RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450602.6

CXorf40A-211, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 3 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-211ENST00000450602 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.22■■□□□ 1.47
CXorf40A-211ENST00000450602 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.22■■□□□ 1.47
CXorf40A-211ENST00000450602 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.21■■□□□ 1.47
CXorf40A-211ENST00000450602 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CXorf40A-211ENST00000450602 TIAM1Q13009 1591 aa24.2■■□□□ 1.46
CXorf40A-211ENST00000450602 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CXorf40A-211ENST00000450602 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CXorf40A-211ENST00000450602 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CXorf40A-211ENST00000450602 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.13■■□□□ 1.45
CXorf40A-211ENST00000450602 PREX2Q70Z35 1606 aa24.13■■□□□ 1.45
CXorf40A-211ENST00000450602 MAP3K1Q13233 1512 aa24.12■■□□□ 1.45
CXorf40A-211ENST00000450602 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.11■■□□□ 1.45
CXorf40A-211ENST00000450602 AFAP1Q8N556 730 aa24.11■■□□□ 1.45
CXorf40A-211ENST00000450602 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.1■■□□□ 1.45
CXorf40A-211ENST00000450602 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CXorf40A-211ENST00000450602 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CXorf40A-211ENST00000450602 NCOA2Q15596 1464 aa24.09■■□□□ 1.45
CXorf40A-211ENST00000450602 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.08■■□□□ 1.44
CXorf40A-211ENST00000450602 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
CXorf40A-211ENST00000450602 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.05■■□□□ 1.44
CXorf40A-211ENST00000450602 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.05■■□□□ 1.44
CXorf40A-211ENST00000450602 RICTORQ6R327 1708 aa24.04■■□□□ 1.44
CXorf40A-211ENST00000450602 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.02■■□□□ 1.44
CXorf40A-211ENST00000450602 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CXorf40A-211ENST00000450602 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.02■■□□□ 1.44
CXorf40A-211ENST00000450602 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.01■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 ABCC1P33527 1531 aa24■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.99■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.98■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.98■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.98■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.97■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.97■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.96■■□□□ 1.43
CXorf40A-211ENST00000450602 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.93■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.92■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 ATP10AO60312 1499 aa23.92■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 MLECQ14165 292 aa23.91■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.91■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 TSPY4P0CV99 314 aa23.9■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 TSPY10P0CW01 314 aa23.9■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 KDM5CP41229 1560 aa23.9■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.89■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.89■■□□□ 1.42
CXorf40A-211ENST00000450602 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.89■■□□□ 1.41
CXorf40A-211ENST00000450602 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.87■■□□□ 1.41
CXorf40A-211ENST00000450602 MIA2Q96PC5 1412 aa23.87■■□□□ 1.41
CXorf40A-211ENST00000450602 MBD5Q9P267 1494 aa23.83■■□□□ 1.41
CXorf40A-211ENST00000450602 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.81■■□□□ 1.4
CXorf40A-211ENST00000450602 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CXorf40A-211ENST00000450602 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CXorf40A-211ENST00000450602 ATP7AQ04656 1500 aa23.79■■□□□ 1.4
CXorf40A-211ENST00000450602 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.78■■□□□ 1.4
CXorf40A-211ENST00000450602 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.78■■□□□ 1.4
CXorf40A-211ENST00000450602 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.77■■□□□ 1.4
CXorf40A-211ENST00000450602 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.76■■□□□ 1.39
CXorf40A-211ENST00000450602 ABCA6Q8N139 1617 aa23.76■■□□□ 1.39
CXorf40A-211ENST00000450602 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.75■■□□□ 1.39
CXorf40A-211ENST00000450602 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.74■■□□□ 1.39
CXorf40A-211ENST00000450602 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.73■■□□□ 1.39
CXorf40A-211ENST00000450602 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.73■■□□□ 1.39
CXorf40A-211ENST00000450602 A2MP01023 1474 aa23.71■■□□□ 1.39
CXorf40A-211ENST00000450602 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 GGT6Q6P531 493 aa23.69■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.69■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 REREQ9P2R6 1566 aa23.69■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.67■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.67■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 MADDQ8WXG6 1647 aa23.66■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 AGLP35573 1532 aa23.65■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 PTPRMP28827 1452 aa23.65■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 KIF3BO15066 747 aa23.65■■□□□ 1.38
CXorf40A-211ENST00000450602 ABCC5O15440 1437 aa23.64■■□□□ 1.37
CXorf40A-211ENST00000450602 DAPK1P53355 1430 aa23.63■■□□□ 1.37
CXorf40A-211ENST00000450602 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.63■■□□□ 1.37
CXorf40A-211ENST00000450602 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.63■■□□□ 1.37
CXorf40A-211ENST00000450602 ITGAEP38570 1179 aa23.62■■□□□ 1.37
CXorf40A-211ENST00000450602 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CXorf40A-211ENST00000450602 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.58■■□□□ 1.37
CXorf40A-211ENST00000450602 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CXorf40A-211ENST00000450602 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.57■■□□□ 1.36
CXorf40A-211ENST00000450602 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.57■■□□□ 1.36
CXorf40A-211ENST00000450602 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CXorf40A-211ENST00000450602 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.56■■□□□ 1.36
CXorf40A-211ENST00000450602 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.55■■□□□ 1.36
CXorf40A-211ENST00000450602 PLXNC1O60486 1568 aa23.55■■□□□ 1.36
CXorf40A-211ENST00000450602 KIF15Q9NS87 1388 aa23.54■■□□□ 1.36
CXorf40A-211ENST00000450602 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.53■■□□□ 1.36
CXorf40A-211ENST00000450602 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.52■■□□□ 1.36
CXorf40A-211ENST00000450602 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.5■■□□□ 1.35
CXorf40A-211ENST00000450602 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.49■■□□□ 1.35
CXorf40A-211ENST00000450602 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
CXorf40A-211ENST00000450602 ZMYM3Q14202 1370 aa23.48■■□□□ 1.35
CXorf40A-211ENST00000450602 NCOA1Q15788 1441 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms