RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.29■■□□□ 1.8
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.29■■□□□ 1.8
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.29■■□□□ 1.8
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.28■■□□□ 1.8
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.27■■□□□ 1.8
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.25■■□□□ 1.79
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.24■■□□□ 1.79
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.23■■□□□ 1.79
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.22■■□□□ 1.79
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PREX2Q70Z35 1606 aa26.21■■□□□ 1.79
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AFAP1Q8N556 730 aa26.21■■□□□ 1.79
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.2■■□□□ 1.79
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.19■■□□□ 1.78
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.16■■□□□ 1.78
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PTPRMP28827 1452 aa26.15■■□□□ 1.78
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.15■■□□□ 1.78
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MADDQ8WXG6 1647 aa26.14■■□□□ 1.78
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KDM5CP41229 1560 aa26.13■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATP10AO60312 1499 aa26.12■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.12■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCC1P33527 1531 aa26.12■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.12■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.11■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.09■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MLECQ14165 292 aa26.08■■□□□ 1.77
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.07■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.07■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.04■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.03■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.02■■□□□ 1.76
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCA6Q8N139 1617 aa26■■□□□ 1.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.99■■□□□ 1.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.99■■□□□ 1.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TIAM1Q13009 1591 aa25.99■■□□□ 1.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.98■■□□□ 1.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.97■■□□□ 1.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.96■■□□□ 1.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.95■■□□□ 1.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 REREQ9P2R6 1566 aa25.94■■□□□ 1.74
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.92■■□□□ 1.74
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NCOA2Q15596 1464 aa25.91■■□□□ 1.74
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 AGLP35573 1532 aa25.87■■□□□ 1.73
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.86■■□□□ 1.73
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.85■■□□□ 1.73
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MBD5Q9P267 1494 aa25.85■■□□□ 1.73
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ATP7AQ04656 1500 aa25.84■■□□□ 1.73
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAP3K1Q13233 1512 aa25.81■■□□□ 1.72
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HSPA2P54652 639 aa25.77■■□□□ 1.72
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.77■■□□□ 1.72
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A2MP01023 1474 aa25.75■■□□□ 1.71
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLXNC1O60486 1568 aa25.73■■□□□ 1.71
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.71■■□□□ 1.71
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C3P01024 1663 aa25.71■■□□□ 1.71
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.7■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.69■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.69■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.67■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 APLP2Q06481 763 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GGT6Q6P531 493 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.65■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.65■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.64■■□□□ 1.7
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZMYM3Q14202 1370 aa25.62■■□□□ 1.69
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MIA2Q96PC5 1412 aa25.62■■□□□ 1.69
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TSPY4P0CV99 314 aa25.61■■□□□ 1.69
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TSPY10P0CW01 314 aa25.61■■□□□ 1.69
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MROH2AA6NES4 1674 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.59■■□□□ 1.69
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KIF3BO15066 747 aa25.56■■□□□ 1.68
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.55■■□□□ 1.68
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.52■■□□□ 1.68
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NPATQ14207 1427 aa25.51■■□□□ 1.67
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 STRCQ7RTU9 1775 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PTPRKQ15262 1439 aa25.49■■□□□ 1.67
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.48■■□□□ 1.67
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ABCC5O15440 1437 aa25.46■■□□□ 1.67
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.46■■□□□ 1.67
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.41■■□□□ 1.66
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms