RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIF14Q15058 1648 aa17■□□□□ 0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa17■□□□□ 0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17■□□□□ 0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ATP10AO60312 1499 aa16.97■□□□□ 0.31
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.95■□□□□ 0.3
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.95■□□□□ 0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.92■□□□□ 0.3
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.9■□□□□ 0.3
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MLECQ14165 292 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AFAP1Q8N556 730 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.86■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HSPA2P54652 639 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ABCC1P33527 1531 aa16.85■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ABCA6Q8N139 1617 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AGLP35573 1532 aa16.83■□□□□ 0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.81■□□□□ 0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.81■□□□□ 0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C3P01024 1663 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 STRCQ7RTU9 1775 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CERKQ8TCT0 537 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MROH2AA6NES4 1674 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NPATQ14207 1427 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.63■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZMYM3Q14202 1370 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A2MP01023 1474 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TIAM1Q13009 1591 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NCOA1Q15788 1441 aa16.61■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.59■□□□□ 0.25
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.58■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.57■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.57■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MBD5Q9P267 1494 aa16.57■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.57■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CEP162Q5TB80 1403 aa16.57■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.56■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTPRKQ15262 1439 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLA2R1Q13018 1463 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GGT6Q6P531 493 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PKD2Q13563 968 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NCOA2Q15596 1464 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A2ML1A8K2U0 1454 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXB-AS3-202ENST00000460041 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
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