RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429295.1

MRPL23-206, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL23, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-206ENST00000429295 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.45■■■■□ 3.27
MRPL23-206ENST00000429295 KIF14Q15058 1648 aa35.43■■■■□ 3.26
MRPL23-206ENST00000429295 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
MRPL23-206ENST00000429295 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.42■■■■□ 3.26
MRPL23-206ENST00000429295 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.42■■■■□ 3.26
MRPL23-206ENST00000429295 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.41■■■■□ 3.26
MRPL23-206ENST00000429295 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
MRPL23-206ENST00000429295 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.4■■■■□ 3.26
MRPL23-206ENST00000429295 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.39■■■■□ 3.26
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.39■■■■□ 3.26
MRPL23-206ENST00000429295 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.36■■■■□ 3.25
MRPL23-206ENST00000429295 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.35■■■■□ 3.25
MRPL23-206ENST00000429295 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.34■■■■□ 3.25
MRPL23-206ENST00000429295 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.33■■■■□ 3.25
MRPL23-206ENST00000429295 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.32■■■■□ 3.24
MRPL23-206ENST00000429295 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.3■■■■□ 3.24
MRPL23-206ENST00000429295 MLECQ14165 292 aa35.29■■■■□ 3.24
MRPL23-206ENST00000429295 ATP10AO60312 1499 aa35.23■■■■□ 3.23
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.23■■■■□ 3.23
MRPL23-206ENST00000429295 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.23■■■■□ 3.23
MRPL23-206ENST00000429295 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.22■■■■□ 3.23
MRPL23-206ENST00000429295 CEP162Q5TB80 1403 aa35.21■■■■□ 3.23
MRPL23-206ENST00000429295 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.18■■■■□ 3.22
MRPL23-206ENST00000429295 PREX2Q70Z35 1606 aa35.16■■■■□ 3.22
MRPL23-206ENST00000429295 KDM5CP41229 1560 aa35.16■■■■□ 3.22
MRPL23-206ENST00000429295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.14■■■■□ 3.22
MRPL23-206ENST00000429295 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.13■■■■□ 3.21
MRPL23-206ENST00000429295 HSPA2P54652 639 aa35.11■■■■□ 3.21
MRPL23-206ENST00000429295 FBXO41Q8TF61 875 aa35.11■■■■□ 3.21
MRPL23-206ENST00000429295 AFAP1Q8N556 730 aa35.1■■■■□ 3.21
MRPL23-206ENST00000429295 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.07■■■■□ 3.2
MRPL23-206ENST00000429295 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.07■■■■□ 3.2
MRPL23-206ENST00000429295 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.06■■■■□ 3.2
MRPL23-206ENST00000429295 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.05■■■■□ 3.2
MRPL23-206ENST00000429295 ABCC1P33527 1531 aa35.05■■■■□ 3.2
MRPL23-206ENST00000429295 ABCA6Q8N139 1617 aa35.04■■■■□ 3.2
MRPL23-206ENST00000429295 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.02■■■■□ 3.2
MRPL23-206ENST00000429295 REREQ9P2R6 1566 aa34.99■■■■□ 3.19
MRPL23-206ENST00000429295 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.98■■■■□ 3.19
MRPL23-206ENST00000429295 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.96■■■■□ 3.19
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
MRPL23-206ENST00000429295 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
MRPL23-206ENST00000429295 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
MRPL23-206ENST00000429295 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.92■■■■□ 3.18
MRPL23-206ENST00000429295 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.91■■■■□ 3.18
MRPL23-206ENST00000429295 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
MRPL23-206ENST00000429295 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
MRPL23-206ENST00000429295 C3P01024 1663 aa34.87■■■■□ 3.17
MRPL23-206ENST00000429295 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
MRPL23-206ENST00000429295 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.86■■■■□ 3.17
MRPL23-206ENST00000429295 AGLP35573 1532 aa34.86■■■■□ 3.17
MRPL23-206ENST00000429295 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.86■■■■□ 3.17
MRPL23-206ENST00000429295 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.84■■■■□ 3.17
MRPL23-206ENST00000429295 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.83■■■■□ 3.17
MRPL23-206ENST00000429295 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.82■■■■□ 3.17
MRPL23-206ENST00000429295 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.81■■■■□ 3.16
MRPL23-206ENST00000429295 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.78■■■■□ 3.16
MRPL23-206ENST00000429295 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.78■■■■□ 3.16
MRPL23-206ENST00000429295 STRCQ7RTU9 1775 aa34.76■■■■□ 3.15
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MRPL23-206ENST00000429295 TIAM1Q13009 1591 aa34.72■■■■□ 3.15
MRPL23-206ENST00000429295 CERKQ8TCT0 537 aa34.72■■■■□ 3.15
MRPL23-206ENST00000429295 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.71■■■■□ 3.15
MRPL23-206ENST00000429295 ATP7AQ04656 1500 aa34.7■■■■□ 3.14
MRPL23-206ENST00000429295 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.69■■■■□ 3.14
MRPL23-206ENST00000429295 MROH2AA6NES4 1674 aa34.67■■■■□ 3.14
MRPL23-206ENST00000429295 NCOA2Q15596 1464 aa34.67■■■■□ 3.14
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
MRPL23-206ENST00000429295 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
MRPL23-206ENST00000429295 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.62■■■■□ 3.13
MRPL23-206ENST00000429295 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
MRPL23-206ENST00000429295 MAP3K1Q13233 1512 aa34.58■■■■□ 3.13
MRPL23-206ENST00000429295 PLXNC1O60486 1568 aa34.57■■■■□ 3.13
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MRPL23-206ENST00000429295 A2MP01023 1474 aa34.57■■■■□ 3.12
MRPL23-206ENST00000429295 MBD5Q9P267 1494 aa34.57■■■■□ 3.12
MRPL23-206ENST00000429295 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
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MRPL23-206ENST00000429295 NPATQ14207 1427 aa34.51■■■■□ 3.12
MRPL23-206ENST00000429295 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.51■■■■□ 3.12
MRPL23-206ENST00000429295 ZMYM3Q14202 1370 aa34.5■■■■□ 3.11
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MRPL23-206ENST00000429295 GGT6Q6P531 493 aa34.46■■■■□ 3.11
MRPL23-206ENST00000429295 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.46■■■■□ 3.11
MRPL23-206ENST00000429295 NCOA1Q15788 1441 aa34.46■■■■□ 3.11
MRPL23-206ENST00000429295 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.45■■■■□ 3.11
MRPL23-206ENST00000429295 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.44■■■■□ 3.1
MRPL23-206ENST00000429295 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.43■■■■□ 3.1
MRPL23-206ENST00000429295 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
MRPL23-206ENST00000429295 TSPY4P0CV99 314 aa34.37■■■■□ 3.09
MRPL23-206ENST00000429295 TSPY10P0CW01 314 aa34.37■■■■□ 3.09
MRPL23-206ENST00000429295 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.35■■■■□ 3.09
MRPL23-206ENST00000429295 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
MRPL23-206ENST00000429295 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
MRPL23-206ENST00000429295 PTPRKQ15262 1439 aa34.33■■■■□ 3.09
MRPL23-206ENST00000429295 MIA2Q96PC5 1412 aa34.33■■■■□ 3.09
MRPL23-206ENST00000429295 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.32■■■■□ 3.09
MRPL23-206ENST00000429295 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.32■■■■□ 3.08
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