RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464833.1

CHRD-211, Transcript of chordin, human

TSL 5

Gene CHRD, Length 1,340 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHRD-211	ENST00000464833	APLP2	Q06481	763 aa		43.43	■■■■■ 4.54
CHRD-211	ENST00000464833	AKNA	Q7Z591	1439 aa		43.41	■■■■■ 4.54
CHRD-211	ENST00000464833	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CHRD-211	ENST00000464833	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.4	■■■■■ 4.54
CHRD-211	ENST00000464833	NCOA2	Q15596	1464 aa		43.37	■■■■■ 4.53
CHRD-211	ENST00000464833	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.37	■■■■■ 4.53
CHRD-211	ENST00000464833	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43.35	■■■■■ 4.53
CHRD-211	ENST00000464833	ADGRL1	O94910	1474 aa		43.28	■■■■■ 4.52
CHRD-211	ENST00000464833	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.27	■■■■■ 4.52
CHRD-211	ENST00000464833	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		43.24	■■■■■ 4.51
CHRD-211	ENST00000464833	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	43.24	■■■■■ 4.51
CHRD-211	ENST00000464833	RICTOR	Q6R327	1708 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CHRD-211	ENST00000464833	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		43.21	■■■■■ 4.51
CHRD-211	ENST00000464833	RAPGEF3	O95398	923 aa		43.2	■■■■■ 4.51
CHRD-211	ENST00000464833	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.19	■■■■■ 4.5
CHRD-211	ENST00000464833	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.18	■■■■■ 4.5
CHRD-211	ENST00000464833	ABCC1	P33527	1531 aa		43.18	■■■■■ 4.5
CHRD-211	ENST00000464833	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.13	■■■■■ 4.5
CHRD-211	ENST00000464833	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CHRD-211	ENST00000464833	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
CHRD-211	ENST00000464833	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		43.07	■■■■■ 4.48
CHRD-211	ENST00000464833	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		43.05	■■■■■ 4.48
CHRD-211	ENST00000464833	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.05	■■■■■ 4.48
CHRD-211	ENST00000464833	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CHRD-211	ENST00000464833	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CHRD-211	ENST00000464833	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CHRD-211	ENST00000464833	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	43	■■■■■ 4.47
CHRD-211	ENST00000464833	KDM5C	P41229	1560 aa		43	■■■■■ 4.47
CHRD-211	ENST00000464833	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43	■■■■■ 4.47
CHRD-211	ENST00000464833	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CHRD-211	ENST00000464833	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.96	■■■■■ 4.47
CHRD-211	ENST00000464833	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.96	■■■■■ 4.47
CHRD-211	ENST00000464833	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CHRD-211	ENST00000464833	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.92	■■■■■ 4.46
CHRD-211	ENST00000464833	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.9	■■■■■ 4.46
CHRD-211	ENST00000464833	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.9	■■■■■ 4.46
CHRD-211	ENST00000464833	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CHRD-211	ENST00000464833	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.86	■■■■■ 4.45
CHRD-211	ENST00000464833	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CHRD-211	ENST00000464833	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CHRD-211	ENST00000464833	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CHRD-211	ENST00000464833	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.83	■■■■■ 4.45
CHRD-211	ENST00000464833	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CHRD-211	ENST00000464833	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CHRD-211	ENST00000464833	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CHRD-211	ENST00000464833	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
CHRD-211	ENST00000464833	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.75	■■■■■ 4.43
CHRD-211	ENST00000464833	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
CHRD-211	ENST00000464833	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
CHRD-211	ENST00000464833	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CHRD-211	ENST00000464833	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CHRD-211	ENST00000464833	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CHRD-211	ENST00000464833	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CHRD-211	ENST00000464833	ATP10A	O60312	1499 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CHRD-211	ENST00000464833	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CHRD-211	ENST00000464833	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.63	■■■■■ 4.42
CHRD-211	ENST00000464833	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.63	■■■■■ 4.41
CHRD-211	ENST00000464833	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CHRD-211	ENST00000464833	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHRD-211	ENST00000464833	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.4
CHRD-211	ENST00000464833	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CHRD-211	ENST00000464833	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CHRD-211	ENST00000464833	ABCC5	O15440	1437 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CHRD-211	ENST00000464833	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CHRD-211	ENST00000464833	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CHRD-211	ENST00000464833	DAPK1	P53355	1430 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CHRD-211	ENST00000464833	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CHRD-211	ENST00000464833	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.48	■■■■■ 4.39
CHRD-211	ENST00000464833	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CHRD-211	ENST00000464833	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CHRD-211	ENST00000464833	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CHRD-211	ENST00000464833	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
CHRD-211	ENST00000464833	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.44	■■■■■ 4.38
CHRD-211	ENST00000464833	AGL	P35573	1532 aa		42.44	■■■■■ 4.38
CHRD-211	ENST00000464833	A2M	P01023	1474 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CHRD-211	ENST00000464833	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
CHRD-211	ENST00000464833	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.41	■■■■■ 4.38
CHRD-211	ENST00000464833	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.4	■■■■■ 4.38
CHRD-211	ENST00000464833	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.37
CHRD-211	ENST00000464833	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CHRD-211	ENST00000464833	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.26	■■■■■ 4.36
CHRD-211	ENST00000464833	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.25	■■■■■ 4.35
CHRD-211	ENST00000464833	MLEC	Q14165	292 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CHRD-211	ENST00000464833	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CHRD-211	ENST00000464833	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CHRD-211	ENST00000464833	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CHRD-211	ENST00000464833	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CHRD-211	ENST00000464833	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CHRD-211	ENST00000464833	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CHRD-211	ENST00000464833	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CHRD-211	ENST00000464833	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
CHRD-211	ENST00000464833	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
CHRD-211	ENST00000464833	ITGAE	P38570	1179 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CHRD-211	ENST00000464833	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CHRD-211	ENST00000464833	KIF3B	O15066	747 aa		42.09	■■■■■ 4.33
CHRD-211	ENST00000464833	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CHRD-211	ENST00000464833	PTPRM	P28827	1452 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CHRD-211	ENST00000464833	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
CHRD-211	ENST00000464833	GGT6	Q6P531	493 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CHRD-211	ENST00000464833	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.01	■■■■■ 4.32

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