RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465975.1

PLP1-208, Transcript of proteolipid protein 1, human

TSL 4

Gene PLP1, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-208	ENST00000465975	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PLP1-208	ENST00000465975	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PLP1-208	ENST00000465975	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PLP1-208	ENST00000465975	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	KIAA0556	O60303	1618 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PLP1-208	ENST00000465975	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	ABCA8	O94911	1581 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	ITGAE	P38570	1179 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	ATP10B	O94823	1461 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PLP1-208	ENST00000465975	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLP1-208	ENST00000465975	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
PLP1-208	ENST00000465975	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PLP1-208	ENST00000465975	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PLP1-208	ENST00000465975	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
PLP1-208	ENST00000465975	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PLP1-208	ENST00000465975	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PLP1-208	ENST00000465975	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PLP1-208	ENST00000465975	MLEC	Q14165	292 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PLP1-208	ENST00000465975	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	NEO1	Q92859	1461 aa		13.27	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	NAIP	Q13075	1403 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PLP1-208	ENST00000465975	FANCA	O15360	1455 aa		13.21	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PLP1-208	ENST00000465975	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.15	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.15	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	DAPK1	P53355	1430 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	RICTOR	Q6R327	1708 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	PTPRT	O14522	1441 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	ABCC5	O15440	1437 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	KIF14	Q15058	1648 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	PLCH2	O75038	1416 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.08	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.08	□□□□□ -0.31
PLP1-208	ENST00000465975	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	ADGRL2	O95490	1459 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.06	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	ATP10A	O60312	1499 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PLP1-208	ENST00000465975	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
PLP1-208	ENST00000465975	MIER1	Q8N108	512 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PLP1-208	ENST00000465975	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
PLP1-208	ENST00000465975	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PLP1-208	ENST00000465975	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.01	□□□□□ -0.33

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