RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.29■■■■■ 4.68
FAAP20-210ENST00000440825 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.29■■■■■ 4.68
FAAP20-210ENST00000440825 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.28■■■■■ 4.68
FAAP20-210ENST00000440825 PREX2Q70Z35 1606 aa44.27■■■■■ 4.68
FAAP20-210ENST00000440825 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.25■■■■■ 4.67
FAAP20-210ENST00000440825 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.25■■■■■ 4.67
FAAP20-210ENST00000440825 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.22■■■■■ 4.67
FAAP20-210ENST00000440825 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.2■■■■■ 4.67
FAAP20-210ENST00000440825 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.2■■■■■ 4.67
FAAP20-210ENST00000440825 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.15■■■■■ 4.66
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
FAAP20-210ENST00000440825 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.13■■■■■ 4.66
FAAP20-210ENST00000440825 AFAP1Q8N556 730 aa44.12■■■■■ 4.65
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.12■■■■■ 4.65
FAAP20-210ENST00000440825 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.08■■■■■ 4.65
FAAP20-210ENST00000440825 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
FAAP20-210ENST00000440825 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.07■■■■■ 4.65
FAAP20-210ENST00000440825 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.07■■■■■ 4.65
FAAP20-210ENST00000440825 ABCC1P33527 1531 aa44.07■■■■■ 4.65
FAAP20-210ENST00000440825 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.05■■■■■ 4.64
FAAP20-210ENST00000440825 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.03■■■■■ 4.64
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.02■■■■■ 4.64
FAAP20-210ENST00000440825 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.01■■■■■ 4.64
FAAP20-210ENST00000440825 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 KDM5CP41229 1560 aa44■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.99■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.98■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.97■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 ATP10AO60312 1499 aa43.96■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.96■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 MLECQ14165 292 aa43.95■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 TIAM1Q13009 1591 aa43.95■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 MADDQ8WXG6 1647 aa43.95■■■■■ 4.63
FAAP20-210ENST00000440825 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.92■■■■■ 4.62
FAAP20-210ENST00000440825 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.91■■■■■ 4.62
FAAP20-210ENST00000440825 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.89■■■■■ 4.62
FAAP20-210ENST00000440825 PTPRMP28827 1452 aa43.89■■■■■ 4.62
FAAP20-210ENST00000440825 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
FAAP20-210ENST00000440825 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.84■■■■■ 4.61
FAAP20-210ENST00000440825 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
FAAP20-210ENST00000440825 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.83■■■■■ 4.61
FAAP20-210ENST00000440825 NCOA2Q15596 1464 aa43.82■■■■■ 4.6
FAAP20-210ENST00000440825 ABCA6Q8N139 1617 aa43.81■■■■■ 4.6
FAAP20-210ENST00000440825 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.81■■■■■ 4.6
FAAP20-210ENST00000440825 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.8■■■■■ 4.6
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.77■■■■■ 4.6
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.76■■■■■ 4.6
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.75■■■■■ 4.59
FAAP20-210ENST00000440825 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.75■■■■■ 4.59
FAAP20-210ENST00000440825 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
FAAP20-210ENST00000440825 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.7■■■■■ 4.59
FAAP20-210ENST00000440825 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
FAAP20-210ENST00000440825 APLP2Q06481 763 aa43.68■■■■■ 4.58
FAAP20-210ENST00000440825 MAP3K1Q13233 1512 aa43.66■■■■■ 4.58
FAAP20-210ENST00000440825 REREQ9P2R6 1566 aa43.65■■■■■ 4.58
FAAP20-210ENST00000440825 ATP7AQ04656 1500 aa43.62■■■■■ 4.57
FAAP20-210ENST00000440825 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.57■■■■■ 4.57
FAAP20-210ENST00000440825 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
FAAP20-210ENST00000440825 MBD5Q9P267 1494 aa43.56■■■■■ 4.56
FAAP20-210ENST00000440825 AGLP35573 1532 aa43.53■■■■■ 4.56
FAAP20-210ENST00000440825 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.45■■■■■ 4.55
FAAP20-210ENST00000440825 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
FAAP20-210ENST00000440825 A2MP01023 1474 aa43.44■■■■■ 4.54
FAAP20-210ENST00000440825 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.39■■■■■ 4.54
FAAP20-210ENST00000440825 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.37■■■■■ 4.53
FAAP20-210ENST00000440825 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.37■■■■■ 4.53
FAAP20-210ENST00000440825 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.36■■■■■ 4.53
FAAP20-210ENST00000440825 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.36■■■■■ 4.53
FAAP20-210ENST00000440825 PLXNC1O60486 1568 aa43.35■■■■■ 4.53
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.33■■■■■ 4.53
FAAP20-210ENST00000440825 TSPY4P0CV99 314 aa43.31■■■■■ 4.52
FAAP20-210ENST00000440825 TSPY10P0CW01 314 aa43.31■■■■■ 4.52
FAAP20-210ENST00000440825 MIA2Q96PC5 1412 aa43.31■■■■■ 4.52
FAAP20-210ENST00000440825 GGT6Q6P531 493 aa43.29■■■■■ 4.52
FAAP20-210ENST00000440825 C3P01024 1663 aa43.25■■■■■ 4.51
FAAP20-210ENST00000440825 HSPA2P54652 639 aa43.25■■■■■ 4.51
FAAP20-210ENST00000440825 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.23■■■■■ 4.51
FAAP20-210ENST00000440825 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
FAAP20-210ENST00000440825 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.17■■■■■ 4.5
FAAP20-210ENST00000440825 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.16■■■■■ 4.5
FAAP20-210ENST00000440825 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
FAAP20-210ENST00000440825 KIF3BO15066 747 aa43.14■■■■■ 4.5
FAAP20-210ENST00000440825 ZMYM3Q14202 1370 aa43.1■■■■■ 4.49
FAAP20-210ENST00000440825 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.1■■■■■ 4.49
FAAP20-210ENST00000440825 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.1■■■■■ 4.49
FAAP20-210ENST00000440825 MROH2AA6NES4 1674 aa43.1■■■■■ 4.49
FAAP20-210ENST00000440825 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.09■■■■■ 4.49
FAAP20-210ENST00000440825 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
FAAP20-210ENST00000440825 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.01■■■■■ 4.48
FAAP20-210ENST00000440825 ABCC5O15440 1437 aa42.98■■■■■ 4.47
FAAP20-210ENST00000440825 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
FAAP20-210ENST00000440825 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.96■■■■■ 4.47
FAAP20-210ENST00000440825 DAPK1P53355 1430 aa42.95■■■■■ 4.47
FAAP20-210ENST00000440825 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
FAAP20-210ENST00000440825 NPATQ14207 1427 aa42.93■■■■■ 4.46
FAAP20-210ENST00000440825 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
FAAP20-210ENST00000440825 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.91■■■■■ 4.46
FAAP20-210ENST00000440825 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.91■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms