RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452514.6

MEG3-211, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MEG3, Length 461 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-211ENST00000452514 APLP2Q06481 763 aa28■■■□□ 2.07
MEG3-211ENST00000452514 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.99■■■□□ 2.07
MEG3-211ENST00000452514 NCOA2Q15596 1464 aa27.99■■■□□ 2.07
MEG3-211ENST00000452514 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
MEG3-211ENST00000452514 AKNAQ7Z591 1439 aa27.98■■■□□ 2.07
MEG3-211ENST00000452514 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.96■■■□□ 2.07
MEG3-211ENST00000452514 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.94■■■□□ 2.06
MEG3-211ENST00000452514 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.91■■■□□ 2.06
MEG3-211ENST00000452514 ADGRL1O94910 1474 aa27.9■■■□□ 2.06
MEG3-211ENST00000452514 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.9■■■□□ 2.06
MEG3-211ENST00000452514 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
MEG3-211ENST00000452514 ABCC1P33527 1531 aa27.86■■■□□ 2.05
MEG3-211ENST00000452514 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.86■■■□□ 2.05
MEG3-211ENST00000452514 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.85■■■□□ 2.05
MEG3-211ENST00000452514 RICTORQ6R327 1708 aa27.85■■■□□ 2.05
MEG3-211ENST00000452514 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
MEG3-211ENST00000452514 RAPGEF3O95398 923 aa27.83■■■□□ 2.05
MEG3-211ENST00000452514 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.83■■■□□ 2.05
MEG3-211ENST00000452514 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.8■■■□□ 2.04
MEG3-211ENST00000452514 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
MEG3-211ENST00000452514 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.77■■■□□ 2.04
MEG3-211ENST00000452514 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.77■■■□□ 2.04
MEG3-211ENST00000452514 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.76■■■□□ 2.03
MEG3-211ENST00000452514 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.76■■■□□ 2.03
MEG3-211ENST00000452514 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.74■■■□□ 2.03
MEG3-211ENST00000452514 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.74■■■□□ 2.03
MEG3-211ENST00000452514 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.73■■■□□ 2.03
MEG3-211ENST00000452514 KDM5CP41229 1560 aa27.73■■■□□ 2.03
MEG3-211ENST00000452514 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
MEG3-211ENST00000452514 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.72■■■□□ 2.03
MEG3-211ENST00000452514 MIA2Q96PC5 1412 aa27.71■■■□□ 2.03
MEG3-211ENST00000452514 AFAP1Q8N556 730 aa27.68■■■□□ 2.02
MEG3-211ENST00000452514 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.67■■■□□ 2.02
MEG3-211ENST00000452514 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
MEG3-211ENST00000452514 MBD5Q9P267 1494 aa27.67■■■□□ 2.02
MEG3-211ENST00000452514 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.66■■■□□ 2.02
MEG3-211ENST00000452514 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.65■■■□□ 2.02
MEG3-211ENST00000452514 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.64■■■□□ 2.02
MEG3-211ENST00000452514 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
MEG3-211ENST00000452514 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.64■■■□□ 2.01
MEG3-211ENST00000452514 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.63■■■□□ 2.01
MEG3-211ENST00000452514 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.62■■■□□ 2.01
MEG3-211ENST00000452514 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.61■■■□□ 2.01
MEG3-211ENST00000452514 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.6■■■□□ 2.01
MEG3-211ENST00000452514 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
MEG3-211ENST00000452514 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.57■■■□□ 2
MEG3-211ENST00000452514 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.57■■■□□ 2
MEG3-211ENST00000452514 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
MEG3-211ENST00000452514 ABCA6Q8N139 1617 aa27.54■■■□□ 2
MEG3-211ENST00000452514 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.54■■■□□ 2
MEG3-211ENST00000452514 ATP7AQ04656 1500 aa27.53■■■□□ 2
MEG3-211ENST00000452514 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
MEG3-211ENST00000452514 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.51■■□□□ 1.99
MEG3-211ENST00000452514 ATP10AO60312 1499 aa27.51■■□□□ 1.99
MEG3-211ENST00000452514 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.49■■□□□ 1.99
MEG3-211ENST00000452514 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.48■■□□□ 1.99
MEG3-211ENST00000452514 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.48■■□□□ 1.99
MEG3-211ENST00000452514 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.47■■□□□ 1.99
MEG3-211ENST00000452514 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
MEG3-211ENST00000452514 REREQ9P2R6 1566 aa27.46■■□□□ 1.99
MEG3-211ENST00000452514 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.45■■□□□ 1.99
MEG3-211ENST00000452514 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.45■■□□□ 1.98
MEG3-211ENST00000452514 ABCC5O15440 1437 aa27.44■■□□□ 1.98
MEG3-211ENST00000452514 DAPK1P53355 1430 aa27.42■■□□□ 1.98
MEG3-211ENST00000452514 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.41■■□□□ 1.98
MEG3-211ENST00000452514 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
MEG3-211ENST00000452514 TSPY4P0CV99 314 aa27.39■■□□□ 1.98
MEG3-211ENST00000452514 TSPY10P0CW01 314 aa27.39■■□□□ 1.98
MEG3-211ENST00000452514 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.39■■□□□ 1.97
MEG3-211ENST00000452514 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
MEG3-211ENST00000452514 PLXNC1O60486 1568 aa27.37■■□□□ 1.97
MEG3-211ENST00000452514 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.36■■□□□ 1.97
MEG3-211ENST00000452514 A2MP01023 1474 aa27.36■■□□□ 1.97
MEG3-211ENST00000452514 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
MEG3-211ENST00000452514 AGLP35573 1532 aa27.36■■□□□ 1.97
MEG3-211ENST00000452514 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
MEG3-211ENST00000452514 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.34■■□□□ 1.97
MEG3-211ENST00000452514 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.31■■□□□ 1.96
MEG3-211ENST00000452514 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
MEG3-211ENST00000452514 PTPRKQ15262 1439 aa27.27■■□□□ 1.96
MEG3-211ENST00000452514 ADGRL2O95490 1459 aa27.26■■□□□ 1.95
MEG3-211ENST00000452514 MADDQ8WXG6 1647 aa27.24■■□□□ 1.95
MEG3-211ENST00000452514 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.24■■□□□ 1.95
MEG3-211ENST00000452514 KIF15Q9NS87 1388 aa27.22■■□□□ 1.95
MEG3-211ENST00000452514 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.22■■□□□ 1.95
MEG3-211ENST00000452514 MLECQ14165 292 aa27.22■■□□□ 1.95
MEG3-211ENST00000452514 NCOA1Q15788 1441 aa27.22■■□□□ 1.95
MEG3-211ENST00000452514 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.22■■□□□ 1.95
MEG3-211ENST00000452514 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.18■■□□□ 1.94
MEG3-211ENST00000452514 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.18■■□□□ 1.94
MEG3-211ENST00000452514 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
MEG3-211ENST00000452514 ITGAEP38570 1179 aa27.16■■□□□ 1.94
MEG3-211ENST00000452514 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
MEG3-211ENST00000452514 ROCK1Q13464 1354 aa27.15■■□□□ 1.94
MEG3-211ENST00000452514 ERBINQ96RT1 1412 aa27.15■■□□□ 1.94
MEG3-211ENST00000452514 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
MEG3-211ENST00000452514 KIF3BO15066 747 aa27.12■■□□□ 1.93
MEG3-211ENST00000452514 PTPRMP28827 1452 aa27.11■■□□□ 1.93
MEG3-211ENST00000452514 GGT6Q6P531 493 aa27.08■■□□□ 1.93
MEG3-211ENST00000452514 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms