RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463965.1

SURF1-203, Transcript of SURF1, cytochrome c oxidase assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SURF1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1-203ENST00000463965 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.15■■■■■ 4.18
SURF1-203ENST00000463965 MAP3K1Q13233 1512 aa41.14■■■■■ 4.18
SURF1-203ENST00000463965 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.13■■■■■ 4.17
SURF1-203ENST00000463965 PREX2Q70Z35 1606 aa41.13■■■■■ 4.17
SURF1-203ENST00000463965 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.1■■■■■ 4.17
SURF1-203ENST00000463965 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
SURF1-203ENST00000463965 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.07■■■■■ 4.16
SURF1-203ENST00000463965 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.06■■■■■ 4.16
SURF1-203ENST00000463965 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
SURF1-203ENST00000463965 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
SURF1-203ENST00000463965 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.03■■■■■ 4.16
SURF1-203ENST00000463965 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
SURF1-203ENST00000463965 RICTORQ6R327 1708 aa41.01■■■■■ 4.16
SURF1-203ENST00000463965 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.01■■■■■ 4.15
SURF1-203ENST00000463965 NCOA2Q15596 1464 aa40.98■■■■■ 4.15
SURF1-203ENST00000463965 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
SURF1-203ENST00000463965 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
SURF1-203ENST00000463965 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.92■■■■■ 4.14
SURF1-203ENST00000463965 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.91■■■■■ 4.14
SURF1-203ENST00000463965 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.91■■■■■ 4.14
SURF1-203ENST00000463965 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.9■■■■■ 4.14
SURF1-203ENST00000463965 ABCC1P33527 1531 aa40.9■■■■■ 4.14
SURF1-203ENST00000463965 AFAP1Q8N556 730 aa40.88■■■■■ 4.13
SURF1-203ENST00000463965 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.88■■■■■ 4.13
SURF1-203ENST00000463965 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.85■■■■■ 4.13
SURF1-203ENST00000463965 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.84■■■■■ 4.13
SURF1-203ENST00000463965 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.83■■■■■ 4.13
SURF1-203ENST00000463965 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.82■■■■■ 4.12
SURF1-203ENST00000463965 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.82■■■■■ 4.12
SURF1-203ENST00000463965 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.8■■■■■ 4.12
SURF1-203ENST00000463965 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.8■■■■■ 4.12
SURF1-203ENST00000463965 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.8■■■■■ 4.12
SURF1-203ENST00000463965 KDM5CP41229 1560 aa40.77■■■■■ 4.12
SURF1-203ENST00000463965 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.77■■■■■ 4.12
SURF1-203ENST00000463965 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.76■■■■■ 4.11
SURF1-203ENST00000463965 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.75■■■■■ 4.11
SURF1-203ENST00000463965 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
SURF1-203ENST00000463965 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
SURF1-203ENST00000463965 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.7■■■■■ 4.11
SURF1-203ENST00000463965 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.69■■■■■ 4.11
SURF1-203ENST00000463965 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.68■■■■■ 4.1
SURF1-203ENST00000463965 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
SURF1-203ENST00000463965 ATP10AO60312 1499 aa40.66■■■■■ 4.1
SURF1-203ENST00000463965 MIA2Q96PC5 1412 aa40.64■■■■■ 4.1
SURF1-203ENST00000463965 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.64■■■■■ 4.1
SURF1-203ENST00000463965 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.63■■■■■ 4.09
SURF1-203ENST00000463965 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.6■■■■■ 4.09
SURF1-203ENST00000463965 MBD5Q9P267 1494 aa40.59■■■■■ 4.09
SURF1-203ENST00000463965 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.52■■■■■ 4.08
SURF1-203ENST00000463965 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.51■■■■■ 4.08
SURF1-203ENST00000463965 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.51■■■■■ 4.07
SURF1-203ENST00000463965 ATP7AQ04656 1500 aa40.48■■■■■ 4.07
SURF1-203ENST00000463965 TSPY4P0CV99 314 aa40.48■■■■■ 4.07
SURF1-203ENST00000463965 TSPY10P0CW01 314 aa40.48■■■■■ 4.07
SURF1-203ENST00000463965 ABCA6Q8N139 1617 aa40.48■■■■■ 4.07
SURF1-203ENST00000463965 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.45■■■■■ 4.07
SURF1-203ENST00000463965 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.45■■■■■ 4.07
SURF1-203ENST00000463965 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.44■■■■■ 4.06
SURF1-203ENST00000463965 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.44■■■■■ 4.06
SURF1-203ENST00000463965 REREQ9P2R6 1566 aa40.44■■■■■ 4.06
SURF1-203ENST00000463965 MLECQ14165 292 aa40.43■■■■■ 4.06
SURF1-203ENST00000463965 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
SURF1-203ENST00000463965 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.39■■■■■ 4.06
SURF1-203ENST00000463965 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.39■■■■■ 4.06
SURF1-203ENST00000463965 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.38■■■■■ 4.05
SURF1-203ENST00000463965 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
SURF1-203ENST00000463965 AGLP35573 1532 aa40.33■■■■■ 4.05
SURF1-203ENST00000463965 A2MP01023 1474 aa40.32■■■■■ 4.04
SURF1-203ENST00000463965 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
SURF1-203ENST00000463965 MADDQ8WXG6 1647 aa40.28■■■■■ 4.04
SURF1-203ENST00000463965 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
SURF1-203ENST00000463965 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.26■■■■■ 4.04
SURF1-203ENST00000463965 PTPRMP28827 1452 aa40.23■■■■■ 4.03
SURF1-203ENST00000463965 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
SURF1-203ENST00000463965 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
SURF1-203ENST00000463965 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.21■■■■■ 4.03
SURF1-203ENST00000463965 ABCC5O15440 1437 aa40.2■■■■■ 4.03
SURF1-203ENST00000463965 PLXNC1O60486 1568 aa40.19■■■■■ 4.02
SURF1-203ENST00000463965 DAPK1P53355 1430 aa40.17■■■■■ 4.02
SURF1-203ENST00000463965 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
SURF1-203ENST00000463965 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.15■■■■■ 4.02
SURF1-203ENST00000463965 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.15■■■■■ 4.02
SURF1-203ENST00000463965 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
SURF1-203ENST00000463965 GGT6Q6P531 493 aa40.1■■■■■ 4.01
SURF1-203ENST00000463965 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.08■■■■■ 4.01
SURF1-203ENST00000463965 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.08■■■■■ 4.01
SURF1-203ENST00000463965 KIF3BO15066 747 aa40.07■■■■■ 4.01
SURF1-203ENST00000463965 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.05■■■■■ 4
SURF1-203ENST00000463965 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.05■■■■■ 4
SURF1-203ENST00000463965 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.04■■■■■ 4
SURF1-203ENST00000463965 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.03■■■■■ 4
SURF1-203ENST00000463965 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.02■■■■■ 4
SURF1-203ENST00000463965 KIF15Q9NS87 1388 aa40.01■■■■■ 4
SURF1-203ENST00000463965 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.98■■■■□ 3.99
SURF1-203ENST00000463965 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.98■■■■□ 3.99
SURF1-203ENST00000463965 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
SURF1-203ENST00000463965 NCOA1Q15788 1441 aa39.91■■■■□ 3.98
SURF1-203ENST00000463965 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
SURF1-203ENST00000463965 ADGRL2O95490 1459 aa39.88■■■■□ 3.98
SURF1-203ENST00000463965 ERBINQ96RT1 1412 aa39.88■■■■□ 3.97
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