RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462106.1

SLC12A9-208, Transcript of solute carrier family 12 member 9, human

TSL 2

Gene SLC12A9, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC12A9-208	ENST00000462106	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SLC12A9-208	ENST00000462106	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SLC12A9-208	ENST00000462106	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SLC12A9-208	ENST00000462106	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SLC12A9-208	ENST00000462106	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SLC12A9-208	ENST00000462106	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SLC12A9-208	ENST00000462106	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SLC12A9-208	ENST00000462106	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SLC12A9-208	ENST00000462106	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SLC12A9-208	ENST00000462106	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SLC12A9-208	ENST00000462106	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SLC12A9-208	ENST00000462106	ABCC1	P33527	1531 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SLC12A9-208	ENST00000462106	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SLC12A9-208	ENST00000462106	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SLC12A9-208	ENST00000462106	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SLC12A9-208	ENST00000462106	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SLC12A9-208	ENST00000462106	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SLC12A9-208	ENST00000462106	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SLC12A9-208	ENST00000462106	KDM5C	P41229	1560 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SLC12A9-208	ENST00000462106	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SLC12A9-208	ENST00000462106	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.26	■■■□□ 2.76
SLC12A9-208	ENST00000462106	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
SLC12A9-208	ENST00000462106	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
SLC12A9-208	ENST00000462106	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SLC12A9-208	ENST00000462106	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SLC12A9-208	ENST00000462106	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
SLC12A9-208	ENST00000462106	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
SLC12A9-208	ENST00000462106	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SLC12A9-208	ENST00000462106	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.2	■■■□□ 2.74
SLC12A9-208	ENST00000462106	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.2	■■■□□ 2.74
SLC12A9-208	ENST00000462106	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SLC12A9-208	ENST00000462106	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SLC12A9-208	ENST00000462106	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SLC12A9-208	ENST00000462106	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SLC12A9-208	ENST00000462106	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SLC12A9-208	ENST00000462106	ATP10A	O60312	1499 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SLC12A9-208	ENST00000462106	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.1	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SLC12A9-208	ENST00000462106	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
SLC12A9-208	ENST00000462106	APLP2	Q06481	763 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SLC12A9-208	ENST00000462106	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.01	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	PTPRM	P28827	1452 aa		32	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	MLEC	Q14165	292 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.95	■■■□□ 2.71
SLC12A9-208	ENST00000462106	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SLC12A9-208	ENST00000462106	AGL	P35573	1532 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SLC12A9-208	ENST00000462106	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SLC12A9-208	ENST00000462106	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SLC12A9-208	ENST00000462106	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SLC12A9-208	ENST00000462106	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SLC12A9-208	ENST00000462106	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SLC12A9-208	ENST00000462106	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.81	■■■□□ 2.68
SLC12A9-208	ENST00000462106	A2M	P01023	1474 aa		31.8	■■■□□ 2.68
SLC12A9-208	ENST00000462106	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SLC12A9-208	ENST00000462106	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SLC12A9-208	ENST00000462106	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SLC12A9-208	ENST00000462106	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SLC12A9-208	ENST00000462106	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SLC12A9-208	ENST00000462106	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SLC12A9-208	ENST00000462106	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SLC12A9-208	ENST00000462106	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SLC12A9-208	ENST00000462106	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SLC12A9-208	ENST00000462106	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
SLC12A9-208	ENST00000462106	C3	P01024	1663 aa		31.64	■■■□□ 2.65
SLC12A9-208	ENST00000462106	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
SLC12A9-208	ENST00000462106	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SLC12A9-208	ENST00000462106	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SLC12A9-208	ENST00000462106	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SLC12A9-208	ENST00000462106	GGT6	Q6P531	493 aa		31.59	■■■□□ 2.65
SLC12A9-208	ENST00000462106	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.58	■■■□□ 2.65
SLC12A9-208	ENST00000462106	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
SLC12A9-208	ENST00000462106	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.65
SLC12A9-208	ENST00000462106	ABCC5	O15440	1437 aa		31.57	■■■□□ 2.64
SLC12A9-208	ENST00000462106	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SLC12A9-208	ENST00000462106	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SLC12A9-208	ENST00000462106	DAPK1	P53355	1430 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SLC12A9-208	ENST00000462106	KIF3B	O15066	747 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SLC12A9-208	ENST00000462106	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
SLC12A9-208	ENST00000462106	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
SLC12A9-208	ENST00000462106	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SLC12A9-208	ENST00000462106	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SLC12A9-208	ENST00000462106	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
SLC12A9-208	ENST00000462106	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
SLC12A9-208	ENST00000462106	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		31.45	■■■□□ 2.63
SLC12A9-208	ENST00000462106	HSPA2	P54652	639 aa		31.45	■■■□□ 2.63

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