RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465905.5

TRAPPC10-206, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-206ENST00000465905 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC10-206ENST00000465905 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC10-206ENST00000465905 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-206ENST00000465905 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-206ENST00000465905 PTPRMP28827 1452 aa20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC10-206ENST00000465905 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC10-206ENST00000465905 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC10-206ENST00000465905 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC10-206ENST00000465905 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC10-206ENST00000465905 ATP10AO60312 1499 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-206ENST00000465905 MADDQ8WXG6 1647 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-206ENST00000465905 AFAP1Q8N556 730 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-206ENST00000465905 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC10-206ENST00000465905 MLECQ14165 292 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC10-206ENST00000465905 PREX2Q70Z35 1606 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC10-206ENST00000465905 KDM5CP41229 1560 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 CEP162Q5TB80 1403 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 ABCC1P33527 1531 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC10-206ENST00000465905 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC10-206ENST00000465905 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC10-206ENST00000465905 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC10-206ENST00000465905 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC10-206ENST00000465905 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC10-206ENST00000465905 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC10-206ENST00000465905 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC10-206ENST00000465905 REREQ9P2R6 1566 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC10-206ENST00000465905 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 ABCA6Q8N139 1617 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 AGLP35573 1532 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 HSPA2P54652 639 aa20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC10-206ENST00000465905 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC10-206ENST00000465905 TIAM1Q13009 1591 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC10-206ENST00000465905 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC10-206ENST00000465905 ATP7AQ04656 1500 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC10-206ENST00000465905 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC10-206ENST00000465905 NCOA2Q15596 1464 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC10-206ENST00000465905 A2MP01023 1474 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-206ENST00000465905 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-206ENST00000465905 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC10-206ENST00000465905 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-206ENST00000465905 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-206ENST00000465905 MBD5Q9P267 1494 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC10-206ENST00000465905 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC10-206ENST00000465905 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC10-206ENST00000465905 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 FBXO41Q8TF61 875 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 PLXNC1O60486 1568 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 GGT6Q6P531 493 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 C3P01024 1663 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZMYM3Q14202 1370 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 MAP3K1Q13233 1512 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC10-206ENST00000465905 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 NPATQ14207 1427 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 TSPY4P0CV99 314 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 TSPY10P0CW01 314 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 APLP2Q06481 763 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 MROH2AA6NES4 1674 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 KIF3BO15066 747 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC10-206ENST00000465905 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC10-206ENST00000465905 MIA2Q96PC5 1412 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC10-206ENST00000465905 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC10-206ENST00000465905 CERKQ8TCT0 537 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC10-206ENST00000465905 PTPRKQ15262 1439 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC10-206ENST00000465905 PTPRTO14522 1441 aa20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC10-206ENST00000465905 STRCQ7RTU9 1775 aa20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC10-206ENST00000465905 NCOA1Q15788 1441 aa20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC10-206ENST00000465905 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC10-206ENST00000465905 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20■□□□□ 0.79
TRAPPC10-206ENST00000465905 KDM5DQ9BY66 1539 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms