RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452174.5

CERKL-208, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CERKL, Length 1,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-208ENST00000452174 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.91■■■□□ 2.54
CERKL-208ENST00000452174 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.9■■■□□ 2.54
CERKL-208ENST00000452174 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.9■■■□□ 2.54
CERKL-208ENST00000452174 PREX2Q70Z35 1606 aa30.89■■■□□ 2.54
CERKL-208ENST00000452174 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.86■■■□□ 2.53
CERKL-208ENST00000452174 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.85■■■□□ 2.53
CERKL-208ENST00000452174 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.84■■■□□ 2.53
CERKL-208ENST00000452174 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.82■■■□□ 2.52
CERKL-208ENST00000452174 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
CERKL-208ENST00000452174 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.79■■■□□ 2.52
CERKL-208ENST00000452174 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.77■■■□□ 2.52
CERKL-208ENST00000452174 TIAM1Q13009 1591 aa30.77■■■□□ 2.52
CERKL-208ENST00000452174 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.76■■■□□ 2.52
CERKL-208ENST00000452174 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.75■■■□□ 2.51
CERKL-208ENST00000452174 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.75■■■□□ 2.51
CERKL-208ENST00000452174 ABCC1P33527 1531 aa30.74■■■□□ 2.51
CERKL-208ENST00000452174 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.73■■■□□ 2.51
CERKL-208ENST00000452174 AFAP1Q8N556 730 aa30.73■■■□□ 2.51
CERKL-208ENST00000452174 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
CERKL-208ENST00000452174 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.72■■■□□ 2.51
CERKL-208ENST00000452174 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 KDM5CP41229 1560 aa30.7■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.69■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.68■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.67■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 MAP3K1Q13233 1512 aa30.66■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 NCOA2Q15596 1464 aa30.64■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.64■■■□□ 2.5
CERKL-208ENST00000452174 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.62■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.61■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.61■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.61■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 ATP10AO60312 1499 aa30.6■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.6■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.6■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.59■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.59■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.59■■■□□ 2.49
CERKL-208ENST00000452174 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.57■■■□□ 2.48
CERKL-208ENST00000452174 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CERKL-208ENST00000452174 APLP2Q06481 763 aa30.54■■■□□ 2.48
CERKL-208ENST00000452174 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.54■■■□□ 2.48
CERKL-208ENST00000452174 ABCA6Q8N139 1617 aa30.52■■■□□ 2.48
CERKL-208ENST00000452174 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.5■■■□□ 2.47
CERKL-208ENST00000452174 MADDQ8WXG6 1647 aa30.5■■■□□ 2.47
CERKL-208ENST00000452174 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
CERKL-208ENST00000452174 MLECQ14165 292 aa30.47■■■□□ 2.47
CERKL-208ENST00000452174 REREQ9P2R6 1566 aa30.46■■■□□ 2.47
CERKL-208ENST00000452174 PTPRMP28827 1452 aa30.46■■■□□ 2.47
CERKL-208ENST00000452174 MBD5Q9P267 1494 aa30.46■■■□□ 2.47
CERKL-208ENST00000452174 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.43■■■□□ 2.46
CERKL-208ENST00000452174 ATP7AQ04656 1500 aa30.41■■■□□ 2.46
CERKL-208ENST00000452174 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
CERKL-208ENST00000452174 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CERKL-208ENST00000452174 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.37■■■□□ 2.45
CERKL-208ENST00000452174 AGLP35573 1532 aa30.36■■■□□ 2.45
CERKL-208ENST00000452174 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.35■■■□□ 2.45
CERKL-208ENST00000452174 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.34■■■□□ 2.45
CERKL-208ENST00000452174 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.34■■■□□ 2.45
CERKL-208ENST00000452174 MIA2Q96PC5 1412 aa30.33■■■□□ 2.45
CERKL-208ENST00000452174 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.31■■■□□ 2.44
CERKL-208ENST00000452174 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.3■■■□□ 2.44
CERKL-208ENST00000452174 A2MP01023 1474 aa30.28■■■□□ 2.44
CERKL-208ENST00000452174 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.25■■■□□ 2.43
CERKL-208ENST00000452174 PLXNC1O60486 1568 aa30.25■■■□□ 2.43
CERKL-208ENST00000452174 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.25■■■□□ 2.43
CERKL-208ENST00000452174 TSPY4P0CV99 314 aa30.22■■■□□ 2.43
CERKL-208ENST00000452174 TSPY10P0CW01 314 aa30.22■■■□□ 2.43
CERKL-208ENST00000452174 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.18■■■□□ 2.42
CERKL-208ENST00000452174 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CERKL-208ENST00000452174 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.16■■■□□ 2.42
CERKL-208ENST00000452174 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CERKL-208ENST00000452174 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
CERKL-208ENST00000452174 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.14■■■□□ 2.42
CERKL-208ENST00000452174 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
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CERKL-208ENST00000452174 GGT6Q6P531 493 aa30.11■■■□□ 2.41
CERKL-208ENST00000452174 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.08■■■□□ 2.41
CERKL-208ENST00000452174 C3P01024 1663 aa30.07■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 ABCC5O15440 1437 aa30.07■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 KIF3BO15066 747 aa30.05■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.04■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 DAPK1P53355 1430 aa30.03■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 MROH2AA6NES4 1674 aa30.03■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.03■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.02■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
CERKL-208ENST00000452174 ZMYM3Q14202 1370 aa30■■■□□ 2.39
CERKL-208ENST00000452174 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CERKL-208ENST00000452174 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.97■■■□□ 2.39
CERKL-208ENST00000452174 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CERKL-208ENST00000452174 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CERKL-208ENST00000452174 HSPA2P54652 639 aa29.95■■■□□ 2.38
CERKL-208ENST00000452174 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.94■■■□□ 2.38
CERKL-208ENST00000452174 KIF15Q9NS87 1388 aa29.92■■■□□ 2.38
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