RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		29.02	■■■□□ 2.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPA2	P54652	639 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MRPL28-203	ENST00000429738	PLCH2	O75038	1416 aa		29.01	■■■□□ 2.23
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		29	■■■□□ 2.23
MRPL28-203	ENST00000429738	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		29	■■■□□ 2.23
MRPL28-203	ENST00000429738	MLEC	Q14165	292 aa		28.99	■■■□□ 2.23
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
MRPL28-203	ENST00000429738	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.96	■■■□□ 2.23
MRPL28-203	ENST00000429738	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP10A	O60312	1499 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF14	Q15058	1648 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MRPL28-203	ENST00000429738	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MRPL28-203	ENST00000429738	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CLIP1	P30622	1438 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MRPL28-203	ENST00000429738	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MRPL28-203	ENST00000429738	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MRPL28-203	ENST00000429738	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MRPL28-203	ENST00000429738	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MRPL28-203	ENST00000429738	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MRPL28-203	ENST00000429738	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
MRPL28-203	ENST00000429738	KDM5C	P41229	1560 aa		28.7	■■■□□ 2.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MRPL28-203	ENST00000429738	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.68	■■■□□ 2.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MRPL28-203	ENST00000429738	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MRPL28-203	ENST00000429738	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MRPL28-203	ENST00000429738	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MRPL28-203	ENST00000429738	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MRPL28-203	ENST00000429738	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCC1	P33527	1531 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MRPL28-203	ENST00000429738	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MRPL28-203	ENST00000429738	AGL	P35573	1532 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
MRPL28-203	ENST00000429738	C3	P01024	1663 aa		28.51	■■■□□ 2.15
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPRT	O14522	1441 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.48	■■■□□ 2.15
MRPL28-203	ENST00000429738	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.47	■■■□□ 2.15
MRPL28-203	ENST00000429738	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.46	■■■□□ 2.15
MRPL28-203	ENST00000429738	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.45	■■■□□ 2.15
MRPL28-203	ENST00000429738	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.43	■■■□□ 2.14
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.41	■■■□□ 2.14
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.4	■■■□□ 2.14
MRPL28-203	ENST00000429738	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.4	■■■□□ 2.14
MRPL28-203	ENST00000429738	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.38	■■■□□ 2.13
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.38	■■■□□ 2.13
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.37	■■■□□ 2.13	3e-8	■■■□□ 15.8
MRPL28-203	ENST00000429738	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.36	■■■□□ 2.13
MRPL28-203	ENST00000429738	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
MRPL28-203	ENST00000429738	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.36	■■■□□ 2.13
MRPL28-203	ENST00000429738	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.35	■■■□□ 2.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.35	■■■□□ 2.13
MRPL28-203	ENST00000429738	NPAT	Q14207	1427 aa		28.34	■■■□□ 2.13
MRPL28-203	ENST00000429738	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.32	■■■□□ 2.12
MRPL28-203	ENST00000429738	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.32	■■■□□ 2.12
MRPL28-203	ENST00000429738	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.29	■■■□□ 2.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.29	■■■□□ 2.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
MRPL28-203	ENST00000429738	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
MRPL28-203	ENST00000429738	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.27	■■■□□ 2.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.26	■■■□□ 2.11
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.26	■■■□□ 2.11
MRPL28-203	ENST00000429738	NCOA2	Q15596	1464 aa		28.25	■■■□□ 2.11
MRPL28-203	ENST00000429738	MBD5	Q9P267	1494 aa		28.24	■■■□□ 2.11
MRPL28-203	ENST00000429738	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.23	■■■□□ 2.11
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
MRPL28-203	ENST00000429738	A2M	P01023	1474 aa		28.22	■■■□□ 2.11
MRPL28-203	ENST00000429738	SOCS7	O14512	581 aa		28.21	■■■□□ 2.11
MRPL28-203	ENST00000429738	GGT6	Q6P531	493 aa		28.21	■■■□□ 2.11
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.2	■■■□□ 2.1
MRPL28-203	ENST00000429738	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.2	■■■□□ 2.1
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.19	■■■□□ 2.1
MRPL28-203	ENST00000429738	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K1	Q13233	1512 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MRPL28-203	ENST00000429738	PKD2	Q13563	968 aa		28.18	■■■□□ 2.1
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.17	■■■□□ 2.1
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.14	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.13	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		28.12	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.1	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.1	■■■□□ 2.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms