RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449684.6

LIMS1-210, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene LIMS1, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-210ENST00000449684 RICTORQ6R327 1708 aa24.79■■□□□ 1.56
LIMS1-210ENST00000449684 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.74■■□□□ 1.55
LIMS1-210ENST00000449684 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.73■■□□□ 1.55
LIMS1-210ENST00000449684 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.72■■□□□ 1.55
LIMS1-210ENST00000449684 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.71■■□□□ 1.55
LIMS1-210ENST00000449684 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.7■■□□□ 1.55
LIMS1-210ENST00000449684 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.7■■□□□ 1.54
LIMS1-210ENST00000449684 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.7■■□□□ 1.54
LIMS1-210ENST00000449684 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
LIMS1-210ENST00000449684 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-210ENST00000449684 PREX2Q70Z35 1606 aa24.67■■□□□ 1.54
LIMS1-210ENST00000449684 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-210ENST00000449684 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.66■■□□□ 1.54
LIMS1-210ENST00000449684 AFAP1Q8N556 730 aa24.65■■□□□ 1.54
LIMS1-210ENST00000449684 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.63■■□□□ 1.53
LIMS1-210ENST00000449684 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.62■■□□□ 1.53
LIMS1-210ENST00000449684 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-210ENST00000449684 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-210ENST00000449684 MLECQ14165 292 aa24.59■■□□□ 1.53
LIMS1-210ENST00000449684 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
LIMS1-210ENST00000449684 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.59■■□□□ 1.53
LIMS1-210ENST00000449684 ATP10AO60312 1499 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-210ENST00000449684 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-210ENST00000449684 ABCC1P33527 1531 aa24.57■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.56■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 PTPRMP28827 1452 aa24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 KDM5CP41229 1560 aa24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 MADDQ8WXG6 1647 aa24.53■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.53■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.53■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.52■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
LIMS1-210ENST00000449684 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.5■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.5■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.5■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.48■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 TIAM1Q13009 1591 aa24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.47■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.45■■□□□ 1.51
LIMS1-210ENST00000449684 APLP2Q06481 763 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-210ENST00000449684 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.45■■□□□ 1.5
LIMS1-210ENST00000449684 NCOA2Q15596 1464 aa24.43■■□□□ 1.5
LIMS1-210ENST00000449684 ABCA6Q8N139 1617 aa24.42■■□□□ 1.5
LIMS1-210ENST00000449684 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-210ENST00000449684 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
LIMS1-210ENST00000449684 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.4■■□□□ 1.5
LIMS1-210ENST00000449684 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.39■■□□□ 1.5
LIMS1-210ENST00000449684 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.39■■□□□ 1.49
LIMS1-210ENST00000449684 REREQ9P2R6 1566 aa24.37■■□□□ 1.49
LIMS1-210ENST00000449684 MAP3K1Q13233 1512 aa24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-210ENST00000449684 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-210ENST00000449684 ATP7AQ04656 1500 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-210ENST00000449684 AGLP35573 1532 aa24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-210ENST00000449684 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.3■■□□□ 1.48
LIMS1-210ENST00000449684 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.3■■□□□ 1.48
LIMS1-210ENST00000449684 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-210ENST00000449684 MBD5Q9P267 1494 aa24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-210ENST00000449684 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
LIMS1-210ENST00000449684 A2MP01023 1474 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-210ENST00000449684 TSPY4P0CV99 314 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-210ENST00000449684 TSPY10P0CW01 314 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-210ENST00000449684 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.26■■□□□ 1.47
LIMS1-210ENST00000449684 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.24■■□□□ 1.47
LIMS1-210ENST00000449684 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.23■■□□□ 1.47
LIMS1-210ENST00000449684 GGT6Q6P531 493 aa24.22■■□□□ 1.47
LIMS1-210ENST00000449684 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-210ENST00000449684 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.21■■□□□ 1.47
LIMS1-210ENST00000449684 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.2■■□□□ 1.46
LIMS1-210ENST00000449684 HSPA2P54652 639 aa24.19■■□□□ 1.46
LIMS1-210ENST00000449684 MIA2Q96PC5 1412 aa24.18■■□□□ 1.46
LIMS1-210ENST00000449684 PLXNC1O60486 1568 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-210ENST00000449684 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-210ENST00000449684 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-210ENST00000449684 C3P01024 1663 aa24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-210ENST00000449684 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-210ENST00000449684 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-210ENST00000449684 KIF3BO15066 747 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-210ENST00000449684 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-210ENST00000449684 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-210ENST00000449684 ZMYM3Q14202 1370 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-210ENST00000449684 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
LIMS1-210ENST00000449684 MROH2AA6NES4 1674 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-210ENST00000449684 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.04■■□□□ 1.44
LIMS1-210ENST00000449684 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMS1-210ENST00000449684 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.03■■□□□ 1.44
LIMS1-210ENST00000449684 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.02■■□□□ 1.44
LIMS1-210ENST00000449684 NPATQ14207 1427 aa24.01■■□□□ 1.43
LIMS1-210ENST00000449684 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.98■■□□□ 1.43
LIMS1-210ENST00000449684 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
LIMS1-210ENST00000449684 ABCC5O15440 1437 aa23.96■■□□□ 1.43
LIMS1-210ENST00000449684 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.96■■□□□ 1.43
LIMS1-210ENST00000449684 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
LIMS1-210ENST00000449684 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.94■■□□□ 1.42
LIMS1-210ENST00000449684 DAPK1P53355 1430 aa23.94■■□□□ 1.42
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