RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465399.5

ATG4B-214, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-214ENST00000465399 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-214ENST00000465399 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4B-214ENST00000465399 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4B-214ENST00000465399 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-214ENST00000465399 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-214ENST00000465399 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-214ENST00000465399 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4B-214ENST00000465399 CLIP1P30622 1438 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4B-214ENST00000465399 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-214ENST00000465399 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-214ENST00000465399 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-214ENST00000465399 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.34■■□□□ 1.33
ATG4B-214ENST00000465399 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-214ENST00000465399 ATP10AO60312 1499 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-214ENST00000465399 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-214ENST00000465399 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-214ENST00000465399 MLECQ14165 292 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-214ENST00000465399 KDM5CP41229 1560 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-214ENST00000465399 PREX2Q70Z35 1606 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-214ENST00000465399 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-214ENST00000465399 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-214ENST00000465399 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-214ENST00000465399 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.21■■□□□ 1.31
ATG4B-214ENST00000465399 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 FBXO41Q8TF61 875 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 ABCC1P33527 1531 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 AFAP1Q8N556 730 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 ABCA6Q8N139 1617 aa23.18■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 REREQ9P2R6 1566 aa23.18■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 HSPA2P54652 639 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-214ENST00000465399 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-214ENST00000465399 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-214ENST00000465399 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-214ENST00000465399 AGLP35573 1532 aa23.08■■□□□ 1.28
ATG4B-214ENST00000465399 C3P01024 1663 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG4B-214ENST00000465399 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-214ENST00000465399 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-214ENST00000465399 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4B-214ENST00000465399 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-214ENST00000465399 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-214ENST00000465399 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-214ENST00000465399 STRCQ7RTU9 1775 aa23■■□□□ 1.27
ATG4B-214ENST00000465399 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG4B-214ENST00000465399 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-214ENST00000465399 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-214ENST00000465399 MROH2AA6NES4 1674 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-214ENST00000465399 ATP7AQ04656 1500 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 CERKQ8TCT0 537 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.264e-7■■■■□ 21.8
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ATG4B-214ENST00000465399 PLXNC1O60486 1568 aa22.89■■□□□ 1.26
ATG4B-214ENST00000465399 TIAM1Q13009 1591 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG4B-214ENST00000465399 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4B-214ENST00000465399 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-214ENST00000465399 A2MP01023 1474 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-214ENST00000465399 NPATQ14207 1427 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-214ENST00000465399 CEP162Q5TB80 1403 aa22.83■■□□□ 1.25
ATG4B-214ENST00000465399 PTPRTO14522 1441 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-214ENST00000465399 ZMYM3Q14202 1370 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-214ENST00000465399 NCOA1Q15788 1441 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-214ENST00000465399 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-214ENST00000465399 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-214ENST00000465399 MBD5Q9P267 1494 aa22.77■■□□□ 1.24
ATG4B-214ENST00000465399 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ATG4B-214ENST00000465399 GGT6Q6P531 493 aa22.75■■□□□ 1.23
ATG4B-214ENST00000465399 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG4B-214ENST00000465399 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-214ENST00000465399 NCOA2Q15596 1464 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-214ENST00000465399 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-214ENST00000465399 PTPRKQ15262 1439 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-214ENST00000465399 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-214ENST00000465399 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-214ENST00000465399 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-214ENST00000465399 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ATG4B-214ENST00000465399 PLA2R1Q13018 1463 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-214ENST00000465399 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.66■■□□□ 1.22
ATG4B-214ENST00000465399 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.64■■□□□ 1.22
ATG4B-214ENST00000465399 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG4B-214ENST00000465399 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG4B-214ENST00000465399 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-214ENST00000465399 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-214ENST00000465399 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-214ENST00000465399 PKD2Q13563 968 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4B-214ENST00000465399 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.6■■□□□ 1.21
ATG4B-214ENST00000465399 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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