RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468247.1

RERE-210, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 2

Gene RERE, Length 414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-210ENST00000468247 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.96■■■■□ 3.03
RERE-210ENST00000468247 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.96■■■■□ 3.03
RERE-210ENST00000468247 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
RERE-210ENST00000468247 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.94■■■■□ 3.02
RERE-210ENST00000468247 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.93■■■■□ 3.02
RERE-210ENST00000468247 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.92■■■■□ 3.02
RERE-210ENST00000468247 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.89■■■■□ 3.02
RERE-210ENST00000468247 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.88■■■■□ 3.01
RERE-210ENST00000468247 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.88■■■■□ 3.01
RERE-210ENST00000468247 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.87■■■■□ 3.01
RERE-210ENST00000468247 PTPRMP28827 1452 aa33.86■■■■□ 3.01
RERE-210ENST00000468247 MADDQ8WXG6 1647 aa33.84■■■■□ 3.01
RERE-210ENST00000468247 CEP162Q5TB80 1403 aa33.84■■■■□ 3.01
RERE-210ENST00000468247 PREX2Q70Z35 1606 aa33.83■■■■□ 3.01
RERE-210ENST00000468247 AFAP1Q8N556 730 aa33.81■■■■□ 3
RERE-210ENST00000468247 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.79■■■■□ 3
RERE-210ENST00000468247 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.77■■■■□ 3
RERE-210ENST00000468247 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.77■■■■□ 3
RERE-210ENST00000468247 KDM5CP41229 1560 aa33.77■■■■□ 3
RERE-210ENST00000468247 ABCC1P33527 1531 aa33.74■■■□□ 2.99
RERE-210ENST00000468247 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.74■■■□□ 2.99
RERE-210ENST00000468247 ATP10AO60312 1499 aa33.74■■■□□ 2.99
RERE-210ENST00000468247 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.72■■■□□ 2.99
RERE-210ENST00000468247 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
RERE-210ENST00000468247 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
RERE-210ENST00000468247 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.7■■■□□ 2.98
RERE-210ENST00000468247 MLECQ14165 292 aa33.69■■■□□ 2.98
RERE-210ENST00000468247 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.68■■■□□ 2.98
RERE-210ENST00000468247 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.65■■■□□ 2.98
RERE-210ENST00000468247 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
RERE-210ENST00000468247 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.64■■■□□ 2.98
RERE-210ENST00000468247 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.64■■■□□ 2.98
RERE-210ENST00000468247 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.63■■■□□ 2.97
RERE-210ENST00000468247 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.63■■■□□ 2.97
RERE-210ENST00000468247 ABCA6Q8N139 1617 aa33.61■■■□□ 2.97
RERE-210ENST00000468247 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.59■■■□□ 2.97
RERE-210ENST00000468247 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.57■■■□□ 2.96
RERE-210ENST00000468247 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.57■■■□□ 2.96
RERE-210ENST00000468247 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.56■■■□□ 2.96
RERE-210ENST00000468247 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.56■■■□□ 2.96
RERE-210ENST00000468247 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
RERE-210ENST00000468247 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.54■■■□□ 2.962e-6■■■□□ 16.4
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RERE-210ENST00000468247 TIAM1Q13009 1591 aa33.52■■■□□ 2.96
RERE-210ENST00000468247 REREQ9P2R6 1566 aa33.52■■■□□ 2.96
RERE-210ENST00000468247 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.5■■■□□ 2.95
RERE-210ENST00000468247 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.47■■■□□ 2.95
RERE-210ENST00000468247 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.46■■■□□ 2.95
RERE-210ENST00000468247 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
RERE-210ENST00000468247 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.44■■■□□ 2.94
RERE-210ENST00000468247 AGLP35573 1532 aa33.43■■■□□ 2.94
RERE-210ENST00000468247 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
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RERE-210ENST00000468247 NCOA2Q15596 1464 aa33.39■■■□□ 2.94
RERE-210ENST00000468247 ATP7AQ04656 1500 aa33.37■■■□□ 2.93
RERE-210ENST00000468247 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
RERE-210ENST00000468247 HSPA2P54652 639 aa33.35■■■□□ 2.93
RERE-210ENST00000468247 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
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RERE-210ENST00000468247 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.31■■■□□ 2.92
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RERE-210ENST00000468247 PLXNC1O60486 1568 aa33.26■■■□□ 2.91
RERE-210ENST00000468247 A2MP01023 1474 aa33.25■■■□□ 2.91
RERE-210ENST00000468247 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
RERE-210ENST00000468247 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.25■■■□□ 2.91
RERE-210ENST00000468247 C3P01024 1663 aa33.23■■■□□ 2.91
RERE-210ENST00000468247 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.21■■■□□ 2.91
RERE-210ENST00000468247 MAP3K1Q13233 1512 aa33.21■■■□□ 2.91
RERE-210ENST00000468247 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
RERE-210ENST00000468247 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.17■■■□□ 2.9
RERE-210ENST00000468247 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.17■■■□□ 2.9
RERE-210ENST00000468247 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.16■■■□□ 2.9
RERE-210ENST00000468247 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.15■■■□□ 2.9
RERE-210ENST00000468247 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.11■■■□□ 2.89
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RERE-210ENST00000468247 GGT6Q6P531 493 aa33.1■■■□□ 2.89
RERE-210ENST00000468247 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.08■■■□□ 2.89
RERE-210ENST00000468247 ZMYM3Q14202 1370 aa33.08■■■□□ 2.89
RERE-210ENST00000468247 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
RERE-210ENST00000468247 MROH2AA6NES4 1674 aa33.07■■■□□ 2.89
RERE-210ENST00000468247 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.07■■■□□ 2.88
RERE-210ENST00000468247 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
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RERE-210ENST00000468247 NPATQ14207 1427 aa32.99■■■□□ 2.87
RERE-210ENST00000468247 MIA2Q96PC5 1412 aa32.99■■■□□ 2.87
RERE-210ENST00000468247 TSPY4P0CV99 314 aa32.98■■■□□ 2.87
RERE-210ENST00000468247 TSPY10P0CW01 314 aa32.98■■■□□ 2.87
RERE-210ENST00000468247 STRCQ7RTU9 1775 aa32.98■■■□□ 2.87
RERE-210ENST00000468247 KIF3BO15066 747 aa32.96■■■□□ 2.87
RERE-210ENST00000468247 APLP2Q06481 763 aa32.95■■■□□ 2.87
RERE-210ENST00000468247 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.95■■■□□ 2.87
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RERE-210ENST00000468247 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.92■■■□□ 2.86
RERE-210ENST00000468247 FBXO41Q8TF61 875 aa32.87■■■□□ 2.85
RERE-210ENST00000468247 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32.84■■■□□ 2.85
RERE-210ENST00000468247 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.83■■■□□ 2.85
RERE-210ENST00000468247 NCOA1Q15788 1441 aa32.83■■■□□ 2.85
RERE-210ENST00000468247 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.82■■■□□ 2.85
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RERE-210ENST00000468247 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.8■■■□□ 2.84
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