RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
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SH3BP4-207ENST00000454947 TSPOAP1O95153 1857 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-207ENST00000454947 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-207ENST00000454947 CD109Q6YHK3 1445 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-207ENST00000454947 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-207ENST00000454947 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-207ENST00000454947 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-207ENST00000454947 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-207ENST00000454947 NEO1Q92859 1461 aa14.5□□□□□ -0.09
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SH3BP4-207ENST00000454947 FANCAO15360 1455 aa14.48□□□□□ -0.09
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SH3BP4-207ENST00000454947 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.4□□□□□ -0.1
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SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.35□□□□□ -0.11
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SH3BP4-207ENST00000454947 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.29□□□□□ -0.12
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SH3BP4-207ENST00000454947 ITGAEP38570 1179 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-207ENST00000454947 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-207ENST00000454947 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-207ENST00000454947 UNC13BO14795 1591 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-207ENST00000454947 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.13□□□□□ -0.15
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SH3BP4-207ENST00000454947 HRCP23327 699 aa14.12□□□□□ -0.15
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