RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.55■■■□□ 2.64
NPAS1-201ENST00000439365 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.54■■■□□ 2.64
NPAS1-201ENST00000439365 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.54■■■□□ 2.64
NPAS1-201ENST00000439365 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.52■■■□□ 2.64
NPAS1-201ENST00000439365 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.51■■■□□ 2.63
NPAS1-201ENST00000439365 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.5■■■□□ 2.63
NPAS1-201ENST00000439365 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.49■■■□□ 2.63
NPAS1-201ENST00000439365 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.49■■■□□ 2.63
NPAS1-201ENST00000439365 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.49■■■□□ 2.63
NPAS1-201ENST00000439365 PTPRMP28827 1452 aa31.47■■■□□ 2.63
NPAS1-201ENST00000439365 AFAP1Q8N556 730 aa31.44■■■□□ 2.62
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.43■■■□□ 2.62
NPAS1-201ENST00000439365 MADDQ8WXG6 1647 aa31.43■■■□□ 2.62
NPAS1-201ENST00000439365 MLECQ14165 292 aa31.43■■■□□ 2.62
NPAS1-201ENST00000439365 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.4■■■□□ 2.62
NPAS1-201ENST00000439365 CEP162Q5TB80 1403 aa31.4■■■□□ 2.62
NPAS1-201ENST00000439365 PREX2Q70Z35 1606 aa31.39■■■□□ 2.61
NPAS1-201ENST00000439365 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.38■■■□□ 2.61
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
NPAS1-201ENST00000439365 ATP10AO60312 1499 aa31.37■■■□□ 2.61
NPAS1-201ENST00000439365 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.34■■■□□ 2.61
NPAS1-201ENST00000439365 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.34■■■□□ 2.61
NPAS1-201ENST00000439365 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
NPAS1-201ENST00000439365 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.33■■■□□ 2.61
NPAS1-201ENST00000439365 KDM5CP41229 1560 aa31.31■■■□□ 2.6
NPAS1-201ENST00000439365 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.3■■■□□ 2.6
NPAS1-201ENST00000439365 ABCC1P33527 1531 aa31.3■■■□□ 2.6
NPAS1-201ENST00000439365 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.29■■■□□ 2.6
NPAS1-201ENST00000439365 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.28■■■□□ 2.6
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.27■■■□□ 2.6
NPAS1-201ENST00000439365 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.27■■■□□ 2.6
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NPAS1-201ENST00000439365 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
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NPAS1-201ENST00000439365 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.22■■■□□ 2.59
NPAS1-201ENST00000439365 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.2■■■□□ 2.58
NPAS1-201ENST00000439365 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.58
NPAS1-201ENST00000439365 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.19■■■□□ 2.58
NPAS1-201ENST00000439365 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.18■■■□□ 2.58
NPAS1-201ENST00000439365 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.17■■■□□ 2.58
NPAS1-201ENST00000439365 ABCA6Q8N139 1617 aa31.16■■■□□ 2.58
NPAS1-201ENST00000439365 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.16■■■□□ 2.58
NPAS1-201ENST00000439365 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.11■■■□□ 2.57
NPAS1-201ENST00000439365 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.11■■■□□ 2.57
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NPAS1-201ENST00000439365 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.08■■■□□ 2.57
NPAS1-201ENST00000439365 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.08■■■□□ 2.57
NPAS1-201ENST00000439365 TIAM1Q13009 1591 aa31.07■■■□□ 2.56
NPAS1-201ENST00000439365 HSPA2P54652 639 aa31.05■■■□□ 2.56
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NPAS1-201ENST00000439365 AGLP35573 1532 aa31.01■■■□□ 2.56
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NPAS1-201ENST00000439365 MBD5Q9P267 1494 aa30.89■■■□□ 2.54
NPAS1-201ENST00000439365 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.87■■■□□ 2.53
NPAS1-201ENST00000439365 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.87■■■□□ 2.53
NPAS1-201ENST00000439365 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.86■■■□□ 2.53
NPAS1-201ENST00000439365 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.86■■■□□ 2.53
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NPAS1-201ENST00000439365 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
NPAS1-201ENST00000439365 C3P01024 1663 aa30.84■■■□□ 2.53
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NPAS1-201ENST00000439365 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.82■■■□□ 2.52
NPAS1-201ENST00000439365 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.81■■■□□ 2.52
NPAS1-201ENST00000439365 PLXNC1O60486 1568 aa30.81■■■□□ 2.52
NPAS1-201ENST00000439365 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.81■■■□□ 2.52
NPAS1-201ENST00000439365 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.79■■■□□ 2.52
NPAS1-201ENST00000439365 MAP3K1Q13233 1512 aa30.78■■■□□ 2.52
NPAS1-201ENST00000439365 ZMYM3Q14202 1370 aa30.77■■■□□ 2.52
NPAS1-201ENST00000439365 TSPY4P0CV99 314 aa30.76■■■□□ 2.52
NPAS1-201ENST00000439365 TSPY10P0CW01 314 aa30.76■■■□□ 2.52
NPAS1-201ENST00000439365 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
NPAS1-201ENST00000439365 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
NPAS1-201ENST00000439365 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
NPAS1-201ENST00000439365 MROH2AA6NES4 1674 aa30.71■■■□□ 2.51
NPAS1-201ENST00000439365 KIF3BO15066 747 aa30.7■■■□□ 2.5
NPAS1-201ENST00000439365 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.69■■■□□ 2.5
NPAS1-201ENST00000439365 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.68■■■□□ 2.5
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.68■■■□□ 2.5
NPAS1-201ENST00000439365 NPATQ14207 1427 aa30.67■■■□□ 2.5
NPAS1-201ENST00000439365 FBXO41Q8TF61 875 aa30.67■■■□□ 2.5
NPAS1-201ENST00000439365 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.67■■■□□ 2.5
NPAS1-201ENST00000439365 MIA2Q96PC5 1412 aa30.63■■■□□ 2.49
NPAS1-201ENST00000439365 STRCQ7RTU9 1775 aa30.58■■■□□ 2.49
NPAS1-201ENST00000439365 PTPRKQ15262 1439 aa30.57■■■□□ 2.48
NPAS1-201ENST00000439365 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.57■■■□□ 2.48
NPAS1-201ENST00000439365 CERKQ8TCT0 537 aa30.53■■■□□ 2.48
NPAS1-201ENST00000439365 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.51■■■□□ 2.48
NPAS1-201ENST00000439365 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.51■■■□□ 2.47
NPAS1-201ENST00000439365 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.5■■■□□ 2.47
NPAS1-201ENST00000439365 NCOA1Q15788 1441 aa30.5■■■□□ 2.47
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