RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466223.1

AGRN-204, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 459 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-204ENST00000466223 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.84■■□□□ 1.57
AGRN-204ENST00000466223 AKNAQ7Z591 1439 aa24.82■■□□□ 1.56
AGRN-204ENST00000466223 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.81■■□□□ 1.56
AGRN-204ENST00000466223 PREX2Q70Z35 1606 aa24.8■■□□□ 1.56
AGRN-204ENST00000466223 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.8■■□□□ 1.56
AGRN-204ENST00000466223 NCOA2Q15596 1464 aa24.79■■□□□ 1.56
AGRN-204ENST00000466223 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
AGRN-204ENST00000466223 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AGRN-204ENST00000466223 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
AGRN-204ENST00000466223 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
AGRN-204ENST00000466223 ADGRL1O94910 1474 aa24.75■■□□□ 1.55
AGRN-204ENST00000466223 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.75■■□□□ 1.55
AGRN-204ENST00000466223 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
AGRN-204ENST00000466223 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.72■■□□□ 1.55
AGRN-204ENST00000466223 RAPGEF3O95398 923 aa24.71■■□□□ 1.55
AGRN-204ENST00000466223 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.65■■□□□ 1.54
AGRN-204ENST00000466223 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.62■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 ABCC1P33527 1531 aa24.62■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 RICTORQ6R327 1708 aa24.62■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.62■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.61■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.6■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.6■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.6■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 AFAP1Q8N556 730 aa24.59■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 MIA2Q96PC5 1412 aa24.59■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
AGRN-204ENST00000466223 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.58■■□□□ 1.52
AGRN-204ENST00000466223 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.56■■□□□ 1.52
AGRN-204ENST00000466223 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.56■■□□□ 1.52
AGRN-204ENST00000466223 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.54■■□□□ 1.52
AGRN-204ENST00000466223 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.54■■□□□ 1.52
AGRN-204ENST00000466223 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.54■■□□□ 1.52
AGRN-204ENST00000466223 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.54■■□□□ 1.52
AGRN-204ENST00000466223 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.53■■□□□ 1.52
AGRN-204ENST00000466223 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.5■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 KDM5CP41229 1560 aa24.5■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.48■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.47■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.46■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 MBD5Q9P267 1494 aa24.46■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.46■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 TSPY4P0CV99 314 aa24.46■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 TSPY10P0CW01 314 aa24.46■■□□□ 1.51
AGRN-204ENST00000466223 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.45■■□□□ 1.5
AGRN-204ENST00000466223 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.44■■□□□ 1.5
AGRN-204ENST00000466223 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.43■■□□□ 1.5
AGRN-204ENST00000466223 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
AGRN-204ENST00000466223 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.43■■□□□ 1.5
AGRN-204ENST00000466223 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
AGRN-204ENST00000466223 ATP10AO60312 1499 aa24.4■■□□□ 1.5
AGRN-204ENST00000466223 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
AGRN-204ENST00000466223 ATP7AQ04656 1500 aa24.38■■□□□ 1.49
AGRN-204ENST00000466223 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.38■■□□□ 1.49
AGRN-204ENST00000466223 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.37■■□□□ 1.49
AGRN-204ENST00000466223 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.37■■□□□ 1.49
AGRN-204ENST00000466223 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.35■■□□□ 1.49
AGRN-204ENST00000466223 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
AGRN-204ENST00000466223 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.34■■□□□ 1.49
AGRN-204ENST00000466223 ABCA6Q8N139 1617 aa24.33■■□□□ 1.49
AGRN-204ENST00000466223 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
AGRN-204ENST00000466223 DAPK1P53355 1430 aa24.3■■□□□ 1.48
AGRN-204ENST00000466223 ABCC5O15440 1437 aa24.29■■□□□ 1.48
AGRN-204ENST00000466223 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.29■■□□□ 1.48
AGRN-204ENST00000466223 REREQ9P2R6 1566 aa24.28■■□□□ 1.48
AGRN-204ENST00000466223 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
AGRN-204ENST00000466223 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.27■■□□□ 1.48
AGRN-204ENST00000466223 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.27■■□□□ 1.48
AGRN-204ENST00000466223 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.26■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 A2MP01023 1474 aa24.26■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 MLECQ14165 292 aa24.25■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.25■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 ITGAEP38570 1179 aa24.22■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.21■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.21■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 AGLP35573 1532 aa24.2■■□□□ 1.47
AGRN-204ENST00000466223 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.2■■□□□ 1.46
AGRN-204ENST00000466223 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.19■■□□□ 1.46
AGRN-204ENST00000466223 PLXNC1O60486 1568 aa24.19■■□□□ 1.46
AGRN-204ENST00000466223 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
AGRN-204ENST00000466223 KIF15Q9NS87 1388 aa24.16■■□□□ 1.46
AGRN-204ENST00000466223 KIF3BO15066 747 aa24.14■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.14■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 NCOA1Q15788 1441 aa24.13■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 GGT6Q6P531 493 aa24.13■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.13■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 ADGRL2O95490 1459 aa24.12■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 PTPRKQ15262 1439 aa24.1■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 ROCK1Q13464 1354 aa24.09■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 MADDQ8WXG6 1647 aa24.09■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.08■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.08■■□□□ 1.45
AGRN-204ENST00000466223 ERBINQ96RT1 1412 aa24.07■■□□□ 1.44
AGRN-204ENST00000466223 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
AGRN-204ENST00000466223 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.2 ms