RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465120.3

HOXB3-204, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB3, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-204ENST00000465120 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.04■■□□□ 1.6
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HOXB3-204ENST00000465120 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-204ENST00000465120 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-204ENST00000465120 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-204ENST00000465120 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-204ENST00000465120 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-204ENST00000465120 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.02■■□□□ 1.6
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HOXB3-204ENST00000465120 MLECQ14165 292 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-204ENST00000465120 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.01■■□□□ 1.59
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HOXB3-204ENST00000465120 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXB3-204ENST00000465120 ATP10AO60312 1499 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXB3-204ENST00000465120 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-204ENST00000465120 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-204ENST00000465120 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-204ENST00000465120 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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HOXB3-204ENST00000465120 PREX2Q70Z35 1606 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-204ENST00000465120 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.82■■□□□ 1.56
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HOXB3-204ENST00000465120 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.81■■□□□ 1.56
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HOXB3-204ENST00000465120 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-204ENST00000465120 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.78■■□□□ 1.56
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HOXB3-204ENST00000465120 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-204ENST00000465120 HSPA2P54652 639 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-204ENST00000465120 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.76■■□□□ 1.55
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HOXB3-204ENST00000465120 ABCA6Q8N139 1617 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB3-204ENST00000465120 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.7■■□□□ 1.54
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HOXB3-204ENST00000465120 REREQ9P2R6 1566 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXB3-204ENST00000465120 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXB3-204ENST00000465120 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB3-204ENST00000465120 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.64■■□□□ 1.53
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HOXB3-204ENST00000465120 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.61■■□□□ 1.53
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HOXB3-204ENST00000465120 ATP7AQ04656 1500 aa24.56■■□□□ 1.52
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HOXB3-204ENST00000465120 A2MP01023 1474 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB3-204ENST00000465120 GGT6Q6P531 493 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXB3-204ENST00000465120 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXB3-204ENST00000465120 NCOA2Q15596 1464 aa24.49■■□□□ 1.51
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HOXB3-204ENST00000465120 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXB3-204ENST00000465120 MBD5Q9P267 1494 aa24.45■■□□□ 1.51
HOXB3-204ENST00000465120 ZMYM3Q14202 1370 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXB3-204ENST00000465120 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-204ENST00000465120 PLXNC1O60486 1568 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXB3-204ENST00000465120 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXB3-204ENST00000465120 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-204ENST00000465120 CERKQ8TCT0 537 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-204ENST00000465120 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXB3-204ENST00000465120 MROH2AA6NES4 1674 aa24.4■■□□□ 1.5
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HOXB3-204ENST00000465120 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-204ENST00000465120 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.38■■□□□ 1.49
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HOXB3-204ENST00000465120 TSPY10P0CW01 314 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXB3-204ENST00000465120 STRCQ7RTU9 1775 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXB3-204ENST00000465120 NPATQ14207 1427 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-204ENST00000465120 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXB3-204ENST00000465120 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
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HOXB3-204ENST00000465120 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXB3-204ENST00000465120 APLP2Q06481 763 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXB3-204ENST00000465120 MAP3K1Q13233 1512 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-204ENST00000465120 PTPRTO14522 1441 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-204ENST00000465120 PTPRKQ15262 1439 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-204ENST00000465120 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-204ENST00000465120 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-204ENST00000465120 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-204ENST00000465120 NCOA1Q15788 1441 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-204ENST00000465120 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-204ENST00000465120 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-204ENST00000465120 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.22■■□□□ 1.47
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