RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445304.1

RPL17P1-201, Transcript of ribosomal protein L17 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RPL17P1, Length 536 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P1-201ENST00000445304 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.02■□□□□ -0
RPL17P1-201ENST00000445304 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
RPL17P1-201ENST00000445304 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.01□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.01□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 PREX2Q70Z35 1606 aa15□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 POGZQ7Z3K3 1410 aa15□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 SCAPERQ9BY12 1400 aa15□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.99□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.99□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.97□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.97□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.97□□□□□ -0.01
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.95□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.94□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 KDM5CP41229 1560 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.93□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 ABCC1P33527 1531 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 FBXO41Q8TF61 875 aa14.92□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPL17P1-201ENST00000445304 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.88□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.88□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 AFAP1Q8N556 730 aa14.88□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.88□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 ATP10AO60312 1499 aa14.88□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.87□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 TIAM1Q13009 1591 aa14.87□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.87□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.87□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.86□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 MADDQ8WXG6 1647 aa14.86□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 PTPRMP28827 1452 aa14.85□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.85□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 REREQ9P2R6 1566 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL17P1-201ENST00000445304 MAP3K1Q13233 1512 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 ABCA6Q8N139 1617 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.81□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.81□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 NCOA2Q15596 1464 aa14.81□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.8□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.79□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 AGLP35573 1532 aa14.77□□□□□ -0.04
RPL17P1-201ENST00000445304 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 ATP7AQ04656 1500 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 MLECQ14165 292 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 MBD5Q9P267 1494 aa14.75□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.73□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.73□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.71□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 PLXNC1O60486 1568 aa14.71□□□□□ -0.05
RPL17P1-201ENST00000445304 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.7□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 APLP2Q06481 763 aa14.7□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.7□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.7□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 A2MP01023 1474 aa14.69□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.69□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.69□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 HSPA2P54652 639 aa14.69□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 ILDR2Q71H61 639 aa14.69□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 MIA2Q96PC5 1412 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.66□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 C3P01024 1663 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL17P1-201ENST00000445304 MROH2AA6NES4 1674 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.64□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 TSPY4P0CV99 314 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 TSPY10P0CW01 314 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.62□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
RPL17P1-201ENST00000445304 CERKQ8TCT0 537 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL17P1-201ENST00000445304 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL17P1-201ENST00000445304 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL17P1-201ENST00000445304 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL17P1-201ENST00000445304 GGT6Q6P531 493 aa14.57□□□□□ -0.08
RPL17P1-201ENST00000445304 ZMYM3Q14202 1370 aa14.57□□□□□ -0.08
RPL17P1-201ENST00000445304 NPATQ14207 1427 aa14.57□□□□□ -0.08
RPL17P1-201ENST00000445304 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPL17P1-201ENST00000445304 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms