RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-215ENST00000447232 TOP2BQ02880 1626 aa6.42□□□□□ -1.38
PMS1-215ENST00000447232 ADAMTS12P58397 1594 aa6.41□□□□□ -1.38
PMS1-215ENST00000447232 CUX1P39880 1505 aa6.41□□□□□ -1.38
PMS1-215ENST00000447232 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.41□□□□□ -1.38
PMS1-215ENST00000447232 RASEFQ8IZ41 740 aa6.4□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.4□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.39□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 LHX8Q68G74 356 aa6.39□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 GLI2P10070 1586 aa6.39□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 FBXO3Q9UK99 471 aa6.37□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.37□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 JPH4Q96JJ6 628 aa6.37□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 NUBP1P53384 320 aa6.36□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 KIF12Q96FN5 646 aa6.36□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.36□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 CERKQ8TCT0 537 aa6.34□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PMS1-215ENST00000447232 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.33□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.33□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 MAP3K13O43283 966 aa6.32□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 PTPRMP28827 1452 aa6.32□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.32□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 ASXL2Q76L83 1435 aa6.32□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.32□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.31□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 ABCC2Q92887 1545 aa6.3□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 KIF21BO75037 1637 aa6.3□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.3□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.29□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 TRPC6Q9Y210 931 aa6.29□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.28□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 POTEB2H3BUK9 544 aa6.28□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 FAM212AQ96EL1 285 aa6.28□□□□□ -1.4
PMS1-215ENST00000447232 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 CUL7Q14999 1698 aa6.27□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.26□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.26□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.25□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 PTPRGP23470 1445 aa6.25□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 C7P10643 843 aa6.25□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 TIE1P35590 1138 aa6.25□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.25□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 KLHL34Q8N239 644 aa6.25□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 METRNQ9UJH8 293 aa6.25□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 SLC39A7Q92504 469 aa6.24□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 IFNL1Q8IU54 200 aa6.24□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 HSPA2P54652 639 aa6.23□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 MADDQ8WXG6 1647 aa6.23□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.23□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.23□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.23□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.23□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 OTUD5Q96G74 571 aa6.23□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 PYGBP11216 843 aa6.22□□□□□ -1.41
PMS1-215ENST00000447232 POTEJP0CG39 1038 aa6.21□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.21□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.2□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 POTEFA5A3E0 1075 aa6.2□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 UACAQ9BZF9 1416 aa6.2□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.2□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.19□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.18□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 CD109Q6YHK3 1445 aa6.18□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 GSE1Q14687 1217 aa6.18□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.18□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 IQSEC2Q5JU85 1478 aa6.17□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.17□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.16□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 STRCQ7RTU9 1775 aa6.16□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.16□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 SPOCK2Q92563 424 aa6.16□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.15□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.15□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PMS1-215ENST00000447232 IER5LQ5T953 404 aa6.14□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 SEC24BO95487 1268 aa6.13□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 DISP1Q96F81 1524 aa6.13□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.12□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.12□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.12□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.12□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 PTPRTO14522 1441 aa6.12□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.11□□□□□ -1.43
PMS1-215ENST00000447232 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.11□□□□□ -1.43
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