RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445667.6

USE1-202, Transcript of unconventional SNARE in the ER 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene USE1, Length 795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1-202ENST00000445667 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.53■■□□□ 1.36
USE1-202ENST00000445667 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.52■■□□□ 1.36
USE1-202ENST00000445667 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.51■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 PREX2Q70Z35 1606 aa23.49■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 AFAP1Q8N556 730 aa23.49■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.49■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.49■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.47■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.47■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.46■■□□□ 1.35
USE1-202ENST00000445667 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.45■■□□□ 1.34
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USE1-202ENST00000445667 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.43■■□□□ 1.34
USE1-202ENST00000445667 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.43■■□□□ 1.34
USE1-202ENST00000445667 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.43■■□□□ 1.34
USE1-202ENST00000445667 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.42■■□□□ 1.34
USE1-202ENST00000445667 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
USE1-202ENST00000445667 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.41■■□□□ 1.34
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USE1-202ENST00000445667 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.4■■□□□ 1.34
USE1-202ENST00000445667 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
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USE1-202ENST00000445667 TIAM1Q13009 1591 aa23.36■■□□□ 1.33
USE1-202ENST00000445667 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.36■■□□□ 1.33
USE1-202ENST00000445667 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.36■■□□□ 1.33
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USE1-202ENST00000445667 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.35■■□□□ 1.33
USE1-202ENST00000445667 MLECQ14165 292 aa23.34■■□□□ 1.33
USE1-202ENST00000445667 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
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USE1-202ENST00000445667 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.31■■□□□ 1.32
USE1-202ENST00000445667 NCOA2Q15596 1464 aa23.3■■□□□ 1.32
USE1-202ENST00000445667 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.3■■□□□ 1.32
USE1-202ENST00000445667 PTPRMP28827 1452 aa23.3■■□□□ 1.32
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USE1-202ENST00000445667 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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USE1-202ENST00000445667 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.27■■□□□ 1.32
USE1-202ENST00000445667 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
USE1-202ENST00000445667 ABCA6Q8N139 1617 aa23.25■■□□□ 1.31
USE1-202ENST00000445667 MAP3K1Q13233 1512 aa23.24■■□□□ 1.31
USE1-202ENST00000445667 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.23■■□□□ 1.31
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USE1-202ENST00000445667 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.23■■□□□ 1.31
USE1-202ENST00000445667 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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USE1-202ENST00000445667 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.08■■□□□ 1.29
USE1-202ENST00000445667 A2MP01023 1474 aa23.08■■□□□ 1.29
USE1-202ENST00000445667 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.08■■□□□ 1.29
USE1-202ENST00000445667 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.07■■□□□ 1.28
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USE1-202ENST00000445667 TSPY10P0CW01 314 aa23.05■■□□□ 1.28
USE1-202ENST00000445667 MIA2Q96PC5 1412 aa23.05■■□□□ 1.28
USE1-202ENST00000445667 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.02■■□□□ 1.28
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USE1-202ENST00000445667 PLXNC1O60486 1568 aa23.01■■□□□ 1.27
USE1-202ENST00000445667 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
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USE1-202ENST00000445667 LMTK3Q96Q04 1460 aa23■■□□□ 1.27
USE1-202ENST00000445667 HSPA2P54652 639 aa22.98■■□□□ 1.27
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USE1-202ENST00000445667 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.95■■□□□ 1.26
USE1-202ENST00000445667 C3P01024 1663 aa22.93■■□□□ 1.26
USE1-202ENST00000445667 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.93■■□□□ 1.26
USE1-202ENST00000445667 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.93■■□□□ 1.26
USE1-202ENST00000445667 ZMYM3Q14202 1370 aa22.91■■□□□ 1.26
USE1-202ENST00000445667 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.9■■□□□ 1.26
USE1-202ENST00000445667 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.9■■□□□ 1.26
USE1-202ENST00000445667 ABCC5O15440 1437 aa22.89■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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USE1-202ENST00000445667 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.86■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.85■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 MROH2AA6NES4 1674 aa22.85■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 DAPK1P53355 1430 aa22.84■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.84■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.83■■□□□ 1.25
USE1-202ENST00000445667 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.82■■□□□ 1.24
USE1-202ENST00000445667 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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