RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443037.1

SOX9-AS1-206, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOX9-AS1, Length 394 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RICTORQ6R327 1708 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.78■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.77■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.76■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.75■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.75■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CLIP1P30622 1438 aa22.74■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KIF14Q15058 1648 aa22.72■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.72■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.71■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.71■■□□□ 1.23
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.69■■□□□ 1.22
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.67■■□□□ 1.22
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SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.67■■□□□ 1.22
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.65■■□□□ 1.22
SOX9-AS1-206ENST00000443037 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.63■■□□□ 1.21
SOX9-AS1-206ENST00000443037 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.63■■□□□ 1.21
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.61■■□□□ 1.21
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.59■■□□□ 1.21
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.58■■□□□ 1.21
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.57■■□□□ 1.2
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PREX2Q70Z35 1606 aa22.56■■□□□ 1.2
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PTPRMP28827 1452 aa22.54■■□□□ 1.2
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.54■■□□□ 1.2
SOX9-AS1-206ENST00000443037 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.53■■□□□ 1.2
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KDM5CP41229 1560 aa22.53■■□□□ 1.2
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ATP10AO60312 1499 aa22.53■■□□□ 1.2
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.51■■□□□ 1.19
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MADDQ8WXG6 1647 aa22.49■■□□□ 1.19
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CEP162Q5TB80 1403 aa22.48■■□□□ 1.19
SOX9-AS1-206ENST00000443037 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.48■■□□□ 1.19
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.47■■□□□ 1.19
SOX9-AS1-206ENST00000443037 AFAP1Q8N556 730 aa22.47■■□□□ 1.19
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ABCC1P33527 1531 aa22.47■■□□□ 1.19
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.45■■□□□ 1.19
SOX9-AS1-206ENST00000443037 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.45■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 REREQ9P2R6 1566 aa22.44■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.41■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.41■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.4■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.4■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.4■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.4■■□□□ 1.18
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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SOX9-AS1-206ENST00000443037 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.38■■□□□ 1.17
SOX9-AS1-206ENST00000443037 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.37■■□□□ 1.17
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.37■■□□□ 1.17
SOX9-AS1-206ENST00000443037 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.36■■□□□ 1.17
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SOX9-AS1-206ENST00000443037 AGLP35573 1532 aa22.36■■□□□ 1.17
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.34■■□□□ 1.17
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ABCA6Q8N139 1617 aa22.34■■□□□ 1.17
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MLECQ14165 292 aa22.31■■□□□ 1.16
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.3■■□□□ 1.16
SOX9-AS1-206ENST00000443037 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.3■■□□□ 1.16
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.29■■□□□ 1.16
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
SOX9-AS1-206ENST00000443037 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.28■■□□□ 1.16
SOX9-AS1-206ENST00000443037 TIAM1Q13009 1591 aa22.28■■□□□ 1.16
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SOX9-AS1-206ENST00000443037 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MAP3K1Q13233 1512 aa22.25■■□□□ 1.15
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.24■■□□□ 1.15
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ATP7AQ04656 1500 aa22.23■■□□□ 1.15
SOX9-AS1-206ENST00000443037 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NCOA2Q15596 1464 aa22.22■■□□□ 1.15
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MBD5Q9P267 1494 aa22.22■■□□□ 1.15
SOX9-AS1-206ENST00000443037 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.21■■□□□ 1.15
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.21■■□□□ 1.15
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.2■■□□□ 1.14
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.18■■□□□ 1.14
SOX9-AS1-206ENST00000443037 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.18■■□□□ 1.14
SOX9-AS1-206ENST00000443037 PLXNC1O60486 1568 aa22.17■■□□□ 1.14
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SOX9-AS1-206ENST00000443037 C3P01024 1663 aa22.16■■□□□ 1.14
SOX9-AS1-206ENST00000443037 A2MP01023 1474 aa22.15■■□□□ 1.14
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MROH2AA6NES4 1674 aa22.14■■□□□ 1.14
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.1■■□□□ 1.13
SOX9-AS1-206ENST00000443037 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.1■■□□□ 1.13
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.1■■□□□ 1.13
SOX9-AS1-206ENST00000443037 HSPA2P54652 639 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX9-AS1-206ENST00000443037 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.08■■□□□ 1.13
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SOX9-AS1-206ENST00000443037 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SOX9-AS1-206ENST00000443037 NPATQ14207 1427 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX9-AS1-206ENST00000443037 MIA2Q96PC5 1412 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX9-AS1-206ENST00000443037 ZMYM3Q14202 1370 aa22.06■■□□□ 1.12
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