RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.34■■■■■ 4.21
CITED1-210ENST00000454225 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.33■■■■■ 4.21
CITED1-210ENST00000454225 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.32■■■■■ 4.21
CITED1-210ENST00000454225 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.32■■■■■ 4.2
CITED1-210ENST00000454225 PREX2Q70Z35 1606 aa41.32■■■■■ 4.2
CITED1-210ENST00000454225 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.25■■■■■ 4.19
CITED1-210ENST00000454225 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.25■■■■■ 4.19
CITED1-210ENST00000454225 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.23■■■■■ 4.19
CITED1-210ENST00000454225 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.22■■■■■ 4.19
CITED1-210ENST00000454225 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.21■■■■■ 4.19
CITED1-210ENST00000454225 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.19
CITED1-210ENST00000454225 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.16■■■■■ 4.18
CITED1-210ENST00000454225 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CITED1-210ENST00000454225 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.15■■■■■ 4.18
CITED1-210ENST00000454225 ABCC1P33527 1531 aa41.14■■■■■ 4.18
CITED1-210ENST00000454225 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.14■■■■■ 4.18
CITED1-210ENST00000454225 AFAP1Q8N556 730 aa41.13■■■■■ 4.17
CITED1-210ENST00000454225 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.1■■■■■ 4.17
CITED1-210ENST00000454225 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.1■■■■■ 4.17
CITED1-210ENST00000454225 KDM5CP41229 1560 aa41.09■■■■■ 4.17
CITED1-210ENST00000454225 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
CITED1-210ENST00000454225 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.09■■■■■ 4.17
CITED1-210ENST00000454225 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.08■■■■■ 4.17
CITED1-210ENST00000454225 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.07■■■■■ 4.16
CITED1-210ENST00000454225 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.05■■■■■ 4.16
CITED1-210ENST00000454225 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.03■■■■■ 4.16
CITED1-210ENST00000454225 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.03■■■■■ 4.16
CITED1-210ENST00000454225 TIAM1Q13009 1591 aa41.03■■■■■ 4.16
CITED1-210ENST00000454225 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
CITED1-210ENST00000454225 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.02■■■■■ 4.16
CITED1-210ENST00000454225 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.02■■■■■ 4.16
CITED1-210ENST00000454225 ATP10AO60312 1499 aa41.01■■■■■ 4.16
CITED1-210ENST00000454225 MADDQ8WXG6 1647 aa40.97■■■■■ 4.15
CITED1-210ENST00000454225 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.97■■■■■ 4.15
CITED1-210ENST00000454225 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.96■■■■■ 4.15
CITED1-210ENST00000454225 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.94■■■■■ 4.14
CITED1-210ENST00000454225 PTPRMP28827 1452 aa40.93■■■■■ 4.14
CITED1-210ENST00000454225 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CITED1-210ENST00000454225 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.91■■■■■ 4.14
CITED1-210ENST00000454225 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.9■■■■■ 4.14
CITED1-210ENST00000454225 NCOA2Q15596 1464 aa40.9■■■■■ 4.14
CITED1-210ENST00000454225 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.9■■■■■ 4.14
CITED1-210ENST00000454225 MLECQ14165 292 aa40.89■■■■■ 4.14
CITED1-210ENST00000454225 ABCA6Q8N139 1617 aa40.88■■■■■ 4.13
CITED1-210ENST00000454225 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.87■■■■■ 4.13
CITED1-210ENST00000454225 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
CITED1-210ENST00000454225 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.85■■■■■ 4.13
CITED1-210ENST00000454225 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.83■■■■■ 4.13
CITED1-210ENST00000454225 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
CITED1-210ENST00000454225 MAP3K1Q13233 1512 aa40.82■■■■■ 4.12
CITED1-210ENST00000454225 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
CITED1-210ENST00000454225 REREQ9P2R6 1566 aa40.78■■■■■ 4.12
CITED1-210ENST00000454225 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
CITED1-210ENST00000454225 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.74■■■■■ 4.11
CITED1-210ENST00000454225 ATP7AQ04656 1500 aa40.69■■■■■ 4.1
CITED1-210ENST00000454225 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.68■■■■■ 4.1
CITED1-210ENST00000454225 MBD5Q9P267 1494 aa40.68■■■■■ 4.1
CITED1-210ENST00000454225 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CITED1-210ENST00000454225 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.66■■■■■ 4.1
CITED1-210ENST00000454225 APLP2Q06481 763 aa40.66■■■■■ 4.1
CITED1-210ENST00000454225 AGLP35573 1532 aa40.66■■■■■ 4.1
CITED1-210ENST00000454225 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.55■■■■■ 4.08
CITED1-210ENST00000454225 A2MP01023 1474 aa40.52■■■■■ 4.08
CITED1-210ENST00000454225 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.51■■■■■ 4.08
CITED1-210ENST00000454225 PLXNC1O60486 1568 aa40.49■■■■■ 4.07
CITED1-210ENST00000454225 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.49■■■■■ 4.07
CITED1-210ENST00000454225 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.47■■■■■ 4.07
CITED1-210ENST00000454225 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
CITED1-210ENST00000454225 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.46■■■■■ 4.07
CITED1-210ENST00000454225 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.46■■■■■ 4.07
CITED1-210ENST00000454225 MIA2Q96PC5 1412 aa40.45■■■■■ 4.07
CITED1-210ENST00000454225 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
CITED1-210ENST00000454225 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.45■■■■■ 4.07
CITED1-210ENST00000454225 TSPY4P0CV99 314 aa40.35■■■■■ 4.05
CITED1-210ENST00000454225 TSPY10P0CW01 314 aa40.35■■■■■ 4.05
CITED1-210ENST00000454225 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.34■■■■■ 4.05
CITED1-210ENST00000454225 C3P01024 1663 aa40.34■■■■■ 4.05
CITED1-210ENST00000454225 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
CITED1-210ENST00000454225 GGT6Q6P531 493 aa40.31■■■■■ 4.04
CITED1-210ENST00000454225 HSPA2P54652 639 aa40.27■■■■■ 4.04
CITED1-210ENST00000454225 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.27■■■■■ 4.04
CITED1-210ENST00000454225 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.25■■■■■ 4.03
CITED1-210ENST00000454225 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.25■■■■■ 4.03
CITED1-210ENST00000454225 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.24■■■■■ 4.03
CITED1-210ENST00000454225 MROH2AA6NES4 1674 aa40.23■■■■■ 4.03
CITED1-210ENST00000454225 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CITED1-210ENST00000454225 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
CITED1-210ENST00000454225 KIF3BO15066 747 aa40.2■■■■■ 4.03
CITED1-210ENST00000454225 ZMYM3Q14202 1370 aa40.19■■■■■ 4.02
CITED1-210ENST00000454225 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.16■■■■■ 4.02
CITED1-210ENST00000454225 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.15■■■■■ 4.02
CITED1-210ENST00000454225 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
CITED1-210ENST00000454225 ABCC5O15440 1437 aa40.13■■■■■ 4.01
CITED1-210ENST00000454225 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.11■■■■■ 4.01
CITED1-210ENST00000454225 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.08■■■■■ 4.01
CITED1-210ENST00000454225 DAPK1P53355 1430 aa40.08■■■■■ 4.01
CITED1-210ENST00000454225 NPATQ14207 1427 aa40.08■■■■■ 4.01
CITED1-210ENST00000454225 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
CITED1-210ENST00000454225 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.01■■■■□ 3.99
CITED1-210ENST00000454225 PTPRKQ15262 1439 aa40■■■■□ 3.99
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