RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458729.5

SEMA3C-205, Transcript of semaphorin 3C, humanhuman

TSL 2

Gene SEMA3C, Length 1,318 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3C-205ENST00000458729 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.44■■■■■ 4.06
SEMA3C-205ENST00000458729 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
SEMA3C-205ENST00000458729 PREX2Q70Z35 1606 aa40.42■■■■■ 4.06
SEMA3C-205ENST00000458729 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
SEMA3C-205ENST00000458729 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.4■■■■■ 4.06
SEMA3C-205ENST00000458729 NCOA2Q15596 1464 aa40.39■■■■■ 4.06
SEMA3C-205ENST00000458729 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.39■■■■■ 4.06
SEMA3C-205ENST00000458729 ADGRL1O94910 1474 aa40.33■■■■■ 4.05
SEMA3C-205ENST00000458729 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
SEMA3C-205ENST00000458729 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
SEMA3C-205ENST00000458729 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.29■■■■■ 4.04
SEMA3C-205ENST00000458729 RAPGEF3O95398 923 aa40.29■■■■■ 4.04
SEMA3C-205ENST00000458729 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.27■■■■■ 4.04
SEMA3C-205ENST00000458729 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
SEMA3C-205ENST00000458729 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.17■■■■■ 4.02
SEMA3C-205ENST00000458729 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.17■■■■■ 4.02
SEMA3C-205ENST00000458729 RICTORQ6R327 1708 aa40.17■■■■■ 4.02
SEMA3C-205ENST00000458729 ABCC1P33527 1531 aa40.17■■■■■ 4.02
SEMA3C-205ENST00000458729 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.16■■■■■ 4.02
SEMA3C-205ENST00000458729 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.16■■■■■ 4.02
SEMA3C-205ENST00000458729 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.12■■■■■ 4.01
SEMA3C-205ENST00000458729 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.11■■■■■ 4.01
SEMA3C-205ENST00000458729 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.11■■■■■ 4.01
SEMA3C-205ENST00000458729 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.1■■■■■ 4.01
SEMA3C-205ENST00000458729 MIA2Q96PC5 1412 aa40.07■■■■■ 4.01
SEMA3C-205ENST00000458729 AFAP1Q8N556 730 aa40.07■■■■■ 4
SEMA3C-205ENST00000458729 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
SEMA3C-205ENST00000458729 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.06■■■■■ 4
SEMA3C-205ENST00000458729 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.05■■■■■ 4
SEMA3C-205ENST00000458729 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.04■■■■■ 4
SEMA3C-205ENST00000458729 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.04■■■■■ 4
SEMA3C-205ENST00000458729 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.04■■■■■ 4
SEMA3C-205ENST00000458729 KDM5CP41229 1560 aa40■■■■□ 3.99
SEMA3C-205ENST00000458729 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.99■■■■□ 3.99
SEMA3C-205ENST00000458729 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.94■■■■□ 3.98
SEMA3C-205ENST00000458729 MBD5Q9P267 1494 aa39.94■■■■□ 3.98
SEMA3C-205ENST00000458729 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.93■■■■□ 3.98
SEMA3C-205ENST00000458729 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.92■■■■□ 3.98
SEMA3C-205ENST00000458729 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.92■■■■□ 3.98
SEMA3C-205ENST00000458729 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
SEMA3C-205ENST00000458729 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.91■■■■□ 3.98
SEMA3C-205ENST00000458729 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.9■■■■□ 3.98
SEMA3C-205ENST00000458729 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.88■■■■□ 3.98
SEMA3C-205ENST00000458729 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.88■■■■□ 3.97
SEMA3C-205ENST00000458729 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
SEMA3C-205ENST00000458729 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.83■■■■□ 3.97
SEMA3C-205ENST00000458729 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.83■■■■□ 3.97
SEMA3C-205ENST00000458729 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.82■■■■□ 3.97
SEMA3C-205ENST00000458729 ATP10AO60312 1499 aa39.8■■■■□ 3.96
SEMA3C-205ENST00000458729 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
SEMA3C-205ENST00000458729 TSPY4P0CV99 314 aa39.76■■■■□ 3.96
SEMA3C-205ENST00000458729 TSPY10P0CW01 314 aa39.76■■■■□ 3.96
SEMA3C-205ENST00000458729 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.76■■■■□ 3.96
SEMA3C-205ENST00000458729 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.74■■■■□ 3.95
SEMA3C-205ENST00000458729 ATP7AQ04656 1500 aa39.74■■■■□ 3.95
SEMA3C-205ENST00000458729 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.73■■■■□ 3.95
SEMA3C-205ENST00000458729 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
SEMA3C-205ENST00000458729 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.72■■■■□ 3.95
SEMA3C-205ENST00000458729 ABCA6Q8N139 1617 aa39.7■■■■□ 3.95
SEMA3C-205ENST00000458729 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
SEMA3C-205ENST00000458729 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
SEMA3C-205ENST00000458729 REREQ9P2R6 1566 aa39.64■■■■□ 3.94
SEMA3C-205ENST00000458729 ABCC5O15440 1437 aa39.61■■■■□ 3.93
SEMA3C-205ENST00000458729 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.6■■■■□ 3.93
SEMA3C-205ENST00000458729 DAPK1P53355 1430 aa39.6■■■■□ 3.93
SEMA3C-205ENST00000458729 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
SEMA3C-205ENST00000458729 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.58■■■■□ 3.93
SEMA3C-205ENST00000458729 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.56■■■■□ 3.92
SEMA3C-205ENST00000458729 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.55■■■■□ 3.92
SEMA3C-205ENST00000458729 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.54■■■■□ 3.92
SEMA3C-205ENST00000458729 A2MP01023 1474 aa39.54■■■■□ 3.92
SEMA3C-205ENST00000458729 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.53■■■■□ 3.92
SEMA3C-205ENST00000458729 AGLP35573 1532 aa39.53■■■■□ 3.92
SEMA3C-205ENST00000458729 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.52■■■■□ 3.92
SEMA3C-205ENST00000458729 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
SEMA3C-205ENST00000458729 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.5■■■■□ 3.91
SEMA3C-205ENST00000458729 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
SEMA3C-205ENST00000458729 PLXNC1O60486 1568 aa39.46■■■■□ 3.91
SEMA3C-205ENST00000458729 MLECQ14165 292 aa39.44■■■■□ 3.9
SEMA3C-205ENST00000458729 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.43■■■■□ 3.9
SEMA3C-205ENST00000458729 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.41■■■■□ 3.9
SEMA3C-205ENST00000458729 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.39■■■■□ 3.9
SEMA3C-205ENST00000458729 KIF15Q9NS87 1388 aa39.35■■■■□ 3.89
SEMA3C-205ENST00000458729 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.35■■■■□ 3.89
SEMA3C-205ENST00000458729 ADGRL2O95490 1459 aa39.34■■■■□ 3.89
SEMA3C-205ENST00000458729 NCOA1Q15788 1441 aa39.34■■■■□ 3.89
SEMA3C-205ENST00000458729 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
SEMA3C-205ENST00000458729 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.32■■■■□ 3.89
SEMA3C-205ENST00000458729 PTPRKQ15262 1439 aa39.31■■■■□ 3.88
SEMA3C-205ENST00000458729 MADDQ8WXG6 1647 aa39.31■■■■□ 3.88
SEMA3C-205ENST00000458729 ITGAEP38570 1179 aa39.3■■■■□ 3.88
SEMA3C-205ENST00000458729 KIF3BO15066 747 aa39.29■■■■□ 3.88
SEMA3C-205ENST00000458729 GGT6Q6P531 493 aa39.26■■■■□ 3.88
SEMA3C-205ENST00000458729 ROCK1Q13464 1354 aa39.25■■■■□ 3.87
SEMA3C-205ENST00000458729 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
SEMA3C-205ENST00000458729 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.24■■■■□ 3.87
SEMA3C-205ENST00000458729 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.23■■■■□ 3.87
SEMA3C-205ENST00000458729 ERBINQ96RT1 1412 aa39.23■■■■□ 3.87
SEMA3C-205ENST00000458729 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
SEMA3C-205ENST00000458729 PTPRMP28827 1452 aa39.2■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms