RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436280.5

GPN1-204, Transcript of GPN-loop GTPase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPN1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1-204ENST00000436280 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.43■■□□□ 1.18
GPN1-204ENST00000436280 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.42■■□□□ 1.18
GPN1-204ENST00000436280 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.42■■□□□ 1.18
GPN1-204ENST00000436280 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.4■■□□□ 1.18
GPN1-204ENST00000436280 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
GPN1-204ENST00000436280 PREX2Q70Z35 1606 aa22.39■■□□□ 1.17
GPN1-204ENST00000436280 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.38■■□□□ 1.17
GPN1-204ENST00000436280 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.37■■□□□ 1.17
GPN1-204ENST00000436280 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.37■■□□□ 1.17
GPN1-204ENST00000436280 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.37■■□□□ 1.17
GPN1-204ENST00000436280 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.34■■□□□ 1.17
GPN1-204ENST00000436280 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.33■■□□□ 1.17
GPN1-204ENST00000436280 AFAP1Q8N556 730 aa22.3■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 ABCC1P33527 1531 aa22.3■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.3■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.3■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 KDM5CP41229 1560 aa22.29■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.29■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.29■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.28■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.28■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 ATP10AO60312 1499 aa22.28■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GPN1-204ENST00000436280 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.26■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.26■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.25■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.24■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 PTPRMP28827 1452 aa22.24■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.24■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.23■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.23■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.22■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 MADDQ8WXG6 1647 aa22.22■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.21■■□□□ 1.15
GPN1-204ENST00000436280 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.2■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 TIAM1Q13009 1591 aa22.2■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.18■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.17■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 MLECQ14165 292 aa22.17■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 REREQ9P2R6 1566 aa22.16■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 NCOA2Q15596 1464 aa22.15■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GPN1-204ENST00000436280 ABCA6Q8N139 1617 aa22.13■■□□□ 1.13
GPN1-204ENST00000436280 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GPN1-204ENST00000436280 MAP3K1Q13233 1512 aa22.13■■□□□ 1.13
GPN1-204ENST00000436280 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.12■■□□□ 1.13
GPN1-204ENST00000436280 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.11■■□□□ 1.13
GPN1-204ENST00000436280 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.11■■□□□ 1.13
GPN1-204ENST00000436280 AGLP35573 1532 aa22.08■■□□□ 1.13
GPN1-204ENST00000436280 APLP2Q06481 763 aa22.08■■□□□ 1.13
GPN1-204ENST00000436280 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GPN1-204ENST00000436280 ATP7AQ04656 1500 aa22.06■■□□□ 1.12
GPN1-204ENST00000436280 MBD5Q9P267 1494 aa22.04■■□□□ 1.12
GPN1-204ENST00000436280 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.04■■□□□ 1.12
GPN1-204ENST00000436280 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
GPN1-204ENST00000436280 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.03■■□□□ 1.12
GPN1-204ENST00000436280 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.03■■□□□ 1.12
GPN1-204ENST00000436280 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
GPN1-204ENST00000436280 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GPN1-204ENST00000436280 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.99■■□□□ 1.11
GPN1-204ENST00000436280 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.99■■□□□ 1.11
GPN1-204ENST00000436280 A2MP01023 1474 aa21.98■■□□□ 1.11
GPN1-204ENST00000436280 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.97■■□□□ 1.11
GPN1-204ENST00000436280 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.96■■□□□ 1.11
GPN1-204ENST00000436280 PLXNC1O60486 1568 aa21.95■■□□□ 1.11
GPN1-204ENST00000436280 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.95■■□□□ 1.1
GPN1-204ENST00000436280 MIA2Q96PC5 1412 aa21.95■■□□□ 1.1
GPN1-204ENST00000436280 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.95■■□□□ 1.1
GPN1-204ENST00000436280 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.94■■□□□ 1.1
GPN1-204ENST00000436280 TSPY4P0CV99 314 aa21.93■■□□□ 1.1
GPN1-204ENST00000436280 TSPY10P0CW01 314 aa21.93■■□□□ 1.1
GPN1-204ENST00000436280 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
GPN1-204ENST00000436280 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GPN1-204ENST00000436280 GGT6Q6P531 493 aa21.87■■□□□ 1.09
GPN1-204ENST00000436280 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.87■■□□□ 1.09
GPN1-204ENST00000436280 C3P01024 1663 aa21.86■■□□□ 1.09
GPN1-204ENST00000436280 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.86■■□□□ 1.09
GPN1-204ENST00000436280 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.84■■□□□ 1.09
GPN1-204ENST00000436280 HSPA2P54652 639 aa21.84■■□□□ 1.09
GPN1-204ENST00000436280 MROH2AA6NES4 1674 aa21.84■■□□□ 1.09
GPN1-204ENST00000436280 ZMYM3Q14202 1370 aa21.83■■□□□ 1.08
GPN1-204ENST00000436280 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.82■■□□□ 1.08
GPN1-204ENST00000436280 KIF3BO15066 747 aa21.8■■□□□ 1.08
GPN1-204ENST00000436280 NPATQ14207 1427 aa21.8■■□□□ 1.08
GPN1-204ENST00000436280 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GPN1-204ENST00000436280 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
GPN1-204ENST00000436280 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.79■■□□□ 1.08
GPN1-204ENST00000436280 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.79■■□□□ 1.08
GPN1-204ENST00000436280 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.75■■□□□ 1.07
GPN1-204ENST00000436280 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
GPN1-204ENST00000436280 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.74■■□□□ 1.07
GPN1-204ENST00000436280 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.72■■□□□ 1.07
GPN1-204ENST00000436280 ABCC5O15440 1437 aa21.72■■□□□ 1.07
GPN1-204ENST00000436280 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.72■■□□□ 1.07
GPN1-204ENST00000436280 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.72■■□□□ 1.07
GPN1-204ENST00000436280 DAPK1P53355 1430 aa21.71■■□□□ 1.07
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