RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, human

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UPP1-208	ENST00000436673	KIF14	Q15058	1648 aa		43.33	■■■■■ 4.53
UPP1-208	ENST00000436673	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.32	■■■■■ 4.53
UPP1-208	ENST00000436673	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		43.31	■■■■■ 4.52
UPP1-208	ENST00000436673	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	43.28	■■■■■ 4.52
UPP1-208	ENST00000436673	CLIP1	P30622	1438 aa		43.28	■■■■■ 4.52
UPP1-208	ENST00000436673	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		43.28	■■■■■ 4.52
UPP1-208	ENST00000436673	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		43.23	■■■■■ 4.51
UPP1-208	ENST00000436673	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.21	■■■■■ 4.51
UPP1-208	ENST00000436673	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	43.19	■■■■■ 4.5
UPP1-208	ENST00000436673	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	43.17	■■■■■ 4.5
UPP1-208	ENST00000436673	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.17	■■■■■ 4.5
UPP1-208	ENST00000436673	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		43.16	■■■■■ 4.5
UPP1-208	ENST00000436673	ATP10A	O60312	1499 aa		43.12	■■■■■ 4.49
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.1	■■■■■ 4.49
UPP1-208	ENST00000436673	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		43.07	■■■■■ 4.49
UPP1-208	ENST00000436673	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		43.06	■■■■■ 4.48
UPP1-208	ENST00000436673	MLEC	Q14165	292 aa		43.06	■■■■■ 4.48
UPP1-208	ENST00000436673	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.05	■■■■■ 4.48
UPP1-208	ENST00000436673	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		43.05	■■■■■ 4.48
UPP1-208	ENST00000436673	KDM5C	P41229	1560 aa		43.03	■■■■■ 4.48
UPP1-208	ENST00000436673	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.02	■■■■■ 4.48
UPP1-208	ENST00000436673	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.98	■■■■■ 4.47
UPP1-208	ENST00000436673	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.97	■■■■■ 4.47
UPP1-208	ENST00000436673	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.96	■■■■■ 4.47
UPP1-208	ENST00000436673	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.94	■■■■■ 4.46
UPP1-208	ENST00000436673	ABCC1	P33527	1531 aa		42.91	■■■■■ 4.46
UPP1-208	ENST00000436673	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.89	■■■■■ 4.46
UPP1-208	ENST00000436673	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.88	■■■■■ 4.46
UPP1-208	ENST00000436673	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.88	■■■■■ 4.46
UPP1-208	ENST00000436673	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.86	■■■■■ 4.45
UPP1-208	ENST00000436673	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.84	■■■■■ 4.45
UPP1-208	ENST00000436673	HSPA2	P54652	639 aa		42.82	■■■■■ 4.45
UPP1-208	ENST00000436673	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.82	■■■■■ 4.44
UPP1-208	ENST00000436673	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.8	■■■■■ 4.44
UPP1-208	ENST00000436673	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.79	■■■■■ 4.44
UPP1-208	ENST00000436673	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
UPP1-208	ENST00000436673	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
UPP1-208	ENST00000436673	AGL	P35573	1532 aa		42.69	■■■■■ 4.42
UPP1-208	ENST00000436673	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.69	■■■■■ 4.42
UPP1-208	ENST00000436673	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.67	■■■■■ 4.42
UPP1-208	ENST00000436673	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.66	■■■■■ 4.42
UPP1-208	ENST00000436673	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.63	■■■■■ 4.42
UPP1-208	ENST00000436673	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.63	■■■■■ 4.41
UPP1-208	ENST00000436673	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
UPP1-208	ENST00000436673	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.6	■■■■■ 4.41
UPP1-208	ENST00000436673	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.59	■■■■■ 4.41
UPP1-208	ENST00000436673	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.59	■■■■■ 4.41
UPP1-208	ENST00000436673	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.57	■■■■■ 4.41
UPP1-208	ENST00000436673	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.55	■■■■■ 4.4
UPP1-208	ENST00000436673	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
UPP1-208	ENST00000436673	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.55	■■■■■ 4.4
UPP1-208	ENST00000436673	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.51	■■■■■ 4.4
UPP1-208	ENST00000436673	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.48	■■■■■ 4.39
UPP1-208	ENST00000436673	C3	P01024	1663 aa		42.47	■■■■■ 4.39
UPP1-208	ENST00000436673	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.46	■■■■■ 4.39
UPP1-208	ENST00000436673	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.44	■■■■■ 4.38
UPP1-208	ENST00000436673	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.44	■■■■■ 4.38
UPP1-208	ENST00000436673	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
UPP1-208	ENST00000436673	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.43	■■■■■ 4.38
UPP1-208	ENST00000436673	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
UPP1-208	ENST00000436673	A2M	P01023	1474 aa		42.34	■■■■■ 4.37
UPP1-208	ENST00000436673	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.34	■■■■■ 4.37
UPP1-208	ENST00000436673	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.37
UPP1-208	ENST00000436673	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.31	■■■■■ 4.36
UPP1-208	ENST00000436673	STRC	Q7RTU9	1775 aa		42.31	■■■■■ 4.36
UPP1-208	ENST00000436673	CERK	Q8TCT0	537 aa		42.29	■■■■■ 4.36
UPP1-208	ENST00000436673	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.29	■■■■■ 4.36
UPP1-208	ENST00000436673	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.26	■■■■■ 4.36
UPP1-208	ENST00000436673	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.26	■■■■■ 4.35
UPP1-208	ENST00000436673	NPAT	Q14207	1427 aa		42.23	■■■■■ 4.35
UPP1-208	ENST00000436673	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.22	■■■■■ 4.35
UPP1-208	ENST00000436673	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.2	■■■■■ 4.35
UPP1-208	ENST00000436673	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.19	■■■■■ 4.34
UPP1-208	ENST00000436673	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		42.18	■■■■■ 4.34
UPP1-208	ENST00000436673	GGT6	Q6P531	493 aa		42.17	■■■■■ 4.34
UPP1-208	ENST00000436673	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
UPP1-208	ENST00000436673	PTPRT	O14522	1441 aa		42.13	■■■■■ 4.34
UPP1-208	ENST00000436673	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.12	■■■■■ 4.33
UPP1-208	ENST00000436673	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.11	■■■■■ 4.33
UPP1-208	ENST00000436673	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.11	■■■■■ 4.33
UPP1-208	ENST00000436673	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.1	■■■■■ 4.33
UPP1-208	ENST00000436673	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.09	■■■■■ 4.33
UPP1-208	ENST00000436673	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
UPP1-208	ENST00000436673	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.06	■■■■■ 4.32
UPP1-208	ENST00000436673	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.06	■■■■■ 4.32
UPP1-208	ENST00000436673	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.03	■■■■■ 4.32
UPP1-208	ENST00000436673	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42	■■■■■ 4.31
UPP1-208	ENST00000436673	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		41.95	■■■■■ 4.31
UPP1-208	ENST00000436673	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		41.94	■■■■■ 4.3
UPP1-208	ENST00000436673	KIF3B	O15066	747 aa		41.94	■■■■■ 4.3
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
UPP1-208	ENST00000436673	MAP3K1	Q13233	1512 aa		41.91	■■■■■ 4.3
UPP1-208	ENST00000436673	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
UPP1-208	ENST00000436673	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.89	■■■■■ 4.3
UPP1-208	ENST00000436673	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.89	■■■■■ 4.3
UPP1-208	ENST00000436673	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
UPP1-208	ENST00000436673	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		41.87	■■■■■ 4.29
UPP1-208	ENST00000436673	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		41.86	■■■■■ 4.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms