa34.01■■■■□ 3.04
PRKCZ-208ENST00000468310 NPATQ14207 1427 aa34.01■■■■□ 3.03
PRKCZ-208ENST00000468310 RSPH4AQ5TD94 716 aa34■■■■□ 3.03
PRKCZ-208ENST00000468310 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.99■■■■□ 3.03
PRKCZ-208ENST00000468310 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
PRKCZ-208ENST00000468310 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
PRKCZ-208ENST00000468310 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.97■■■■□ 3.03
PRKCZ-208ENST00000468310 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.94■■■■□ 3.02
PRKCZ-208ENST00000468310 TSPY4P0CV99 314 aa33.91■■■■□ 3.02
PRKCZ-208ENST00000468310 TSPY10P0CW01 314 aa33.91■■■■□ 3.02
PRKCZ-208ENST00000468310 CERKQ8TCT0 537 aa33.9■■■■□ 3.02
PRKCZ-208ENST00000468310 KIF3BO15066 747 aa33.89■■■■□ 3.02
PRKCZ-208ENST00000468310 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.88■■■■□ 3.01
PRKCZ-208ENST00000468310 PTPRKQ15262 1439 aa33.87■■■■□ 3.01
PRKCZ-208ENST00000468310 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.87■■■■□ 3.01
PRKCZ-208ENST00000468310 APLP2Q06481 763 aa33.86■■■■□ 3.01
PRKCZ-208ENST00000468310 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.85■■■■□ 3.01
PRKCZ-208ENST00000468310 NCOA1Q15788 1441 aa33.84■■■■□ 3.01
PRKCZ-208ENST00000468310 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
PRKCZ-208ENST00000468310 PTPRTO14522 1441 aa33.83■■■■□ 3.01
PRKCZ-208ENST00000468310 MIA2Q96PC5 1412 aa33.83■■■■□ 3.01
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