RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468234.1

SERINC3-204, Transcript of serine incorporator 3, humanhuman

TSL 2

Gene SERINC3, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC3-204ENST00000468234 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.01□□□□□ -0.01
SERINC3-204ENST00000468234 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SERINC3-204ENST00000468234 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.01□□□□□ -0.01
SERINC3-204ENST00000468234 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.99□□□□□ -0.01
SERINC3-204ENST00000468234 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SERINC3-204ENST00000468234 NEO1Q92859 1461 aa14.97□□□□□ -0.01
SERINC3-204ENST00000468234 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.97□□□□□ -0.01
SERINC3-204ENST00000468234 MIA2Q96PC5 1412 aa14.97□□□□□ -0.01
SERINC3-204ENST00000468234 FBXO41Q8TF61 875 aa14.96□□□□□ -0.01
SERINC3-204ENST00000468234 FANCAO15360 1455 aa14.95□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.95□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.95□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 AKNAQ7Z591 1439 aa14.94□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.93□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.93□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 PREX2Q70Z35 1606 aa14.92□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.92□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.92□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.92□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.92□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.91□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.9□□□□□ -0.02
SERINC3-204ENST00000468234 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.89□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.84□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 TSPY4P0CV99 314 aa14.84□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 TSPY10P0CW01 314 aa14.84□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.84□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.84□□□□□ -0.03
SERINC3-204ENST00000468234 ABCC1P33527 1531 aa14.83□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 RAPGEF3O95398 923 aa14.83□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 AFAP1Q8N556 730 aa14.83□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 MBD5Q9P267 1494 aa14.82□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.82□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.81□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.81□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.81□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.79□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.79□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.78□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.77□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.77□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 ABCC5O15440 1437 aa14.77□□□□□ -0.04
SERINC3-204ENST00000468234 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.77□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.76□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 DAPK1P53355 1430 aa14.75□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 KDM5CP41229 1560 aa14.73□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.73□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 RICTORQ6R327 1708 aa14.73□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 ITGAEP38570 1179 aa14.73□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.73□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.72□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.72□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.71□□□□□ -0.05
SERINC3-204ENST00000468234 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.71□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.7□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 ROCK1Q13464 1354 aa14.7□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.69□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 PTPRMP28827 1452 aa14.69□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 PTPRKQ15262 1439 aa14.68□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 ATP10AO60312 1499 aa14.68□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 NCOA1Q15788 1441 aa14.67□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 ATP7AQ04656 1500 aa14.67□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.67□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.67□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 ADGRL2O95490 1459 aa14.67□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.66□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.65□□□□□ -0.06
SERINC3-204ENST00000468234 KIF15Q9NS87 1388 aa14.64□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.64□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 ILDR2Q71H61 639 aa14.63□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 A2MP01023 1474 aa14.63□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.62□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 PLXNC1O60486 1568 aa14.62□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.61□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.61□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 REREQ9P2R6 1566 aa14.6□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.6□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.59□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 ABCA6Q8N139 1617 aa14.59□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 HFM1A2PYH4 1435 aa14.58□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 ERBINQ96RT1 1412 aa14.58□□□□□ -0.07
SERINC3-204ENST00000468234 AGLP35573 1532 aa14.58□□□□□ -0.08
SERINC3-204ENST00000468234 SOCS7O14512 581 aa14.58□□□□□ -0.08
SERINC3-204ENST00000468234 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.58□□□□□ -0.08
SERINC3-204ENST00000468234 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 270.2 ms