RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448992.5

RHBDD1-209, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-209ENST00000448992 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.78■■□□□ 1.56
RHBDD1-209ENST00000448992 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
RHBDD1-209ENST00000448992 CLIP1P30622 1438 aa24.78■■□□□ 1.56
RHBDD1-209ENST00000448992 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.77■■□□□ 1.56
RHBDD1-209ENST00000448992 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.75■■□□□ 1.55
RHBDD1-209ENST00000448992 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RHBDD1-209ENST00000448992 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
RHBDD1-209ENST00000448992 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.71■■□□□ 1.55
RHBDD1-209ENST00000448992 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.67■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.67■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 MLECQ14165 292 aa24.67■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.66■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 ATP10AO60312 1499 aa24.66■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.66■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.66■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.66■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.65■■□□□ 1.54
RHBDD1-209ENST00000448992 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.63■■□□□ 1.53
RHBDD1-209ENST00000448992 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.63■■□□□ 1.53
RHBDD1-209ENST00000448992 KDM5CP41229 1560 aa24.59■■□□□ 1.53
RHBDD1-209ENST00000448992 PREX2Q70Z35 1606 aa24.57■■□□□ 1.52
RHBDD1-209ENST00000448992 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.56■■□□□ 1.52
RHBDD1-209ENST00000448992 AFAP1Q8N556 730 aa24.56■■□□□ 1.52
RHBDD1-209ENST00000448992 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.56■■□□□ 1.52
RHBDD1-209ENST00000448992 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.56■■□□□ 1.52
RHBDD1-209ENST00000448992 FBXO41Q8TF61 875 aa24.54■■□□□ 1.52
RHBDD1-209ENST00000448992 HSPA2P54652 639 aa24.53■■□□□ 1.52
RHBDD1-209ENST00000448992 ABCC1P33527 1531 aa24.51■■□□□ 1.51
RHBDD1-209ENST00000448992 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.5■■□□□ 1.51
RHBDD1-209ENST00000448992 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.49■■□□□ 1.51
RHBDD1-209ENST00000448992 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.49■■□□□ 1.51
RHBDD1-209ENST00000448992 REREQ9P2R6 1566 aa24.48■■□□□ 1.51
RHBDD1-209ENST00000448992 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.47■■□□□ 1.51
RHBDD1-209ENST00000448992 ABCA6Q8N139 1617 aa24.46■■□□□ 1.51
RHBDD1-209ENST00000448992 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.46■■□□□ 1.51
RHBDD1-209ENST00000448992 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.44■■□□□ 1.5
RHBDD1-209ENST00000448992 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
RHBDD1-209ENST00000448992 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
RHBDD1-209ENST00000448992 AGLP35573 1532 aa24.4■■□□□ 1.5
RHBDD1-209ENST00000448992 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.38■■□□□ 1.49
RHBDD1-209ENST00000448992 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.37■■□□□ 1.49
RHBDD1-209ENST00000448992 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.37■■□□□ 1.49
RHBDD1-209ENST00000448992 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.35■■□□□ 1.49
RHBDD1-209ENST00000448992 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RHBDD1-209ENST00000448992 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.34■■□□□ 1.49
RHBDD1-209ENST00000448992 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.33■■□□□ 1.49
RHBDD1-209ENST00000448992 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
RHBDD1-209ENST00000448992 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 C3P01024 1663 aa24.32■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.31■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.3■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.28■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 ATP7AQ04656 1500 aa24.27■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 CERKQ8TCT0 537 aa24.27■■□□□ 1.48
RHBDD1-209ENST00000448992 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1-209ENST00000448992 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
RHBDD1-209ENST00000448992 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RHBDD1-209ENST00000448992 MROH2AA6NES4 1674 aa24.22■■□□□ 1.47
RHBDD1-209ENST00000448992 STRCQ7RTU9 1775 aa24.21■■□□□ 1.47
RHBDD1-209ENST00000448992 CEP162Q5TB80 1403 aa24.21■■□□□ 1.47
RHBDD1-209ENST00000448992 TIAM1Q13009 1591 aa24.2■■□□□ 1.47
RHBDD1-209ENST00000448992 A2MP01023 1474 aa24.2■■□□□ 1.47
RHBDD1-209ENST00000448992 PLXNC1O60486 1568 aa24.17■■□□□ 1.46
RHBDD1-209ENST00000448992 NPATQ14207 1427 aa24.17■■□□□ 1.46
RHBDD1-209ENST00000448992 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.16■■□□□ 1.46
RHBDD1-209ENST00000448992 ZMYM3Q14202 1370 aa24.16■■□□□ 1.46
RHBDD1-209ENST00000448992 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
RHBDD1-209ENST00000448992 PTPRTO14522 1441 aa24.14■■□□□ 1.45
RHBDD1-209ENST00000448992 GGT6Q6P531 493 aa24.12■■□□□ 1.45
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RHBDD1-209ENST00000448992 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.09■■□□□ 1.45
RHBDD1-209ENST00000448992 NCOA1Q15788 1441 aa24.09■■□□□ 1.45
RHBDD1-209ENST00000448992 MBD5Q9P267 1494 aa24.08■■□□□ 1.45
RHBDD1-209ENST00000448992 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.08■■□□□ 1.45
RHBDD1-209ENST00000448992 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1-209ENST00000448992 NCOA2Q15596 1464 aa24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1-209ENST00000448992 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.05■■□□□ 1.44
RHBDD1-209ENST00000448992 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.05■■□□□ 1.44
RHBDD1-209ENST00000448992 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.03■■□□□ 1.44
RHBDD1-209ENST00000448992 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
RHBDD1-209ENST00000448992 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.02■■□□□ 1.44
RHBDD1-209ENST00000448992 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
RHBDD1-209ENST00000448992 PTPRKQ15262 1439 aa24.01■■□□□ 1.43
RHBDD1-209ENST00000448992 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
RHBDD1-209ENST00000448992 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.97■■□□□ 1.43
RHBDD1-209ENST00000448992 PLA2R1Q13018 1463 aa23.96■■□□□ 1.43
RHBDD1-209ENST00000448992 KIF3BO15066 747 aa23.96■■□□□ 1.43
RHBDD1-209ENST00000448992 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.95■■□□□ 1.43
RHBDD1-209ENST00000448992 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.95■■□□□ 1.42
RHBDD1-209ENST00000448992 TSPY4P0CV99 314 aa23.95■■□□□ 1.42
RHBDD1-209ENST00000448992 TSPY10P0CW01 314 aa23.95■■□□□ 1.42
RHBDD1-209ENST00000448992 PKD2Q13563 968 aa23.95■■□□□ 1.42
RHBDD1-209ENST00000448992 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.94■■□□□ 1.42
RHBDD1-209ENST00000448992 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.94■■□□□ 1.42
RHBDD1-209ENST00000448992 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms