RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 MAPKBP1O60336 1514 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRKQ15262 1439 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 AKNAQ7Z591 1439 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 MIA2Q96PC5 1412 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 AKT1S1Q96B36 256 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 HFM1A2PYH4 1435 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 JPH4Q96JJ6 628 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 KIF14Q15058 1648 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRC-210ENST00000462363 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 POTEMA6NI47 508 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 OSCARQ8IYS5 282 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 NAIPQ13075 1403 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 ATP10BO94823 1461 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 KDM6BO15054 1643 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 UACAQ9BZF9 1416 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 EVX2Q03828 476 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRC-210ENST00000462363 ABCC2Q92887 1545 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRL2O95490 1459 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 ABCC5O15440 1437 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 ROCK1Q13464 1354 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB22O15209 634 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 PREX2Q70Z35 1606 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 DAPK1P53355 1430 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 FBLN2P98095 1184 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRGP23470 1445 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 PITPNM1O00562 1244 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 ITGAEP38570 1179 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 POTEGQ6S5H5 508 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-210ENST00000462363 MBD5Q9P267 1494 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 NCOA1Q15788 1441 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 ARID3CA6NKF2 412 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 PZPP20742 1482 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 PLXNC1O60486 1568 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-210ENST00000462363 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 ABCC1P33527 1531 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 UNC13BO14795 1591 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.25□□□□□ -1.09
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