RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXB3-202ENST00000460160 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.03■■■■□ 3.68
HOXB3-202ENST00000460160 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.01■■■■□ 3.68
HOXB3-202ENST00000460160 PREX2Q70Z35 1606 aa38■■■■□ 3.67
HOXB3-202ENST00000460160 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXB3-202ENST00000460160 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-202ENST00000460160 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.91■■■■□ 3.66
HOXB3-202ENST00000460160 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.9■■■■□ 3.66
HOXB3-202ENST00000460160 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.86■■■■□ 3.65
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXB3-202ENST00000460160 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.84■■■■□ 3.65
HOXB3-202ENST00000460160 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXB3-202ENST00000460160 ABCC1P33527 1531 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXB3-202ENST00000460160 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.65
HOXB3-202ENST00000460160 KDM5CP41229 1560 aa37.82■■■■□ 3.64
HOXB3-202ENST00000460160 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
HOXB3-202ENST00000460160 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.8■■■■□ 3.64
HOXB3-202ENST00000460160 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.8■■■■□ 3.64
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.8■■■■□ 3.64
HOXB3-202ENST00000460160 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.79■■■■□ 3.64
HOXB3-202ENST00000460160 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-202ENST00000460160 AFAP1Q8N556 730 aa37.78■■■■□ 3.64
HOXB3-202ENST00000460160 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-202ENST00000460160 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.73■■■■□ 3.63
HOXB3-202ENST00000460160 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.72■■■■□ 3.63
HOXB3-202ENST00000460160 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXB3-202ENST00000460160 TIAM1Q13009 1591 aa37.71■■■■□ 3.63
HOXB3-202ENST00000460160 ATP10AO60312 1499 aa37.7■■■■□ 3.63
HOXB3-202ENST00000460160 MADDQ8WXG6 1647 aa37.7■■■■□ 3.63
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
HOXB3-202ENST00000460160 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.66■■■■□ 3.62
HOXB3-202ENST00000460160 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.66■■■■□ 3.62
HOXB3-202ENST00000460160 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
HOXB3-202ENST00000460160 PTPRMP28827 1452 aa37.65■■■■□ 3.62
HOXB3-202ENST00000460160 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.64■■■■□ 3.62
HOXB3-202ENST00000460160 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.62■■■■□ 3.61
HOXB3-202ENST00000460160 ABCA6Q8N139 1617 aa37.61■■■■□ 3.61
HOXB3-202ENST00000460160 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.58■■■■□ 3.61
HOXB3-202ENST00000460160 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.58■■■■□ 3.61
HOXB3-202ENST00000460160 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.58■■■■□ 3.61
HOXB3-202ENST00000460160 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.58■■■■□ 3.61
HOXB3-202ENST00000460160 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.61
HOXB3-202ENST00000460160 NCOA2Q15596 1464 aa37.57■■■■□ 3.61
HOXB3-202ENST00000460160 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.56■■■■□ 3.62e-6■■■■□ 24.7
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.54■■■■□ 3.6
HOXB3-202ENST00000460160 REREQ9P2R6 1566 aa37.54■■■■□ 3.6
HOXB3-202ENST00000460160 MAP3K1Q13233 1512 aa37.52■■■■□ 3.6
HOXB3-202ENST00000460160 MLECQ14165 292 aa37.51■■■■□ 3.6
HOXB3-202ENST00000460160 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.5■■■■□ 3.59
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
HOXB3-202ENST00000460160 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
HOXB3-202ENST00000460160 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
HOXB3-202ENST00000460160 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
HOXB3-202ENST00000460160 MBD5Q9P267 1494 aa37.41■■■■□ 3.58
HOXB3-202ENST00000460160 ATP7AQ04656 1500 aa37.41■■■■□ 3.58
HOXB3-202ENST00000460160 AGLP35573 1532 aa37.4■■■■□ 3.58
HOXB3-202ENST00000460160 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.36■■■■□ 3.57
HOXB3-202ENST00000460160 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.28■■■■□ 3.56
HOXB3-202ENST00000460160 PLXNC1O60486 1568 aa37.27■■■■□ 3.56
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.26■■■■□ 3.55
HOXB3-202ENST00000460160 APLP2Q06481 763 aa37.25■■■■□ 3.55
HOXB3-202ENST00000460160 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.24■■■■□ 3.55
HOXB3-202ENST00000460160 A2MP01023 1474 aa37.23■■■■□ 3.55
HOXB3-202ENST00000460160 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.23■■■■□ 3.55
HOXB3-202ENST00000460160 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.22■■■■□ 3.55
HOXB3-202ENST00000460160 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.22■■■■□ 3.55
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.21■■■■□ 3.55
HOXB3-202ENST00000460160 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.18■■■■□ 3.54
HOXB3-202ENST00000460160 MIA2Q96PC5 1412 aa37.16■■■■□ 3.54
HOXB3-202ENST00000460160 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
HOXB3-202ENST00000460160 C3P01024 1663 aa37.12■■■■□ 3.53
HOXB3-202ENST00000460160 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
HOXB3-202ENST00000460160 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.09■■■■□ 3.53
HOXB3-202ENST00000460160 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.53
HOXB3-202ENST00000460160 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.06■■■■□ 3.52
HOXB3-202ENST00000460160 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
HOXB3-202ENST00000460160 MROH2AA6NES4 1674 aa37.04■■■■□ 3.52
HOXB3-202ENST00000460160 TSPY4P0CV99 314 aa37.03■■■■□ 3.52
HOXB3-202ENST00000460160 TSPY10P0CW01 314 aa37.03■■■■□ 3.52
HOXB3-202ENST00000460160 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.02■■■■□ 3.52
HOXB3-202ENST00000460160 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37■■■■□ 3.51
HOXB3-202ENST00000460160 HSPA2P54652 639 aa37■■■■□ 3.51
HOXB3-202ENST00000460160 GGT6Q6P531 493 aa37■■■■□ 3.51
HOXB3-202ENST00000460160 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
HOXB3-202ENST00000460160 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.96■■■■□ 3.51
HOXB3-202ENST00000460160 ZMYM3Q14202 1370 aa36.93■■■■□ 3.5
HOXB3-202ENST00000460160 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.91■■■■□ 3.5
HOXB3-202ENST00000460160 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.91■■■■□ 3.5
HOXB3-202ENST00000460160 KIF3BO15066 747 aa36.9■■■■□ 3.5
HOXB3-202ENST00000460160 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
HOXB3-202ENST00000460160 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXB3-202ENST00000460160 ABCC5O15440 1437 aa36.87■■■■□ 3.49
HOXB3-202ENST00000460160 NPATQ14207 1427 aa36.86■■■■□ 3.49
HOXB3-202ENST00000460160 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.84■■■■□ 3.49
HOXB3-202ENST00000460160 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
HOXB3-202ENST00000460160 DAPK1P53355 1430 aa36.81■■■■□ 3.48
HOXB3-202ENST00000460160 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.8■■■■□ 3.48
HOXB3-202ENST00000460160 PTPRKQ15262 1439 aa36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms